Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PUM1

Protein Details
Accession N1PUM1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249NMEARVFNPEKKKRKREGYEEGDWHydrophilic
377-401LQEQQNKEKRKERRKENERKQKDIVBasic
733-766LNARPIKKVREAKARKTMRTARRLEKLKKKSEGLHydrophilic
785-805MAKAAKGGKKRQPVKVVKAGGHydrophilic
823-844VDARLKKDTRGLKRAAKRNGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-241KKKRKR
335-338KKEG
341-341K
383-397KEKRKERRKENERKQ
489-497KAKARAKRA
721-765EAAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKARKTMRTARRLEKLKKKSEG
775-844REKAGAIQKLMAKAAKGGKKRQPVKVVKAGGQNKGSGRPRGVKGKYKMVDARLKKDTRGLKRAAKRNGKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHAKARLDKYYYLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYSFLQNAKCLIDLCAAPGSWLQVAAETMPQKSLIVGVDLTPIKPIPKTITFQGDITTDKCRATIRGHLKTWKADCVIHDGAPNVGTAWVQDAFSQNDLVLSSLKLATEFLAPNGNFVTKVFRSKDSSKLEWIFKQLFSKVEQTKPPSSRNVSAETFYVCRGYKAPKHLDPKFLDPAYAFMEAAEGKANMEARVFNPEKKKRKREGYEEGDWTQFKECPAYEFIQTQDPIDMLGRYNRFHFETEAGDEIAQAALAKLPDTTEEVRQNCEDLKVLGRKEFKVLLRWRLKARDVFGLRQKKEGTHKKAEAKAEPAEGEVGEEVAMVESMDDELRYAEEVQALQEQQNKEKRKERRKENERKQKDIVRMQMGMTTPSEIGIEAGENDPVFRLKDVDKASDVRRQIVRGRMHTQVAPEKPKEESEGEDEEDEELDELEAQLDGMYEDYQSRREDHKAKARAKRAKLDDEEPFEDFDEREKTADTDASSDEDLIEDDGDDDGSDAGEQGLTTDLQGKDPKDGGLSRRAASFFQQDIFSGIDGLAGEDDEEMEPDNDKARDSGIDVDSPELKAAPSAEEEDEFETEADDEAGESDSEPEDVAGAEEEEDWEERTVKPGQERETEGRPNIDIITAEAMTLAHQLATGKVTKQQLLDDNFNKYSLRDVDGLPEWFLDDENKHAKVQRPVSKEAAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKARKTMRTARRLEKLKKKSEGLAEDGDMGEREKAGAIQKLMAKAAKGGKKRQPVKVVKAGGQNKGSGRPRGVKGKYKMVDARLKKDTRGLKRAAKRNGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.68
3 0.64
4 0.61
5 0.54
6 0.48
7 0.49
8 0.55
9 0.6
10 0.55
11 0.57
12 0.55
13 0.61
14 0.59
15 0.58
16 0.55
17 0.51
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.58
22 0.62
23 0.57
24 0.56
25 0.55
26 0.5
27 0.54
28 0.53
29 0.56
30 0.57
31 0.6
32 0.57
33 0.55
34 0.49
35 0.41
36 0.36
37 0.28
38 0.23
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.14
45 0.14
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.2
70 0.21
71 0.25
72 0.29
73 0.33
74 0.4
75 0.4
76 0.4
77 0.39
78 0.34
79 0.31
80 0.29
81 0.28
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.23
87 0.25
88 0.33
89 0.39
90 0.46
91 0.51
92 0.57
93 0.6
94 0.64
95 0.63
96 0.59
97 0.52
98 0.46
99 0.42
100 0.43
101 0.41
102 0.34
103 0.32
104 0.27
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.19
136 0.19
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.16
141 0.16
142 0.23
143 0.17
144 0.25
145 0.27
146 0.3
147 0.37
148 0.4
149 0.49
150 0.5
151 0.51
152 0.52
153 0.54
154 0.55
155 0.51
156 0.53
157 0.47
158 0.42
159 0.42
160 0.37
161 0.33
162 0.31
163 0.37
164 0.36
165 0.39
166 0.43
167 0.46
168 0.52
169 0.55
170 0.57
171 0.56
172 0.57
173 0.57
174 0.54
175 0.53
176 0.46
177 0.42
178 0.39
179 0.34
180 0.29
181 0.23
182 0.23
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.25
187 0.28
188 0.35
189 0.43
190 0.47
191 0.56
192 0.59
193 0.65
194 0.61
195 0.62
196 0.61
197 0.53
198 0.46
199 0.37
200 0.35
201 0.29
202 0.26
203 0.2
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.08
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.19
218 0.2
219 0.24
220 0.34
221 0.43
222 0.53
223 0.63
224 0.72
225 0.73
226 0.82
227 0.86
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.8
232 0.75
233 0.67
234 0.6
235 0.51
236 0.42
237 0.34
238 0.27
239 0.2
240 0.18
241 0.16
242 0.15
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.23
250 0.2
251 0.17
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.08
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.17
261 0.19
262 0.2
263 0.21
264 0.21
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.19
269 0.17
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.1
274 0.07
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.09
284 0.11
285 0.15
286 0.22
287 0.23
288 0.25
289 0.25
290 0.26
291 0.23
292 0.22
293 0.18
294 0.12
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.24
299 0.27
300 0.26
301 0.28
302 0.32
303 0.28
304 0.33
305 0.37
306 0.42
307 0.46
308 0.49
309 0.51
310 0.51
311 0.53
312 0.48
313 0.46
314 0.45
315 0.41
316 0.42
317 0.46
318 0.51
319 0.47
320 0.48
321 0.46
322 0.42
323 0.49
324 0.54
325 0.53
326 0.52
327 0.58
328 0.61
329 0.66
330 0.66
331 0.58
332 0.52
333 0.46
334 0.39
335 0.32
336 0.25
337 0.2
338 0.15
339 0.12
340 0.08
341 0.06
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.03
346 0.03
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.13
366 0.14
367 0.19
368 0.27
369 0.31
370 0.35
371 0.43
372 0.51
373 0.58
374 0.67
375 0.72
376 0.75
377 0.82
378 0.88
379 0.91
380 0.92
381 0.88
382 0.85
383 0.8
384 0.75
385 0.71
386 0.66
387 0.6
388 0.52
389 0.46
390 0.4
391 0.37
392 0.31
393 0.24
394 0.18
395 0.13
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.13
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.2
419 0.23
420 0.26
421 0.26
422 0.24
423 0.24
424 0.25
425 0.27
426 0.32
427 0.34
428 0.33
429 0.36
430 0.35
431 0.35
432 0.34
433 0.33
434 0.32
435 0.32
436 0.32
437 0.29
438 0.28
439 0.27
440 0.27
441 0.27
442 0.22
443 0.19
444 0.18
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.18
449 0.15
450 0.13
451 0.11
452 0.07
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.05
467 0.06
468 0.08
469 0.09
470 0.12
471 0.15
472 0.21
473 0.27
474 0.33
475 0.42
476 0.49
477 0.56
478 0.61
479 0.68
480 0.71
481 0.7
482 0.72
483 0.68
484 0.66
485 0.62
486 0.59
487 0.54
488 0.5
489 0.47
490 0.39
491 0.34
492 0.27
493 0.23
494 0.19
495 0.17
496 0.13
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.14
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.08
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.1
532 0.1
533 0.13
534 0.16
535 0.17
536 0.19
537 0.19
538 0.2
539 0.17
540 0.19
541 0.2
542 0.25
543 0.27
544 0.25
545 0.27
546 0.28
547 0.26
548 0.26
549 0.28
550 0.21
551 0.19
552 0.19
553 0.17
554 0.17
555 0.17
556 0.14
557 0.1
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.12
580 0.16
581 0.14
582 0.15
583 0.15
584 0.17
585 0.17
586 0.16
587 0.15
588 0.1
589 0.09
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.11
595 0.11
596 0.12
597 0.13
598 0.14
599 0.13
600 0.13
601 0.11
602 0.09
603 0.09
604 0.08
605 0.07
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.1
630 0.09
631 0.13
632 0.17
633 0.19
634 0.24
635 0.28
636 0.32
637 0.36
638 0.42
639 0.43
640 0.46
641 0.49
642 0.44
643 0.41
644 0.37
645 0.33
646 0.27
647 0.23
648 0.16
649 0.12
650 0.14
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.08
658 0.05
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.09
663 0.11
664 0.11
665 0.16
666 0.2
667 0.22
668 0.23
669 0.26
670 0.31
671 0.35
672 0.42
673 0.4
674 0.43
675 0.41
676 0.41
677 0.37
678 0.3
679 0.3
680 0.24
681 0.24
682 0.2
683 0.2
684 0.24
685 0.27
686 0.28
687 0.23
688 0.21
689 0.18
690 0.16
691 0.16
692 0.14
693 0.11
694 0.16
695 0.21
696 0.23
697 0.24
698 0.29
699 0.35
700 0.41
701 0.5
702 0.52
703 0.53
704 0.57
705 0.6
706 0.57
707 0.51
708 0.46
709 0.42
710 0.35
711 0.31
712 0.29
713 0.28
714 0.28
715 0.29
716 0.27
717 0.26
718 0.3
719 0.32
720 0.39
721 0.44
722 0.49
723 0.55
724 0.59
725 0.59
726 0.64
727 0.69
728 0.67
729 0.69
730 0.72
731 0.74
732 0.79
733 0.83
734 0.77
735 0.78
736 0.8
737 0.78
738 0.79
739 0.78
740 0.76
741 0.78
742 0.83
743 0.83
744 0.84
745 0.84
746 0.84
747 0.83
748 0.78
749 0.75
750 0.74
751 0.69
752 0.63
753 0.57
754 0.48
755 0.41
756 0.37
757 0.31
758 0.22
759 0.18
760 0.13
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.1
765 0.14
766 0.18
767 0.18
768 0.23
769 0.27
770 0.28
771 0.31
772 0.3
773 0.26
774 0.27
775 0.35
776 0.38
777 0.42
778 0.49
779 0.55
780 0.64
781 0.72
782 0.75
783 0.78
784 0.8
785 0.82
786 0.82
787 0.79
788 0.74
789 0.76
790 0.73
791 0.7
792 0.63
793 0.58
794 0.51
795 0.55
796 0.55
797 0.51
798 0.51
799 0.52
800 0.56
801 0.62
802 0.67
803 0.68
804 0.68
805 0.73
806 0.69
807 0.7
808 0.69
809 0.67
810 0.7
811 0.67
812 0.68
813 0.67
814 0.67
815 0.61
816 0.63
817 0.64
818 0.64
819 0.66
820 0.66
821 0.66
822 0.73
823 0.81
824 0.84