Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTF9

Protein Details
Accession B0CTF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-397VNNKSNSTSRKKIPEPCNRWNEGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305112  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MATSNDTLNTPIPSDPSQSVLGNEQGPNQNQGDQELREEGQPQIQDQNPEQDDNEQDDPSLPGNFPAANAVLASCNSVLEDFRSSRIPKATALSRIYTHLLDGIPDNDNSFASTVEEAFARYLTIVENHQHHLREAEHRGGRRQRSKTPPDNHVERGNPGPDNDQSPHKRAKPDEAQYPWIISDFIHRVTLSPSLTSTLELLKLYAIDPKGMKRSLVNSPTCPEFPDSEWTNILAGRAINLDAVLSGYYSTSNNDEWVEEIGDLEICFGTVNPTKTVSTAGEWSIAWNRASRATSTAFPHRAGELAEYAEYIIGLFAATDAHFHDRVILFDKAVRCRVGARRDLELTDFNKFSDLRSTHMDSIGAAVVQRASLAVNNKSNSTSRKKIPEPCNRWNEGLCALEATQCRRLHVCNKCTKSGHKGPDCPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.25
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.25
8 0.27
9 0.26
10 0.26
11 0.28
12 0.32
13 0.32
14 0.35
15 0.33
16 0.33
17 0.3
18 0.33
19 0.32
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.26
24 0.24
25 0.25
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.25
31 0.27
32 0.3
33 0.3
34 0.39
35 0.36
36 0.36
37 0.35
38 0.32
39 0.32
40 0.33
41 0.33
42 0.24
43 0.22
44 0.22
45 0.22
46 0.2
47 0.19
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.22
71 0.23
72 0.27
73 0.31
74 0.3
75 0.28
76 0.33
77 0.36
78 0.38
79 0.39
80 0.37
81 0.34
82 0.35
83 0.35
84 0.29
85 0.24
86 0.19
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.12
114 0.15
115 0.18
116 0.22
117 0.22
118 0.22
119 0.23
120 0.23
121 0.26
122 0.27
123 0.32
124 0.33
125 0.35
126 0.42
127 0.48
128 0.54
129 0.56
130 0.59
131 0.6
132 0.66
133 0.74
134 0.76
135 0.75
136 0.74
137 0.72
138 0.72
139 0.66
140 0.61
141 0.53
142 0.46
143 0.42
144 0.37
145 0.3
146 0.26
147 0.25
148 0.21
149 0.23
150 0.22
151 0.27
152 0.28
153 0.32
154 0.38
155 0.39
156 0.43
157 0.41
158 0.48
159 0.49
160 0.5
161 0.54
162 0.5
163 0.5
164 0.45
165 0.44
166 0.35
167 0.26
168 0.21
169 0.13
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.17
178 0.13
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.15
201 0.19
202 0.24
203 0.3
204 0.3
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.3
209 0.27
210 0.22
211 0.17
212 0.16
213 0.2
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.1
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.07
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.19
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.19
277 0.2
278 0.2
279 0.19
280 0.2
281 0.23
282 0.25
283 0.32
284 0.31
285 0.3
286 0.31
287 0.28
288 0.26
289 0.23
290 0.2
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.15
312 0.15
313 0.17
314 0.21
315 0.2
316 0.17
317 0.21
318 0.26
319 0.26
320 0.29
321 0.28
322 0.23
323 0.29
324 0.37
325 0.41
326 0.43
327 0.42
328 0.44
329 0.45
330 0.46
331 0.43
332 0.41
333 0.35
334 0.32
335 0.3
336 0.24
337 0.25
338 0.24
339 0.22
340 0.26
341 0.25
342 0.23
343 0.29
344 0.34
345 0.33
346 0.35
347 0.34
348 0.24
349 0.25
350 0.22
351 0.16
352 0.11
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.09
360 0.14
361 0.2
362 0.26
363 0.27
364 0.29
365 0.32
366 0.36
367 0.4
368 0.44
369 0.46
370 0.48
371 0.56
372 0.63
373 0.7
374 0.76
375 0.8
376 0.8
377 0.83
378 0.84
379 0.79
380 0.75
381 0.66
382 0.59
383 0.53
384 0.45
385 0.35
386 0.28
387 0.24
388 0.25
389 0.26
390 0.28
391 0.31
392 0.3
393 0.33
394 0.34
395 0.4
396 0.45
397 0.52
398 0.57
399 0.6
400 0.65
401 0.7
402 0.73
403 0.73
404 0.74
405 0.74
406 0.75
407 0.73