Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PFN6

Protein Details
Accession N1PFN6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-431ESSGPGRRDSVRRRRGRQGGSGAKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-427RRDSVRRRRGRQGGS
Subcellular Location(s) plas 17, mito 2, cyto 2, extr 2, E.R. 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009617  Seipin  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0140042  P:lipid droplet formation  
GO:0006629  P:lipid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF06775  Seipin  
Amino Acid Sequences MSSRRSSRDAEDEPRGLIFSLVALVKDAILAPIRPFVSRTALRAYLTTLLAIVTALVLLGFAVTAYILFYWQYIPRVGFERTIHLQFDSVYTNRITSHFPYGSASLGNEIMSGQGYDVVIELDMPRTKDNAEAGNFMVELNMYGSSSRSNAGMPQSGIAGTPTSLSDNDALLLATSRRPAILPYRSHWIDLVHKGIELPWYILCLRSESNTLRIPIFEEVNFAQGTKNAPASMRLEIQSTHRLQIYSAKALFRVRFAFPSLKWAMYNHRLISAFVFISTFWMTELVFFGLAWGALASYLQQSDAGKIKAEKIGPGSTAKKIKQEEDDEEEDEEPAKLSDTERTFPTLTGQAPLRYSSPAEREIKREPGLEHETIAVPEAAARAADADVEDEDEDVDFFDSGIGTSLESSGPGRRDSVRRRRGRQGGSGAKVKQEGHDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.41
3 0.32
4 0.25
5 0.17
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.12
18 0.12
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.2
24 0.27
25 0.28
26 0.3
27 0.32
28 0.34
29 0.34
30 0.33
31 0.33
32 0.29
33 0.27
34 0.23
35 0.16
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.08
40 0.04
41 0.04
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.04
56 0.05
57 0.08
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.15
62 0.17
63 0.21
64 0.23
65 0.25
66 0.24
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.32
71 0.28
72 0.27
73 0.22
74 0.23
75 0.21
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.26
85 0.24
86 0.24
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.21
91 0.19
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.19
123 0.16
124 0.14
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.08
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.16
168 0.23
169 0.24
170 0.26
171 0.34
172 0.34
173 0.34
174 0.33
175 0.28
176 0.26
177 0.26
178 0.26
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.12
185 0.1
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.14
195 0.13
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.17
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.21
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.25
232 0.25
233 0.23
234 0.23
235 0.22
236 0.22
237 0.26
238 0.26
239 0.21
240 0.21
241 0.18
242 0.18
243 0.2
244 0.22
245 0.19
246 0.26
247 0.25
248 0.23
249 0.22
250 0.23
251 0.26
252 0.28
253 0.32
254 0.25
255 0.27
256 0.27
257 0.27
258 0.26
259 0.22
260 0.16
261 0.12
262 0.12
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.21
296 0.22
297 0.21
298 0.21
299 0.22
300 0.22
301 0.26
302 0.27
303 0.29
304 0.35
305 0.35
306 0.39
307 0.4
308 0.42
309 0.44
310 0.47
311 0.46
312 0.46
313 0.47
314 0.41
315 0.4
316 0.36
317 0.29
318 0.24
319 0.18
320 0.12
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.15
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.25
330 0.25
331 0.24
332 0.27
333 0.24
334 0.22
335 0.23
336 0.24
337 0.23
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.2
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.3
346 0.35
347 0.36
348 0.41
349 0.45
350 0.5
351 0.47
352 0.46
353 0.4
354 0.41
355 0.45
356 0.4
357 0.35
358 0.3
359 0.28
360 0.25
361 0.25
362 0.17
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.1
396 0.14
397 0.16
398 0.17
399 0.2
400 0.26
401 0.36
402 0.46
403 0.56
404 0.61
405 0.69
406 0.76
407 0.83
408 0.87
409 0.85
410 0.83
411 0.83
412 0.82
413 0.79
414 0.79
415 0.7
416 0.65
417 0.61
418 0.53
419 0.47