FuNGI

M2YNQ0

Protein Details

Accession

M2YNQ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
393-413	DRDRREREQKRADQRNEERRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
224-240	PKHKIKKVPRGPPSPPP
342-365	QKARADREAAKAPRRDSDRGRSRS
395-408	DRREREQKRADQRN
411-412	RR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0060090 F:molecular adaptor activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MATRLALSNALPKPKYTGQDEELPTHTQQKGPRVVNAADIESQQLVVKRSGPPAYGQRSGWRPRNAEDYGDGGAFPEIPMAQYPLDMGRKGQPSSSNALAIQVDNEGKVKYDAIARRGHNETRIVHASFKDLIPLRQRADVGDISLERPSEEEVQASKERTQKALQSLVDGTLAAQKPKNVKGTTRPEPTFVRYTPANQMGDNGKKQDRIMKIVQRQQDPMEPPKHKIKKVPRGPPSPPPPIMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALHTADRHAREEVQQRQKMQQRLAEKEKEAKEEHLRELAQKARADREAAKAPRRDSDRGRSRSRSVDSRSSYDSRSSYSSRSRSRSADGGDRDRREREQKRADQRNEERRALRQKNMGHERRMQMMAREQNRDVSEKVALGLAKPTQNKEAMYDSRLFNQSSGMAAGFNEDQPYDKPLFAERDALNSIYRPSVGEDEDEDGGETLEKIQGTKRFDTLGRAPKEGFKGTETAEARSGPVMFERERKDDPFGVEAMIDAASKGAKRAAEDDSGGKGKRARVDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.47
3	0.45
4	0.48
5	0.44
6	0.53
7	0.55
8	0.52
9	0.49
10	0.47
11	0.42
12	0.42
13	0.39
14	0.34
15	0.36
16	0.41
17	0.48
18	0.47
19	0.51
20	0.49
21	0.48
22	0.51
23	0.48
24	0.41
25	0.34
26	0.31
27	0.28
28	0.22
29	0.22
30	0.17
31	0.18
32	0.17
33	0.17
34	0.21
35	0.23
36	0.28
37	0.31
38	0.3
39	0.32
40	0.39
41	0.44
42	0.45
43	0.43
44	0.45
45	0.51
46	0.58
47	0.62
48	0.6
49	0.57
50	0.56
51	0.63
52	0.57
53	0.51
54	0.45
55	0.39
56	0.33
57	0.29
58	0.25
59	0.17
60	0.16
61	0.13
62	0.1
63	0.08
64	0.06
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.1
71	0.14
72	0.17
73	0.17
74	0.18
75	0.23
76	0.28
77	0.29
78	0.32
79	0.32
80	0.33
81	0.38
82	0.38
83	0.33
84	0.28
85	0.3
86	0.27
87	0.22
88	0.19
89	0.16
90	0.14
91	0.12
92	0.14
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.11
98	0.18
99	0.21
100	0.25
101	0.32
102	0.32
103	0.38
104	0.42
105	0.44
106	0.41
107	0.42
108	0.39
109	0.39
110	0.42
111	0.38
112	0.35
113	0.33
114	0.32
115	0.28
116	0.27
117	0.26
118	0.23
119	0.26
120	0.3
121	0.34
122	0.33
123	0.34
124	0.34
125	0.29
126	0.32
127	0.28
128	0.22
129	0.2
130	0.19
131	0.16
132	0.17
133	0.16
134	0.11
135	0.11
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.19
142	0.22
143	0.24
144	0.26
145	0.28
146	0.3
147	0.31
148	0.33
149	0.33
150	0.35
151	0.4
152	0.36
153	0.33
154	0.32
155	0.29
156	0.26
157	0.21
158	0.16
159	0.16
160	0.17
161	0.15
162	0.16
163	0.18
164	0.23
165	0.28
166	0.35
167	0.3
168	0.34
169	0.42
170	0.5
171	0.56
172	0.6
173	0.56
174	0.52
175	0.54
176	0.54
177	0.5
178	0.41
179	0.36
180	0.29
181	0.31
182	0.33
183	0.35
184	0.31
185	0.26
186	0.28
187	0.3
188	0.34
189	0.33
190	0.31
191	0.28
192	0.29
193	0.3
194	0.34
195	0.31
196	0.32
197	0.37
198	0.41
199	0.46
200	0.51
201	0.56
202	0.51
203	0.5
204	0.46
205	0.45
206	0.41
207	0.41
208	0.43
209	0.39
210	0.41
211	0.49
212	0.55
213	0.52
214	0.57
215	0.6
216	0.62
217	0.7
218	0.76
219	0.74
220	0.75
221	0.76
222	0.76
223	0.73
224	0.69
225	0.63
226	0.55
227	0.51
228	0.49
229	0.49
230	0.49
231	0.5
232	0.47
233	0.48
234	0.51
235	0.46
236	0.42
237	0.42
238	0.41
239	0.4
240	0.36
241	0.34
242	0.32
243	0.32
244	0.3
245	0.28
246	0.21
247	0.16
248	0.18
249	0.19
250	0.28
251	0.3
252	0.38
253	0.42
254	0.47
255	0.52
256	0.49
257	0.49
258	0.42
259	0.41
260	0.38
261	0.4
262	0.38
263	0.38
264	0.39
265	0.35
266	0.33
267	0.32
268	0.28
269	0.2
270	0.17
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.13
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.12
295	0.13
296	0.12
297	0.11
298	0.12
299	0.17
300	0.25
301	0.34
302	0.41
303	0.43
304	0.43
305	0.49
306	0.55
307	0.54
308	0.5
309	0.45
310	0.41
311	0.46
312	0.51
313	0.48
314	0.43
315	0.46
316	0.45
317	0.45
318	0.39
319	0.37
320	0.38
321	0.37
322	0.37
323	0.33
324	0.31
325	0.28
326	0.31
327	0.31
328	0.28
329	0.26
330	0.26
331	0.26
332	0.27
333	0.28
334	0.26
335	0.27
336	0.31
337	0.34
338	0.39
339	0.4
340	0.4
341	0.43
342	0.46
343	0.46
344	0.44
345	0.49
346	0.53
347	0.56
348	0.62
349	0.61
350	0.6
351	0.62
352	0.6
353	0.57
354	0.53
355	0.55
356	0.51
357	0.49
358	0.51
359	0.46
360	0.43
361	0.39
362	0.34
363	0.27
364	0.28
365	0.27
366	0.26
367	0.32
368	0.38
369	0.42
370	0.45
371	0.48
372	0.46
373	0.48
374	0.48
375	0.43
376	0.43
377	0.42
378	0.46
379	0.49
380	0.5
381	0.49
382	0.48
383	0.49
384	0.52
385	0.53
386	0.54
387	0.57
388	0.63
389	0.71
390	0.78
391	0.79
392	0.79
393	0.82
394	0.83
395	0.79
396	0.76
397	0.67
398	0.65
399	0.7
400	0.65
401	0.61
402	0.58
403	0.55
404	0.6
405	0.68
406	0.66
407	0.6
408	0.62
409	0.59
410	0.57
411	0.55
412	0.46
413	0.39
414	0.41
415	0.44
416	0.42
417	0.44
418	0.39
419	0.41
420	0.42
421	0.42
422	0.34
423	0.28
424	0.24
425	0.2
426	0.2
427	0.16
428	0.15
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.19
433	0.21
434	0.23
435	0.24
436	0.27
437	0.27
438	0.27
439	0.31
440	0.29
441	0.3
442	0.32
443	0.3
444	0.33
445	0.35
446	0.32
447	0.25
448	0.24
449	0.21
450	0.18
451	0.17
452	0.12
453	0.09
454	0.09
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.11
461	0.12
462	0.16
463	0.16
464	0.15
465	0.16
466	0.2
467	0.24
468	0.24
469	0.3
470	0.26
471	0.29
472	0.3
473	0.3
474	0.27
475	0.23
476	0.23
477	0.17
478	0.17
479	0.13
480	0.14
481	0.17
482	0.17
483	0.17
484	0.17
485	0.19
486	0.19
487	0.18
488	0.16
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.09
493	0.07
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.14
498	0.2
499	0.25
500	0.28
501	0.29
502	0.3
503	0.32
504	0.38
505	0.42
506	0.46
507	0.45
508	0.45
509	0.44
510	0.46
511	0.51
512	0.47
513	0.4
514	0.32
515	0.32
516	0.31
517	0.38
518	0.34
519	0.31
520	0.3
521	0.28
522	0.27
523	0.26
524	0.24
525	0.16
526	0.18
527	0.2
528	0.2
529	0.27
530	0.32
531	0.36
532	0.4
533	0.43
534	0.46
535	0.45
536	0.46
537	0.42
538	0.37
539	0.31
540	0.26
541	0.23
542	0.18
543	0.14
544	0.1
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.12
551	0.13
552	0.16
553	0.19
554	0.23
555	0.25
556	0.27
557	0.29
558	0.32
559	0.36
560	0.34
561	0.34
562	0.34
563	0.35
564	0.4

M2YNQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer