Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PGW4

Protein Details
Accession N1PGW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-194RLANTQGKKAKRKARERQLEESRRMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-202GKKAKRKARERQLEESRRMAVLQKRRE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047242  CDC5L/Cef1  
IPR021786  Cdc5p/Cef1_C  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR047240  SANT_CDC5L_II  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0140602  C:nucleolar ring  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF11831  Myb_Cef  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
cd11659  SANT_CDC5_II  
Amino Acid Sequences MPVVKGGVWTNIEDEILKAAVSKYGLNQWARVSSLLARKTAKQCKARWAEWLDPGIRKIEWSREEDEKLLHLAKLMPTQWRTIAPIVGRTATQCLERYQKLLDEAEARETAAELGLAGPEGGETQAPSADDVRKLRPGELDPDPESKPARPDTIDMDEDEKEMLSEARARLANTQGKKAKRKARERQLEESRRMAVLQKRRELKSAGINVKVTTKKKGQMDYNADIPFEHAPAAGFYDTQDEKAQNEHDREMFDPRKQQLANKRKADGQDDQGQEAKRKKNDKNDSGASAFAAAAKAGQQQRLREAEQSSKRRGLVLPAPQVSEGEMEDIVKMGLSGERLHSQAGEGGLVSRYESTVGATPIRTPRAPQEEDRIANELRNARARTATQSALLGGENTDLAEDNATTGYGGVAPSKQAMATPNPMATPLRQNGATKGVGATPMRTPRDNFRLNQETGAMELVGQTPRDVRLREHAQRSNLRHKLASLPKPQQTEWELEAMPEDQAESPSSAMELSEEDAAERDRRNAELAKAAALADFRRQTKVVQKGLPRPTVVDIDAMLKNARDILDPIERSIAEEAARLMAHDASRFGGAKTKGKTKPYQHPEEEALQRAQMEVILEMGHDTDRAQFGQAFELEWKQAHDSTILLGLAGYAEDELDEEQLLTEAFDNIQDAITKTSDRGNSLEKKLAKHHGGYIERQKKLKAKIQEASEALAKTRLDVHAARQAQVAEEAGIQGRLEKLRDEVALVSRREREAQQAFREKRDELEALQNTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.22
12 0.29
13 0.29
14 0.32
15 0.32
16 0.34
17 0.34
18 0.32
19 0.27
20 0.27
21 0.33
22 0.34
23 0.36
24 0.36
25 0.42
26 0.52
27 0.59
28 0.62
29 0.63
30 0.65
31 0.7
32 0.76
33 0.7
34 0.69
35 0.67
36 0.64
37 0.61
38 0.63
39 0.56
40 0.5
41 0.5
42 0.43
43 0.36
44 0.33
45 0.3
46 0.33
47 0.34
48 0.36
49 0.39
50 0.43
51 0.46
52 0.45
53 0.42
54 0.35
55 0.34
56 0.31
57 0.26
58 0.21
59 0.21
60 0.22
61 0.26
62 0.26
63 0.3
64 0.3
65 0.32
66 0.34
67 0.33
68 0.33
69 0.3
70 0.32
71 0.27
72 0.3
73 0.29
74 0.28
75 0.26
76 0.24
77 0.25
78 0.22
79 0.23
80 0.2
81 0.23
82 0.29
83 0.31
84 0.31
85 0.3
86 0.32
87 0.32
88 0.32
89 0.3
90 0.27
91 0.26
92 0.28
93 0.26
94 0.23
95 0.19
96 0.18
97 0.15
98 0.11
99 0.09
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.12
116 0.15
117 0.2
118 0.23
119 0.26
120 0.31
121 0.32
122 0.33
123 0.35
124 0.34
125 0.35
126 0.38
127 0.4
128 0.37
129 0.4
130 0.39
131 0.37
132 0.37
133 0.33
134 0.33
135 0.3
136 0.31
137 0.28
138 0.29
139 0.32
140 0.35
141 0.34
142 0.3
143 0.3
144 0.26
145 0.25
146 0.23
147 0.17
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.11
153 0.11
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.28
159 0.34
160 0.32
161 0.41
162 0.43
163 0.5
164 0.59
165 0.65
166 0.66
167 0.69
168 0.78
169 0.8
170 0.84
171 0.87
172 0.85
173 0.86
174 0.88
175 0.87
176 0.8
177 0.72
178 0.63
179 0.52
180 0.46
181 0.41
182 0.38
183 0.38
184 0.42
185 0.46
186 0.52
187 0.53
188 0.56
189 0.53
190 0.5
191 0.5
192 0.51
193 0.48
194 0.44
195 0.43
196 0.4
197 0.45
198 0.47
199 0.4
200 0.36
201 0.37
202 0.4
203 0.44
204 0.5
205 0.5
206 0.53
207 0.59
208 0.56
209 0.57
210 0.51
211 0.45
212 0.38
213 0.34
214 0.25
215 0.17
216 0.14
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.16
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.21
232 0.21
233 0.24
234 0.24
235 0.24
236 0.25
237 0.25
238 0.32
239 0.31
240 0.29
241 0.33
242 0.33
243 0.38
244 0.37
245 0.42
246 0.44
247 0.51
248 0.57
249 0.55
250 0.56
251 0.53
252 0.56
253 0.55
254 0.49
255 0.44
256 0.43
257 0.39
258 0.38
259 0.38
260 0.36
261 0.36
262 0.38
263 0.39
264 0.38
265 0.45
266 0.5
267 0.57
268 0.67
269 0.68
270 0.69
271 0.66
272 0.63
273 0.56
274 0.49
275 0.38
276 0.29
277 0.22
278 0.14
279 0.1
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.11
284 0.12
285 0.17
286 0.19
287 0.21
288 0.26
289 0.29
290 0.3
291 0.28
292 0.29
293 0.33
294 0.4
295 0.44
296 0.44
297 0.44
298 0.43
299 0.41
300 0.39
301 0.35
302 0.32
303 0.34
304 0.35
305 0.33
306 0.33
307 0.31
308 0.31
309 0.26
310 0.2
311 0.13
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.14
349 0.17
350 0.16
351 0.15
352 0.2
353 0.27
354 0.3
355 0.29
356 0.33
357 0.36
358 0.37
359 0.37
360 0.34
361 0.26
362 0.24
363 0.25
364 0.21
365 0.18
366 0.22
367 0.21
368 0.19
369 0.21
370 0.21
371 0.22
372 0.23
373 0.21
374 0.16
375 0.16
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.09
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.08
405 0.09
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.15
411 0.14
412 0.14
413 0.17
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.18
418 0.18
419 0.22
420 0.21
421 0.15
422 0.15
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.2
429 0.22
430 0.22
431 0.23
432 0.27
433 0.36
434 0.39
435 0.36
436 0.38
437 0.42
438 0.42
439 0.41
440 0.35
441 0.26
442 0.23
443 0.22
444 0.13
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.1
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.21
457 0.3
458 0.36
459 0.44
460 0.46
461 0.5
462 0.56
463 0.61
464 0.63
465 0.6
466 0.55
467 0.47
468 0.44
469 0.46
470 0.48
471 0.5
472 0.47
473 0.5
474 0.53
475 0.55
476 0.54
477 0.5
478 0.43
479 0.39
480 0.32
481 0.28
482 0.23
483 0.2
484 0.21
485 0.16
486 0.14
487 0.09
488 0.09
489 0.06
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.1
507 0.1
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.17
512 0.19
513 0.19
514 0.22
515 0.22
516 0.2
517 0.19
518 0.18
519 0.16
520 0.14
521 0.13
522 0.13
523 0.17
524 0.17
525 0.19
526 0.2
527 0.22
528 0.3
529 0.38
530 0.4
531 0.42
532 0.48
533 0.54
534 0.61
535 0.62
536 0.54
537 0.46
538 0.43
539 0.39
540 0.33
541 0.24
542 0.18
543 0.18
544 0.18
545 0.17
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.12
551 0.09
552 0.09
553 0.13
554 0.2
555 0.2
556 0.21
557 0.22
558 0.21
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.12
575 0.13
576 0.12
577 0.17
578 0.2
579 0.26
580 0.29
581 0.38
582 0.42
583 0.48
584 0.56
585 0.58
586 0.66
587 0.68
588 0.74
589 0.68
590 0.67
591 0.64
592 0.63
593 0.58
594 0.51
595 0.43
596 0.34
597 0.3
598 0.25
599 0.21
600 0.15
601 0.11
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.06
611 0.08
612 0.09
613 0.1
614 0.11
615 0.13
616 0.13
617 0.17
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.17
622 0.16
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.16
627 0.16
628 0.15
629 0.13
630 0.13
631 0.15
632 0.14
633 0.11
634 0.09
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.11
661 0.12
662 0.13
663 0.13
664 0.19
665 0.21
666 0.22
667 0.24
668 0.3
669 0.37
670 0.41
671 0.48
672 0.46
673 0.47
674 0.52
675 0.58
676 0.54
677 0.49
678 0.51
679 0.52
680 0.53
681 0.57
682 0.61
683 0.61
684 0.62
685 0.61
686 0.62
687 0.6
688 0.64
689 0.64
690 0.63
691 0.63
692 0.65
693 0.67
694 0.68
695 0.62
696 0.56
697 0.52
698 0.43
699 0.35
700 0.32
701 0.27
702 0.2
703 0.23
704 0.21
705 0.22
706 0.23
707 0.27
708 0.32
709 0.34
710 0.34
711 0.32
712 0.31
713 0.27
714 0.27
715 0.23
716 0.15
717 0.13
718 0.13
719 0.12
720 0.12
721 0.1
722 0.11
723 0.13
724 0.15
725 0.16
726 0.16
727 0.18
728 0.21
729 0.22
730 0.22
731 0.21
732 0.27
733 0.33
734 0.33
735 0.36
736 0.36
737 0.38
738 0.4
739 0.39
740 0.41
741 0.43
742 0.5
743 0.55
744 0.62
745 0.63
746 0.66
747 0.68
748 0.59
749 0.53
750 0.51
751 0.44
752 0.37
753 0.43