FuNGI

N1PVB8

Protein Details

Accession

N1PVB8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-49	AAKKRERSISPPPSRSPRKAPKLEESTV	Hydrophilic
492-511	GEIPKDRKERRITCRNWECG	Hydrophilic
520-541	ILPPACKEKARRRHTDDEEDSE	Acidic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-43	ARIAAAKKRERSISPPPSRSPRKAPK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010347 Tdp1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008081 F:phosphoric diester hydrolase activity GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF06087 Tyr-DNA_phospho
CDD	cd09122 PLDc_Tdp1_1

Amino Acid Sequences

MPIPGFEDRKAMEHERLARIAAAKKRERSISPPPSRSPRKAPKLEESTVEMESGAKLRVFSEEVERHQQSRKGDTANAANERMKTMLSTSSAAAAAAVMSITDKTADSLPQGAIKYPHGVVKKTWAFGHERDGRDIKLEEVLEPSSVRTAVLSAFQWDTEWVLSKLKTPLNGGSTKCVFVMQAKTPDERAQYREWASGFEACLRICLPPMDGAIYCMHSKLMLLFHPHKLRVAIPSANLLNFDWGETGQMENSVFMIDLPRLAGSTSQTTEDLTFFGQELMFFIERQGLDKDLRKGVLGFDFSATEHMAFIHTVGGMNYERTGADRTGLLGLSRAVRYLGLTTDQRELEIDFAASSIGQLNDSQVQDLHSAASGQDLIAQAAEAKSKAATNFFAKKAASSKAASTSERDIKQKLRVYFPTKETVQASTAGAAGTICLQRKYFEGKTFPRAIFRDYKSTRKGLLSHNKILCARSKSLAWLYIGSANMSKSAWGEIPKDRKERRITCRNWECGVLLPVPKEILPPACKEKARRRHTDDEEDSETDSEDEEPQLVDMSVFSSLVDLPFEVPGDDYNGREPWYFTEKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.46
3	0.46
4	0.44
5	0.4
6	0.4
7	0.43
8	0.42
9	0.45
10	0.47
11	0.52
12	0.58
13	0.61
14	0.61
15	0.61
16	0.66
17	0.67
18	0.7
19	0.71
20	0.72
21	0.77
22	0.81
23	0.81
24	0.81
25	0.81
26	0.81
27	0.83
28	0.82
29	0.82
30	0.81
31	0.77
32	0.69
33	0.64
34	0.56
35	0.47
36	0.4
37	0.3
38	0.22
39	0.2
40	0.18
41	0.14
42	0.11
43	0.11
44	0.11
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.23
49	0.27
50	0.31
51	0.4
52	0.42
53	0.42
54	0.47
55	0.5
56	0.45
57	0.46
58	0.47
59	0.42
60	0.42
61	0.45
62	0.46
63	0.49
64	0.48
65	0.45
66	0.42
67	0.39
68	0.38
69	0.33
70	0.26
71	0.19
72	0.17
73	0.17
74	0.16
75	0.17
76	0.16
77	0.17
78	0.17
79	0.16
80	0.14
81	0.1
82	0.08
83	0.06
84	0.05
85	0.03
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.05
90	0.05
91	0.07
92	0.08
93	0.09
94	0.1
95	0.12
96	0.13
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.19
101	0.19
102	0.21
103	0.2
104	0.25
105	0.24
106	0.26
107	0.25
108	0.33
109	0.35
110	0.34
111	0.34
112	0.32
113	0.34
114	0.34
115	0.43
116	0.4
117	0.38
118	0.41
119	0.42
120	0.4
121	0.38
122	0.37
123	0.28
124	0.24
125	0.23
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.15
130	0.15
131	0.14
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.09
139	0.09
140	0.1
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.11
146	0.1
147	0.12
148	0.11
149	0.13
150	0.14
151	0.17
152	0.22
153	0.23
154	0.24
155	0.24
156	0.27
157	0.29
158	0.34
159	0.31
160	0.32
161	0.32
162	0.3
163	0.28
164	0.24
165	0.19
166	0.18
167	0.22
168	0.21
169	0.27
170	0.28
171	0.29
172	0.31
173	0.34
174	0.35
175	0.32
176	0.32
177	0.28
178	0.31
179	0.32
180	0.33
181	0.3
182	0.27
183	0.25
184	0.23
185	0.21
186	0.18
187	0.17
188	0.14
189	0.15
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.12
200	0.12
201	0.13
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.08
206	0.09
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.15
211	0.18
212	0.25
213	0.29
214	0.29
215	0.28
216	0.28
217	0.27
218	0.24
219	0.25
220	0.21
221	0.17
222	0.2
223	0.2
224	0.19
225	0.18
226	0.15
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.05
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.08
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.09
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.13
277	0.16
278	0.19
279	0.18
280	0.18
281	0.17
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.13
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.09
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.05
301	0.04
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.08
309	0.1
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.06
318	0.07
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.12
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.11
337	0.09
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.1
349	0.1
350	0.11
351	0.09
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.05
361	0.05
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.13
377	0.18
378	0.24
379	0.24
380	0.27
381	0.26
382	0.27
383	0.29
384	0.29
385	0.27
386	0.22
387	0.23
388	0.27
389	0.3
390	0.29
391	0.28
392	0.31
393	0.35
394	0.37
395	0.38
396	0.36
397	0.37
398	0.44
399	0.48
400	0.46
401	0.45
402	0.5
403	0.53
404	0.56
405	0.55
406	0.53
407	0.47
408	0.48
409	0.42
410	0.36
411	0.31
412	0.26
413	0.23
414	0.17
415	0.16
416	0.12
417	0.1
418	0.08
419	0.07
420	0.08
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.13
425	0.13
426	0.16
427	0.24
428	0.26
429	0.3
430	0.37
431	0.41
432	0.48
433	0.54
434	0.52
435	0.51
436	0.48
437	0.47
438	0.47
439	0.46
440	0.49
441	0.47
442	0.55
443	0.53
444	0.55
445	0.54
446	0.49
447	0.5
448	0.5
449	0.56
450	0.56
451	0.59
452	0.58
453	0.59
454	0.57
455	0.54
456	0.51
457	0.46
458	0.41
459	0.34
460	0.33
461	0.33
462	0.35
463	0.36
464	0.3
465	0.26
466	0.24
467	0.25
468	0.25
469	0.21
470	0.19
471	0.16
472	0.15
473	0.14
474	0.13
475	0.1
476	0.12
477	0.13
478	0.15
479	0.19
480	0.26
481	0.36
482	0.43
483	0.52
484	0.54
485	0.61
486	0.68
487	0.74
488	0.75
489	0.77
490	0.76
491	0.77
492	0.82
493	0.8
494	0.72
495	0.64
496	0.55
497	0.49
498	0.46
499	0.39
500	0.32
501	0.27
502	0.26
503	0.25
504	0.23
505	0.2
506	0.19
507	0.23
508	0.23
509	0.27
510	0.34
511	0.41
512	0.45
513	0.53
514	0.61
515	0.64
516	0.7
517	0.75
518	0.76
519	0.8
520	0.84
521	0.85
522	0.81
523	0.78
524	0.74
525	0.64
526	0.57
527	0.47
528	0.39
529	0.28
530	0.22
531	0.16
532	0.12
533	0.11
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.15
557	0.17
558	0.17
559	0.2
560	0.21
561	0.23
562	0.24
563	0.24
564	0.24

N1PVB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer