Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PDG4

Protein Details
Accession N1PDG4    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-187AEPVKKKTKVKGPKGPNPMSHydrophilic
235-261ADGAADAVRKRKRKRKPKENVGSEEAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-153KAKIRAGLKTRRGATLAGAGEKRKR
169-201EPVKKKTKVKGPKGPNPMSVKKAQKDKPKSVGK
243-252RKRKRKRKPK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13.833, nucl 10.5, mito_nucl 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
Amino Acid Sequences MKLGQMLENTLHGEIKPMISQCCIRHLYNEPQSPAKDAWIETAKQAERRRCGHHELEKPLSALECIMSCVDPKGSGNNKNKYVVATQELDIRQKLRAIPGVPLVYINRSVMILEPMASTSEKVKEVEEKAKIRAGLKTRRGATLAGAGEKRKRDDEEGAEGGQADGGAEPVKKKTKVKGPKGPNPMSVKKAQKDKPKSVGKQVEEERSVLRKAAKQDPQVTEKARSGEIVAAENADGAADAVRKRKRKRKPKENVGSEEAGVVDAGED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.19
5 0.2
6 0.22
7 0.28
8 0.26
9 0.32
10 0.35
11 0.32
12 0.35
13 0.4
14 0.47
15 0.51
16 0.56
17 0.52
18 0.53
19 0.53
20 0.52
21 0.46
22 0.38
23 0.32
24 0.25
25 0.28
26 0.28
27 0.27
28 0.25
29 0.31
30 0.31
31 0.36
32 0.43
33 0.44
34 0.47
35 0.52
36 0.58
37 0.56
38 0.61
39 0.63
40 0.65
41 0.65
42 0.65
43 0.66
44 0.6
45 0.54
46 0.47
47 0.39
48 0.29
49 0.21
50 0.14
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.17
61 0.23
62 0.32
63 0.4
64 0.47
65 0.5
66 0.52
67 0.52
68 0.45
69 0.41
70 0.35
71 0.3
72 0.24
73 0.21
74 0.25
75 0.25
76 0.25
77 0.24
78 0.22
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.16
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.2
90 0.17
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.15
112 0.18
113 0.23
114 0.27
115 0.27
116 0.28
117 0.29
118 0.3
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.32
123 0.36
124 0.4
125 0.39
126 0.39
127 0.39
128 0.35
129 0.29
130 0.26
131 0.21
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.2
136 0.22
137 0.23
138 0.19
139 0.21
140 0.21
141 0.25
142 0.27
143 0.29
144 0.29
145 0.28
146 0.25
147 0.23
148 0.2
149 0.15
150 0.11
151 0.05
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.1
158 0.16
159 0.19
160 0.23
161 0.3
162 0.39
163 0.5
164 0.59
165 0.65
166 0.69
167 0.75
168 0.82
169 0.78
170 0.76
171 0.73
172 0.67
173 0.62
174 0.6
175 0.59
176 0.54
177 0.6
178 0.6
179 0.63
180 0.67
181 0.71
182 0.73
183 0.76
184 0.74
185 0.75
186 0.77
187 0.69
188 0.68
189 0.65
190 0.63
191 0.54
192 0.51
193 0.44
194 0.38
195 0.36
196 0.3
197 0.28
198 0.25
199 0.3
200 0.38
201 0.43
202 0.47
203 0.54
204 0.57
205 0.58
206 0.6
207 0.58
208 0.53
209 0.49
210 0.44
211 0.36
212 0.31
213 0.27
214 0.24
215 0.22
216 0.19
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.08
223 0.06
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.1
228 0.18
229 0.26
230 0.35
231 0.46
232 0.56
233 0.66
234 0.74
235 0.84
236 0.87
237 0.91
238 0.93
239 0.94
240 0.95
241 0.92
242 0.87
243 0.78
244 0.67
245 0.57
246 0.45
247 0.34
248 0.23