FuNGI

N1PHB6

Protein Details

Accession

N1PHB6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
631-654	KTAAGRGRKDRKQEQNKKQKVERQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
635-647	GRGRKDRKQEQNK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 11.5, cyto_mito 6.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR035639 CPSF2_MBL IPR001279 Metallo-B-lactamas IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro IPR011108 RMMBL
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C PF16661 Lactamase_B_6 PF07521 RMMBL
CDD	cd16293 CPSF2-like_MBL-fold

Amino Acid Sequences

MFNFTPLLGAQSDSPASQSLLELDGGVKILVDVGWDETFDAEKLHAIEQHVSTLSIVLLTHPTLDHIGAYAHCCKHIPGFSRIPVYATTPVVNLGRTLLADLYHSAPLTTSIIPTSAILSSPIAADPHTTPNLLYQHPTPDEIAAYFNAINPLKYSQPHQPIGVASGPGLGNLVITAYSAGHTPGGTIWHIQHGLESIVYAADWNQGRENLLSGAAWLGTSSEIIEPLRRPTALVCSSKGVQKTDTLPRKKRDELLVSLIRETVAQGGKVLIPTDSSARVLELAFILNHTWRENITGPHADTYRHARIFMASKSSTSTMRQLHGMLEWMDDAIQRHAEAAMGQGGDDKKIPSMLDWRFVKQIERKSQLDKVLQRQNPCIILASDASLEWGLSQHALKALAGDARNLVILTEHMTSNKITSPSVAKHLADLYRERADQPSKSSIAKVVSADGQSVLFREPISAALRDEDNTLYQQYQARQRQLHSNLQGDNTSNDTAAAEIAQEEAEESSDEEDEEEDPDRQGRALNLTAQINQGNKRKAGVSEAELGINVLLRSKNTHDYDVRHKRGREKMFPFVSHRNKDDEYGDLIKPEDYLRAEERDETGNEDMRDGLKPEATELGQKRKWNDVADTKTAAGRGRKDRKQEQNKKQKVERQPDDIDAIIAKATGESGAGQNTSNGAPSDDDDSESDYEPDEGDSDEPKKVVFNDQAISLQIRVGHIDFTGMHEKRDLQNIIPRVRPRKLILISGDVSETRELADWCRQSLDSGAGESASEVFTPIVGETVDASVDTNAWSLKLSRQLVKKLAWQNVKGLGIVTLTGSLMAERPQEVEDTEDENVKKKLKLINGEDQEDVTMKSNAPLIPMLDLVKTTAGTTQQRGAQPVHVGDLRIAEFRRMLMESGHVAEFRGQGTLLVDSTVLVRKDASGKIEIEAGAGGLSQPTYRTREMEGTFYAVKKLIYQGLAVSAKSAAHSHNSYAPPSIRPGVNYLFPDKTQHTMLHVFNKTSKLWTDEKYAKTAQKFKIFKVATHFSVGNIIERVRQGKENAAGWAVTEVVEKGSGGWAKGTTIKYDDEKAKGSLESMGWDAKRGSEARPPVWVVVHKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.14
3	0.15
4	0.14
5	0.14
6	0.12
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.11
11	0.1
12	0.1
13	0.09
14	0.08
15	0.06
16	0.06
17	0.06
18	0.06
19	0.06
20	0.09
21	0.09
22	0.09
23	0.1
24	0.1
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.08
29	0.11
30	0.12
31	0.14
32	0.16
33	0.18
34	0.22
35	0.22
36	0.25
37	0.24
38	0.22
39	0.2
40	0.18
41	0.15
42	0.11
43	0.1
44	0.08
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.1
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.12
53	0.1
54	0.12
55	0.12
56	0.16
57	0.21
58	0.21
59	0.22
60	0.23
61	0.23
62	0.29
63	0.34
64	0.36
65	0.37
66	0.43
67	0.47
68	0.52
69	0.51
70	0.46
71	0.4
72	0.39
73	0.35
74	0.3
75	0.26
76	0.2
77	0.23
78	0.23
79	0.21
80	0.17
81	0.15
82	0.13
83	0.13
84	0.13
85	0.11
86	0.1
87	0.11
88	0.12
89	0.14
90	0.14
91	0.14
92	0.13
93	0.12
94	0.14
95	0.16
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.13
102	0.13
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.12
113	0.13
114	0.19
115	0.2
116	0.19
117	0.18
118	0.24
119	0.28
120	0.27
121	0.28
122	0.24
123	0.3
124	0.32
125	0.33
126	0.28
127	0.25
128	0.24
129	0.22
130	0.21
131	0.14
132	0.15
133	0.13
134	0.13
135	0.18
136	0.18
137	0.17
138	0.17
139	0.2
140	0.21
141	0.22
142	0.25
143	0.29
144	0.36
145	0.39
146	0.38
147	0.37
148	0.35
149	0.37
150	0.35
151	0.26
152	0.17
153	0.18
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.1
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.04
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.12
175	0.12
176	0.16
177	0.17
178	0.16
179	0.16
180	0.15
181	0.15
182	0.13
183	0.12
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.05
189	0.1
190	0.11
191	0.12
192	0.14
193	0.15
194	0.17
195	0.17
196	0.18
197	0.13
198	0.13
199	0.11
200	0.1
201	0.09
202	0.08
203	0.07
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.08
212	0.11
213	0.12
214	0.16
215	0.19
216	0.18
217	0.18
218	0.18
219	0.26
220	0.3
221	0.32
222	0.3
223	0.31
224	0.33
225	0.37
226	0.38
227	0.32
228	0.26
229	0.27
230	0.31
231	0.38
232	0.46
233	0.52
234	0.57
235	0.62
236	0.69
237	0.7
238	0.69
239	0.68
240	0.64
241	0.59
242	0.6
243	0.58
244	0.52
245	0.47
246	0.41
247	0.33
248	0.26
249	0.21
250	0.17
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.13
256	0.13
257	0.13
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.14
280	0.16
281	0.17
282	0.2
283	0.23
284	0.23
285	0.26
286	0.27
287	0.23
288	0.24
289	0.3
290	0.32
291	0.29
292	0.28
293	0.25
294	0.28
295	0.32
296	0.31
297	0.3
298	0.23
299	0.22
300	0.25
301	0.26
302	0.25
303	0.22
304	0.27
305	0.23
306	0.25
307	0.26
308	0.24
309	0.23
310	0.21
311	0.21
312	0.15
313	0.12
314	0.11
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.12
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.18
340	0.18
341	0.26
342	0.27
343	0.29
344	0.31
345	0.32
346	0.36
347	0.34
348	0.42
349	0.43
350	0.47
351	0.47
352	0.49
353	0.53
354	0.54
355	0.54
356	0.51
357	0.5
358	0.54
359	0.55
360	0.53
361	0.51
362	0.48
363	0.42
364	0.37
365	0.3
366	0.2
367	0.19
368	0.16
369	0.13
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.09
393	0.08
394	0.05
395	0.05
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.13
404	0.12
405	0.1
406	0.12
407	0.15
408	0.16
409	0.21
410	0.22
411	0.2
412	0.2
413	0.23
414	0.23
415	0.21
416	0.21
417	0.21
418	0.21
419	0.21
420	0.21
421	0.23
422	0.25
423	0.24
424	0.26
425	0.27
426	0.26
427	0.26
428	0.26
429	0.24
430	0.23
431	0.23
432	0.19
433	0.15
434	0.15
435	0.15
436	0.15
437	0.12
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.11
451	0.12
452	0.12
453	0.13
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.11
460	0.13
461	0.15
462	0.24
463	0.28
464	0.33
465	0.34
466	0.36
467	0.43
468	0.46
469	0.49
470	0.44
471	0.42
472	0.38
473	0.37
474	0.36
475	0.28
476	0.24
477	0.19
478	0.15
479	0.11
480	0.1
481	0.09
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.07
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.08
509	0.07
510	0.09
511	0.1
512	0.11
513	0.13
514	0.14
515	0.14
516	0.15
517	0.16
518	0.15
519	0.2
520	0.24
521	0.23
522	0.23
523	0.23
524	0.23
525	0.21
526	0.23
527	0.19
528	0.16
529	0.17
530	0.17
531	0.16
532	0.15
533	0.14
534	0.11
535	0.1
536	0.07
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.07
541	0.09
542	0.16
543	0.17
544	0.21
545	0.22
546	0.26
547	0.37
548	0.46
549	0.49
550	0.47
551	0.48
552	0.52
553	0.59
554	0.62
555	0.61
556	0.55
557	0.58
558	0.56
559	0.57
560	0.55
561	0.55
562	0.56
563	0.51
564	0.48
565	0.43
566	0.4
567	0.4
568	0.35
569	0.27
570	0.23
571	0.23
572	0.21
573	0.17
574	0.17
575	0.15
576	0.15
577	0.13
578	0.11
579	0.08
580	0.11
581	0.12
582	0.14
583	0.14
584	0.14
585	0.16
586	0.16
587	0.15
588	0.15
589	0.15
590	0.16
591	0.16
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.13
596	0.11
597	0.11
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.1
603	0.15
604	0.17
605	0.25
606	0.27
607	0.29
608	0.31
609	0.34
610	0.38
611	0.34
612	0.36
613	0.36
614	0.38
615	0.39
616	0.38
617	0.33
618	0.3
619	0.3
620	0.27
621	0.22
622	0.23
623	0.31
624	0.39
625	0.43
626	0.51
627	0.59
628	0.67
629	0.75
630	0.8
631	0.8
632	0.82
633	0.86
634	0.85
635	0.82
636	0.8
637	0.78
638	0.78
639	0.71
640	0.67
641	0.62
642	0.56
643	0.51
644	0.43
645	0.33
646	0.22
647	0.17
648	0.1
649	0.07
650	0.05
651	0.04
652	0.04
653	0.03
654	0.03
655	0.04
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.08
662	0.08
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.12
669	0.11
670	0.12
671	0.11
672	0.13
673	0.14
674	0.14
675	0.13
676	0.1
677	0.1
678	0.09
679	0.09
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.09
684	0.1
685	0.11
686	0.1
687	0.1
688	0.11
689	0.12
690	0.16
691	0.17
692	0.18
693	0.18
694	0.19
695	0.2
696	0.19
697	0.19
698	0.14
699	0.12
700	0.1
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.08
708	0.11
709	0.2
710	0.19
711	0.19
712	0.19
713	0.22
714	0.23
715	0.3
716	0.27
717	0.2
718	0.26
719	0.33
720	0.35
721	0.38
722	0.42
723	0.42
724	0.44
725	0.46
726	0.43
727	0.45
728	0.44
729	0.44
730	0.4
731	0.39
732	0.37
733	0.33
734	0.31
735	0.22
736	0.21
737	0.15
738	0.13
739	0.08
740	0.09
741	0.09
742	0.11
743	0.17
744	0.17
745	0.17
746	0.19
747	0.19
748	0.18
749	0.19
750	0.19
751	0.13
752	0.13
753	0.12
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.09
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.05
776	0.06
777	0.05
778	0.06
779	0.06
780	0.07
781	0.1
782	0.18
783	0.21
784	0.26
785	0.32
786	0.37
787	0.42
788	0.43
789	0.48
790	0.48
791	0.53
792	0.53
793	0.49
794	0.47
795	0.47
796	0.46
797	0.37
798	0.3
799	0.22
800	0.16
801	0.15
802	0.11
803	0.06
804	0.06
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.09
813	0.09
814	0.1
815	0.1
816	0.12
817	0.12
818	0.14
819	0.14
820	0.17
821	0.17
822	0.2
823	0.23
824	0.24
825	0.23
826	0.25
827	0.3
828	0.32
829	0.4
830	0.44
831	0.51
832	0.53
833	0.55
834	0.5
835	0.45
836	0.39
837	0.31
838	0.25
839	0.18
840	0.14
841	0.11
842	0.12
843	0.15
844	0.15
845	0.15
846	0.15
847	0.13
848	0.13
849	0.14
850	0.14
851	0.11
852	0.11
853	0.1
854	0.1
855	0.09
856	0.09
857	0.09
858	0.14
859	0.17
860	0.19
861	0.22
862	0.27
863	0.29
864	0.31
865	0.31
866	0.29
867	0.29
868	0.27
869	0.27
870	0.23
871	0.21
872	0.19
873	0.2
874	0.18
875	0.18
876	0.18
877	0.16
878	0.15
879	0.15
880	0.17
881	0.16
882	0.15
883	0.12
884	0.14
885	0.15
886	0.17
887	0.17
888	0.15
889	0.14
890	0.16
891	0.16
892	0.14
893	0.13
894	0.1
895	0.1
896	0.11
897	0.12
898	0.09
899	0.08
900	0.08
901	0.07
902	0.09
903	0.13
904	0.12
905	0.12
906	0.12
907	0.13
908	0.18
909	0.21
910	0.22
911	0.21
912	0.22
913	0.22
914	0.24
915	0.22
916	0.18
917	0.15
918	0.12
919	0.08
920	0.07
921	0.06
922	0.04
923	0.05
924	0.05
925	0.07
926	0.1
927	0.15
928	0.17
929	0.2
930	0.23
931	0.3
932	0.32
933	0.34
934	0.32
935	0.31
936	0.32
937	0.31
938	0.29
939	0.22
940	0.21
941	0.18
942	0.2
943	0.2
944	0.18
945	0.18
946	0.17
947	0.23
948	0.24
949	0.22
950	0.2
951	0.17
952	0.16
953	0.17
954	0.18
955	0.12
956	0.17
957	0.19
958	0.2
959	0.27
960	0.29
961	0.29
962	0.33
963	0.33
964	0.3
965	0.33
966	0.35
967	0.29
968	0.28
969	0.32
970	0.3
971	0.33
972	0.34
973	0.35
974	0.33
975	0.32
976	0.36
977	0.33
978	0.33
979	0.31
980	0.29
981	0.29
982	0.33
983	0.36
984	0.4
985	0.41
986	0.4
987	0.41
988	0.44
989	0.4
990	0.38
991	0.36
992	0.32
993	0.34
994	0.35
995	0.4
996	0.44
997	0.46
998	0.48
999	0.51
1000	0.53
1001	0.55
1002	0.61
1003	0.6
1004	0.62
1005	0.63
1006	0.59
1007	0.64
1008	0.58
1009	0.53
1010	0.53
1011	0.52
1012	0.44
1013	0.46
1014	0.43
1015	0.33
1016	0.38
1017	0.35
1018	0.3
1019	0.25
1020	0.23
1021	0.21
1022	0.25
1023	0.27
1024	0.25
1025	0.29
1026	0.27
1027	0.33
1028	0.37
1029	0.36
1030	0.35
1031	0.33
1032	0.3
1033	0.26
1034	0.24
1035	0.17
1036	0.12
1037	0.11
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.08
1043	0.14
1044	0.15
1045	0.14
1046	0.16
1047	0.15
1048	0.17
1049	0.24
1050	0.25
1051	0.23
1052	0.24
1053	0.28
1054	0.3
1055	0.36
1056	0.4
1057	0.38
1058	0.4
1059	0.38
1060	0.38
1061	0.34
1062	0.31
1063	0.28
1064	0.23
1065	0.21
1066	0.2
1067	0.24
1068	0.22
1069	0.24
1070	0.23
1071	0.21
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.26
1075	0.29
1076	0.36
1077	0.36
1078	0.41
1079	0.42
1080	0.39
1081	0.42

N1PHB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer