Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PYH6

Protein Details
Accession N1PYH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-204EASAKEKKKAGKDKDPKAPSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-200KAAAEEASAKEKKKAGKDKDPK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11.5, cyto_mito 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAAVARPGNALRNRRDAPRPLPMKRPSAVDSDMEPGAKKRKLDEPYVITKEHVLRKFAGKPPSLVLYLEQHFFKFEGLESTYAYDSPMKDFIKHLRQQTIPHTLIENLLSEPITFYDGCLIVEVHNNRMSDKKDKARNDSATEGQVKFSMHNYNSYVTPSPFAPYPKKASEHERAEKAAAEEASAKEKKKAGKDKDPKAPSVATIVMFPTALSQHKEQVLLMNTLASEMKLRRKNADGTTPSSAQPTTPSLAAPPAPLGAGQEKKLCIEEQDMYEFERDLLLATQPPLYLAPVKNPQEADRVLELLAHPLHSEAPPSPKTRKRTSAEMAADDAQAADAERRMLIMDERNKPSVAGASDAAGNAHNIGVSRFKSILFAREKAEEQERAKKEAEAAAATKKRQEEEAQAQAQLARQQQAEQSRKLMMHRQEMARRQQEQANMQRMQQQQQQQQQQHAHPQQANVMMSQQQQPQSFQHPSSLPQSSPVVRNQTPGMSNSSPMVPQNGFSMTATSSQGAGSPVRPTTAVMPNPSVAMARQASQQQPGSRNGTPQMAQSTPHMGVAMQNRQPSQTPRMQHGSPAPGTPAAVSMSNMAMQANGLTQEQMAMLRQQQAIQHMNAGSPGQQNSGQQTMTPEQIQKLHQQQLMRHQMMAQNNPALQNQMMQQRQAMMMQQRQQAQQLNQQRMMAAHNQGQAGSPHPGMQQTPQMGHAHPQQGGGDMNQGQQMTPQMLAARQQHIQKANQQLQQIAQQYGGFHNIPPQIAAQMPQAAQALLHRQRQQSQQTMRAQQMAMRAQAAQQSGQPVASGQADPDYMQTLRQHQAMLAAQQQAQQNGQGGQGGQMGGMRYVQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.58
4 0.65
5 0.65
6 0.65
7 0.67
8 0.71
9 0.67
10 0.73
11 0.73
12 0.72
13 0.65
14 0.64
15 0.57
16 0.54
17 0.51
18 0.43
19 0.38
20 0.35
21 0.34
22 0.29
23 0.27
24 0.25
25 0.31
26 0.32
27 0.32
28 0.33
29 0.4
30 0.45
31 0.51
32 0.55
33 0.54
34 0.6
35 0.63
36 0.59
37 0.51
38 0.51
39 0.51
40 0.51
41 0.48
42 0.41
43 0.4
44 0.46
45 0.54
46 0.55
47 0.56
48 0.5
49 0.48
50 0.48
51 0.49
52 0.44
53 0.36
54 0.32
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.27
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.15
64 0.13
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.19
73 0.17
74 0.16
75 0.18
76 0.24
77 0.22
78 0.23
79 0.28
80 0.35
81 0.42
82 0.47
83 0.5
84 0.51
85 0.53
86 0.57
87 0.61
88 0.61
89 0.52
90 0.48
91 0.43
92 0.36
93 0.35
94 0.3
95 0.24
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.24
115 0.24
116 0.25
117 0.3
118 0.33
119 0.34
120 0.41
121 0.46
122 0.51
123 0.58
124 0.66
125 0.7
126 0.72
127 0.69
128 0.66
129 0.6
130 0.57
131 0.55
132 0.47
133 0.38
134 0.34
135 0.29
136 0.25
137 0.24
138 0.26
139 0.22
140 0.26
141 0.27
142 0.27
143 0.27
144 0.3
145 0.3
146 0.23
147 0.24
148 0.2
149 0.2
150 0.21
151 0.26
152 0.28
153 0.31
154 0.37
155 0.4
156 0.44
157 0.45
158 0.51
159 0.55
160 0.58
161 0.6
162 0.58
163 0.54
164 0.51
165 0.5
166 0.43
167 0.37
168 0.27
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.25
173 0.26
174 0.26
175 0.25
176 0.3
177 0.35
178 0.42
179 0.51
180 0.53
181 0.61
182 0.7
183 0.75
184 0.82
185 0.8
186 0.72
187 0.66
188 0.58
189 0.47
190 0.41
191 0.34
192 0.24
193 0.2
194 0.18
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.2
205 0.21
206 0.2
207 0.23
208 0.24
209 0.22
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.09
216 0.1
217 0.12
218 0.21
219 0.27
220 0.29
221 0.32
222 0.36
223 0.43
224 0.44
225 0.51
226 0.46
227 0.45
228 0.48
229 0.46
230 0.42
231 0.37
232 0.32
233 0.23
234 0.21
235 0.19
236 0.16
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.13
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.21
255 0.19
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.17
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.13
266 0.11
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.13
279 0.12
280 0.17
281 0.25
282 0.27
283 0.29
284 0.3
285 0.3
286 0.31
287 0.31
288 0.29
289 0.21
290 0.2
291 0.17
292 0.17
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.1
297 0.08
298 0.08
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.15
304 0.18
305 0.23
306 0.3
307 0.36
308 0.42
309 0.48
310 0.56
311 0.54
312 0.59
313 0.59
314 0.61
315 0.57
316 0.52
317 0.46
318 0.38
319 0.33
320 0.25
321 0.2
322 0.11
323 0.08
324 0.07
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.07
333 0.13
334 0.2
335 0.26
336 0.29
337 0.31
338 0.31
339 0.3
340 0.29
341 0.25
342 0.18
343 0.13
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.07
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.14
363 0.21
364 0.22
365 0.23
366 0.23
367 0.25
368 0.26
369 0.25
370 0.28
371 0.26
372 0.25
373 0.33
374 0.33
375 0.34
376 0.34
377 0.32
378 0.29
379 0.27
380 0.25
381 0.16
382 0.16
383 0.19
384 0.21
385 0.21
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.21
390 0.22
391 0.22
392 0.26
393 0.32
394 0.3
395 0.29
396 0.29
397 0.27
398 0.26
399 0.23
400 0.18
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.16
405 0.24
406 0.27
407 0.25
408 0.25
409 0.25
410 0.26
411 0.27
412 0.3
413 0.26
414 0.28
415 0.31
416 0.33
417 0.37
418 0.42
419 0.48
420 0.47
421 0.44
422 0.41
423 0.4
424 0.39
425 0.41
426 0.42
427 0.42
428 0.37
429 0.36
430 0.41
431 0.4
432 0.39
433 0.38
434 0.37
435 0.37
436 0.43
437 0.5
438 0.45
439 0.5
440 0.51
441 0.48
442 0.5
443 0.46
444 0.44
445 0.38
446 0.36
447 0.33
448 0.31
449 0.29
450 0.2
451 0.18
452 0.15
453 0.16
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.22
459 0.23
460 0.26
461 0.27
462 0.24
463 0.25
464 0.22
465 0.24
466 0.26
467 0.26
468 0.2
469 0.2
470 0.22
471 0.21
472 0.23
473 0.24
474 0.26
475 0.24
476 0.26
477 0.25
478 0.25
479 0.24
480 0.23
481 0.25
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.18
486 0.16
487 0.15
488 0.17
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.09
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.14
512 0.2
513 0.21
514 0.21
515 0.23
516 0.22
517 0.22
518 0.22
519 0.17
520 0.1
521 0.12
522 0.11
523 0.1
524 0.13
525 0.16
526 0.18
527 0.21
528 0.25
529 0.25
530 0.28
531 0.32
532 0.35
533 0.32
534 0.33
535 0.31
536 0.3
537 0.27
538 0.25
539 0.24
540 0.19
541 0.19
542 0.19
543 0.21
544 0.18
545 0.18
546 0.16
547 0.12
548 0.15
549 0.2
550 0.25
551 0.24
552 0.26
553 0.26
554 0.27
555 0.3
556 0.31
557 0.32
558 0.31
559 0.3
560 0.33
561 0.39
562 0.37
563 0.38
564 0.38
565 0.38
566 0.33
567 0.32
568 0.27
569 0.22
570 0.22
571 0.18
572 0.14
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.09
595 0.13
596 0.14
597 0.16
598 0.17
599 0.22
600 0.25
601 0.23
602 0.25
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.18
607 0.15
608 0.15
609 0.15
610 0.14
611 0.15
612 0.17
613 0.19
614 0.21
615 0.19
616 0.16
617 0.2
618 0.2
619 0.21
620 0.22
621 0.21
622 0.2
623 0.24
624 0.26
625 0.28
626 0.33
627 0.38
628 0.38
629 0.4
630 0.41
631 0.48
632 0.56
633 0.5
634 0.43
635 0.38
636 0.4
637 0.42
638 0.43
639 0.35
640 0.28
641 0.28
642 0.3
643 0.28
644 0.25
645 0.2
646 0.18
647 0.19
648 0.24
649 0.25
650 0.23
651 0.24
652 0.24
653 0.24
654 0.23
655 0.24
656 0.22
657 0.26
658 0.32
659 0.36
660 0.38
661 0.39
662 0.42
663 0.44
664 0.41
665 0.44
666 0.47
667 0.48
668 0.47
669 0.46
670 0.42
671 0.36
672 0.36
673 0.32
674 0.27
675 0.26
676 0.27
677 0.26
678 0.26
679 0.26
680 0.24
681 0.22
682 0.21
683 0.17
684 0.16
685 0.17
686 0.18
687 0.18
688 0.2
689 0.24
690 0.23
691 0.24
692 0.26
693 0.27
694 0.26
695 0.29
696 0.33
697 0.31
698 0.29
699 0.29
700 0.26
701 0.26
702 0.26
703 0.22
704 0.2
705 0.17
706 0.17
707 0.18
708 0.18
709 0.15
710 0.16
711 0.17
712 0.14
713 0.13
714 0.13
715 0.12
716 0.13
717 0.19
718 0.22
719 0.24
720 0.26
721 0.3
722 0.36
723 0.4
724 0.43
725 0.44
726 0.5
727 0.55
728 0.55
729 0.53
730 0.48
731 0.45
732 0.48
733 0.45
734 0.35
735 0.28
736 0.25
737 0.24
738 0.24
739 0.26
740 0.19
741 0.16
742 0.21
743 0.22
744 0.22
745 0.21
746 0.2
747 0.18
748 0.18
749 0.2
750 0.16
751 0.18
752 0.18
753 0.19
754 0.19
755 0.17
756 0.16
757 0.17
758 0.24
759 0.27
760 0.34
761 0.38
762 0.42
763 0.48
764 0.57
765 0.62
766 0.63
767 0.64
768 0.66
769 0.68
770 0.7
771 0.68
772 0.63
773 0.55
774 0.48
775 0.47
776 0.43
777 0.35
778 0.3
779 0.27
780 0.25
781 0.29
782 0.28
783 0.21
784 0.19
785 0.21
786 0.21
787 0.2
788 0.18
789 0.14
790 0.15
791 0.16
792 0.14
793 0.12
794 0.13
795 0.14
796 0.14
797 0.15
798 0.16
799 0.13
800 0.17
801 0.2
802 0.24
803 0.28
804 0.29
805 0.28
806 0.25
807 0.31
808 0.3
809 0.3
810 0.29
811 0.29
812 0.28
813 0.32
814 0.35
815 0.31
816 0.29
817 0.28
818 0.26
819 0.24
820 0.23
821 0.21
822 0.18
823 0.17
824 0.18
825 0.16
826 0.13
827 0.13
828 0.13
829 0.12