Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PCT0

Protein Details
Accession N1PCT0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-482TAQATEQKQRKEKKSKAEDVEMEHydrophilic
488-509DDKAARKAAKKAKKLQEEAKADHydrophilic
511-536DEEAVEKKLKKEKKEKRKSGTLAAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
491-503AARKAAKKAKKLQ
516-552EKKLKKEKKEKRKSGTLAAGEVPDEQIKKKKKKSKSE
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13.499, nucl 11, cyto_mito 9.166, mito_nucl 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045056  Nop56/Nop58  
IPR012974  NOP58/56_N  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
IPR012976  NOSIC  
Gene Ontology GO:0031428  C:box C/D RNP complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000494  P:box C/D RNA 3'-end processing  
GO:0000452  P:snoRNA guided rRNA 2'-O-methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PF08156  NOP5NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MSVDYLLHESSVGYAIFKVKLQSDEVGARTKEVQEAQTDLAKFGKMIDLVSFAPFQGASQALENANDVSEGIMSDYLKTVLEANLPKAGKKNKITLAVGDKNLAGSIKAGFTGLECETPDTSELAADLLRGLRLHAEKLLKQLQTGDISRAQLGLGHAYSRAKVKFSVQKNDNHIIQAIATIDHLDKAVNTFSMRVREWYGWHFPELVRIVSENHKYAKCALFIGDKKTLSEDSLHDLAAIVDDDESVARAIIEAARVSMGQDISETDMENVMLFAKRTADLTAYRKSLGNYLVAKMGVVAPNLAALIGETVGARLISHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTKGNTPKYGLIYHSSFIGRAGMKNKGRISRFLANKTSIASRIDNFSMQPTRKFGEALKGQVEERLRFYAEGINPTKNADAMKAAMDATLADMDIDDPTDAGAEDALSAPGVTAQATEQKQRKEKKSKAEDVEMEDAPTIDDKAARKAAKKAKKLQEEAKADVDEEAVEKKLKKEKKEKRKSGTLAAGEVPDEQIKKKKKKSKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.24
9 0.24
10 0.26
11 0.3
12 0.31
13 0.35
14 0.32
15 0.31
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.28
20 0.28
21 0.24
22 0.27
23 0.28
24 0.31
25 0.3
26 0.26
27 0.25
28 0.22
29 0.2
30 0.17
31 0.19
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.17
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.33
75 0.38
76 0.41
77 0.44
78 0.51
79 0.5
80 0.58
81 0.58
82 0.56
83 0.59
84 0.56
85 0.52
86 0.45
87 0.38
88 0.31
89 0.3
90 0.23
91 0.14
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.11
120 0.12
121 0.14
122 0.18
123 0.21
124 0.22
125 0.29
126 0.35
127 0.31
128 0.3
129 0.31
130 0.3
131 0.3
132 0.3
133 0.27
134 0.23
135 0.24
136 0.23
137 0.21
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.24
152 0.31
153 0.37
154 0.46
155 0.45
156 0.51
157 0.57
158 0.61
159 0.55
160 0.47
161 0.41
162 0.31
163 0.26
164 0.2
165 0.13
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.12
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.22
186 0.25
187 0.29
188 0.26
189 0.26
190 0.25
191 0.22
192 0.27
193 0.26
194 0.21
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.2
199 0.23
200 0.2
201 0.23
202 0.23
203 0.23
204 0.26
205 0.27
206 0.22
207 0.2
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.29
212 0.29
213 0.27
214 0.26
215 0.27
216 0.26
217 0.2
218 0.19
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.12
269 0.16
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.12
284 0.13
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.11
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.13
333 0.15
334 0.21
335 0.24
336 0.32
337 0.39
338 0.45
339 0.47
340 0.44
341 0.48
342 0.44
343 0.44
344 0.38
345 0.33
346 0.29
347 0.27
348 0.26
349 0.19
350 0.17
351 0.15
352 0.17
353 0.13
354 0.14
355 0.17
356 0.23
357 0.26
358 0.32
359 0.36
360 0.39
361 0.41
362 0.42
363 0.46
364 0.46
365 0.5
366 0.51
367 0.51
368 0.46
369 0.45
370 0.43
371 0.37
372 0.31
373 0.27
374 0.23
375 0.2
376 0.21
377 0.22
378 0.21
379 0.19
380 0.22
381 0.26
382 0.26
383 0.27
384 0.27
385 0.27
386 0.27
387 0.28
388 0.24
389 0.26
390 0.28
391 0.29
392 0.29
393 0.29
394 0.28
395 0.31
396 0.33
397 0.25
398 0.25
399 0.23
400 0.21
401 0.2
402 0.21
403 0.24
404 0.23
405 0.29
406 0.29
407 0.29
408 0.28
409 0.29
410 0.29
411 0.23
412 0.21
413 0.15
414 0.14
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.14
450 0.16
451 0.24
452 0.29
453 0.37
454 0.46
455 0.56
456 0.65
457 0.69
458 0.75
459 0.78
460 0.83
461 0.85
462 0.83
463 0.83
464 0.77
465 0.72
466 0.69
467 0.58
468 0.48
469 0.38
470 0.31
471 0.22
472 0.19
473 0.13
474 0.08
475 0.12
476 0.12
477 0.18
478 0.26
479 0.29
480 0.32
481 0.41
482 0.51
483 0.58
484 0.66
485 0.7
486 0.73
487 0.8
488 0.84
489 0.83
490 0.83
491 0.79
492 0.74
493 0.69
494 0.59
495 0.49
496 0.42
497 0.33
498 0.23
499 0.18
500 0.16
501 0.13
502 0.16
503 0.17
504 0.23
505 0.32
506 0.38
507 0.47
508 0.57
509 0.66
510 0.74
511 0.83
512 0.88
513 0.88
514 0.92
515 0.88
516 0.87
517 0.86
518 0.78
519 0.7
520 0.61
521 0.53
522 0.42
523 0.37
524 0.29
525 0.23
526 0.21
527 0.22
528 0.29
529 0.38
530 0.48
531 0.58
532 0.65