Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PN17

Protein Details
Accession N1PN17    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-77TTITSKANGKKTKTKKKVIEEPAPDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-11KRK
37-68RPAPGKSALKKSKVETTITSKANGKKTKTKKK
239-285KGPKGVKGGKVRPRNRIEGTRFRKGAERGVWEGRVTREQERRDAKAK
340-344KKKKQ
385-390KKRKVK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSTDTKARKRKSGDNVVPAAKKIKTTTEANVAKSADRPAPGKSALKKSKVETTITSKANGKKTKTKKKVIEEPAPDSEEADTIVSDAEQGGADLTADQTEALLAGFTDSEDEDEDENVDEGLDIAKLPVPPKAKKTTTTDKPSDPETTPGVIYIGRLPHGFYEKQLHAYLSQFGTITPHHLRLSRNKKTGKSKHFAFVEFESASVADIVAKTMDKYLLFGHILQVRRVPAEQVTEGMWKGPKGVKGGKVRPRNRIEGTRFRKGAERGVWEGRVTREQERRDAKAKKLAEMGYDFEMPDVKTVDAVPKQKKDVESVATLQVEDDAAKIEEPEEGVKLLEGKKKKQGGGVEKKVEKVVEVSGEVPVVTEETTVKRKNKATGSTFTTKKRKVKAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.79
3 0.77
4 0.72
5 0.65
6 0.59
7 0.5
8 0.44
9 0.38
10 0.37
11 0.35
12 0.38
13 0.41
14 0.46
15 0.49
16 0.48
17 0.5
18 0.44
19 0.4
20 0.38
21 0.37
22 0.31
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.31
27 0.34
28 0.39
29 0.42
30 0.49
31 0.54
32 0.6
33 0.61
34 0.6
35 0.65
36 0.62
37 0.58
38 0.53
39 0.53
40 0.54
41 0.51
42 0.5
43 0.48
44 0.5
45 0.56
46 0.57
47 0.55
48 0.57
49 0.67
50 0.75
51 0.78
52 0.82
53 0.82
54 0.85
55 0.89
56 0.88
57 0.87
58 0.82
59 0.79
60 0.73
61 0.66
62 0.56
63 0.46
64 0.37
65 0.27
66 0.21
67 0.14
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.06
113 0.08
114 0.08
115 0.13
116 0.18
117 0.22
118 0.28
119 0.36
120 0.37
121 0.41
122 0.49
123 0.54
124 0.58
125 0.63
126 0.62
127 0.57
128 0.56
129 0.54
130 0.51
131 0.41
132 0.35
133 0.28
134 0.25
135 0.21
136 0.19
137 0.17
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.19
150 0.19
151 0.22
152 0.23
153 0.22
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.14
158 0.14
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.14
164 0.13
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.22
169 0.31
170 0.41
171 0.45
172 0.51
173 0.53
174 0.59
175 0.67
176 0.74
177 0.72
178 0.69
179 0.63
180 0.62
181 0.59
182 0.53
183 0.46
184 0.37
185 0.32
186 0.25
187 0.22
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.08
192 0.07
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.18
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.14
216 0.12
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.12
227 0.14
228 0.16
229 0.19
230 0.24
231 0.3
232 0.38
233 0.48
234 0.54
235 0.61
236 0.65
237 0.7
238 0.7
239 0.7
240 0.66
241 0.66
242 0.65
243 0.66
244 0.67
245 0.66
246 0.62
247 0.56
248 0.57
249 0.49
250 0.49
251 0.44
252 0.42
253 0.37
254 0.4
255 0.4
256 0.34
257 0.35
258 0.3
259 0.29
260 0.27
261 0.3
262 0.34
263 0.36
264 0.44
265 0.47
266 0.5
267 0.54
268 0.57
269 0.54
270 0.56
271 0.55
272 0.5
273 0.5
274 0.46
275 0.4
276 0.36
277 0.33
278 0.27
279 0.26
280 0.23
281 0.17
282 0.18
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.16
290 0.2
291 0.28
292 0.34
293 0.37
294 0.41
295 0.45
296 0.46
297 0.45
298 0.45
299 0.41
300 0.38
301 0.36
302 0.37
303 0.32
304 0.31
305 0.25
306 0.2
307 0.16
308 0.12
309 0.1
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.13
323 0.17
324 0.24
325 0.28
326 0.33
327 0.41
328 0.48
329 0.5
330 0.52
331 0.56
332 0.6
333 0.66
334 0.7
335 0.71
336 0.67
337 0.67
338 0.64
339 0.54
340 0.44
341 0.35
342 0.28
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.11
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.14
356 0.22
357 0.29
358 0.34
359 0.41
360 0.46
361 0.54
362 0.6
363 0.65
364 0.63
365 0.64
366 0.68
367 0.69
368 0.7
369 0.72
370 0.73
371 0.73
372 0.75
373 0.76