Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PPG6

Protein Details
Accession N1PPG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-266QPQRRTARYRSPPPPRPRSNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-162RGGFRGRGRGRGRGRGGRYDERGS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MTVSEAMDAVEEGEVGPDEILPTKIHIEGIESLTTNDIENFANDNFQTDALVKIEWVHDNSANIVYRTSDAATEALRQLATEHPEDPLALRPAAKLLTNPHVELFVRRATSADVKKRGAARESRFYLVNPQYDPENRIRGGFRGRGRGRGRGRGGRYDERGSRRSSGASESFDVDLYDDNPQAKAAIAERRAGTRLEEDLLAARQARRTSRQEEDLVSSKRDGRLRNRSASPMRDGDGRYGFSDDQPQRRTARYRSPPPPRPRSNTDNYGARDSIRTELFPNRKSGAALANGRSKAPVELFPNRALSPASSKVDLFANKLNKRQQDVHPNDIANAIDRRSTHRDTESKPRDLFSRIDGGRGLSLKPKGGILSEANESDSGFSIKGAGGIKDLNVRGASRIAPPVRELLPDRGSAKPDLFPNKARGGLRRRQAEDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.14
14 0.16
15 0.19
16 0.21
17 0.21
18 0.19
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.17
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.11
41 0.14
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.22
48 0.25
49 0.24
50 0.21
51 0.2
52 0.17
53 0.17
54 0.18
55 0.17
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.18
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.17
84 0.24
85 0.26
86 0.26
87 0.25
88 0.26
89 0.26
90 0.25
91 0.24
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.27
98 0.33
99 0.38
100 0.41
101 0.41
102 0.45
103 0.49
104 0.5
105 0.48
106 0.49
107 0.46
108 0.5
109 0.52
110 0.5
111 0.46
112 0.42
113 0.45
114 0.41
115 0.39
116 0.3
117 0.27
118 0.29
119 0.3
120 0.34
121 0.29
122 0.29
123 0.26
124 0.28
125 0.28
126 0.27
127 0.31
128 0.34
129 0.34
130 0.39
131 0.4
132 0.47
133 0.49
134 0.55
135 0.54
136 0.56
137 0.59
138 0.57
139 0.59
140 0.58
141 0.62
142 0.59
143 0.58
144 0.55
145 0.55
146 0.53
147 0.52
148 0.47
149 0.43
150 0.37
151 0.34
152 0.3
153 0.28
154 0.25
155 0.25
156 0.23
157 0.22
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.13
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.14
174 0.15
175 0.17
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.18
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.12
193 0.15
194 0.2
195 0.24
196 0.29
197 0.31
198 0.35
199 0.34
200 0.34
201 0.35
202 0.35
203 0.32
204 0.28
205 0.25
206 0.23
207 0.25
208 0.28
209 0.29
210 0.31
211 0.4
212 0.45
213 0.5
214 0.5
215 0.52
216 0.53
217 0.51
218 0.46
219 0.37
220 0.33
221 0.31
222 0.29
223 0.26
224 0.24
225 0.22
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.15
230 0.23
231 0.24
232 0.28
233 0.3
234 0.32
235 0.32
236 0.36
237 0.41
238 0.37
239 0.44
240 0.46
241 0.54
242 0.6
243 0.69
244 0.74
245 0.79
246 0.84
247 0.81
248 0.79
249 0.76
250 0.74
251 0.71
252 0.67
253 0.62
254 0.59
255 0.53
256 0.5
257 0.43
258 0.36
259 0.3
260 0.25
261 0.24
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.23
266 0.29
267 0.3
268 0.32
269 0.3
270 0.3
271 0.3
272 0.29
273 0.25
274 0.24
275 0.26
276 0.26
277 0.31
278 0.3
279 0.3
280 0.29
281 0.25
282 0.21
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.25
287 0.28
288 0.3
289 0.32
290 0.31
291 0.3
292 0.26
293 0.21
294 0.2
295 0.23
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.22
300 0.26
301 0.25
302 0.23
303 0.24
304 0.31
305 0.34
306 0.4
307 0.46
308 0.46
309 0.5
310 0.54
311 0.55
312 0.57
313 0.6
314 0.6
315 0.58
316 0.54
317 0.49
318 0.44
319 0.37
320 0.29
321 0.24
322 0.18
323 0.15
324 0.16
325 0.22
326 0.28
327 0.31
328 0.32
329 0.38
330 0.45
331 0.47
332 0.58
333 0.59
334 0.6
335 0.58
336 0.55
337 0.5
338 0.46
339 0.43
340 0.36
341 0.37
342 0.3
343 0.31
344 0.29
345 0.28
346 0.27
347 0.27
348 0.24
349 0.21
350 0.23
351 0.23
352 0.23
353 0.23
354 0.21
355 0.2
356 0.23
357 0.19
358 0.2
359 0.21
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.19
364 0.16
365 0.15
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.2
378 0.21
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.2
383 0.22
384 0.22
385 0.2
386 0.28
387 0.28
388 0.28
389 0.29
390 0.32
391 0.31
392 0.34
393 0.34
394 0.34
395 0.34
396 0.37
397 0.39
398 0.38
399 0.39
400 0.38
401 0.36
402 0.33
403 0.38
404 0.41
405 0.44
406 0.45
407 0.48
408 0.5
409 0.54
410 0.53
411 0.55
412 0.56
413 0.59
414 0.63
415 0.66
416 0.66