Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CXE9

Protein Details
Accession B0CXE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-271REKRKSEPAWRATPRKKRKREMDSQTPDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-262SRGAAREKRKSEPAWRATPRKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003615  HNH_nuc  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_292744  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13391  HNH_2  
Amino Acid Sequences MDNKASDSSAISIRQRDFARDVIDRDGTCLMTGAATNFQACHIIPHAKGSESSHSRPQYISGLADHRNEVLDPPLDDINDPRNGILLSPTPNFAMSVNDVAVVMQPNAQHLGFNPSIATSRLTFQHFSAPDVVTALVAPHNSDARQRVGHDNWPPTLLFDISYGCAALHAWGVPQFVELARQRTKYIYYEDNDDDGENDDGGEGDDGSDDGGDGGDGGHSDDGGDGEPDVQLMSERASRGAAREKRKSEPAWRATPRKKRKREMDSQTPDFADIILALWTHNARKGSERLRLSLSDAISDTIHDDTIDTSCLSVYQPTQAQAPTASQQPHGWLVLNIYNTMLPLALNIYSILSSMHLSKLTDKLEANGCLLDATRTDDGKHGILRKFYSSSGSAEAEISLLFSGEPHVSNPEKSLHPDHHSRRAERRRYSTSWEEPKFDTIGEVVDFFRQVFEGLQYLHINTGWGAGDGTISEFKKDEFCDPFSVVVEIPNNPFSNGRRLIVVDTLEIFGDFSESIGAFNDLKDCLQRIDQRKALVAALPKACAFSLLSHPSLLPSSLSHPPSSLPSYDTYLQTENVSSTKLILFQYVATIKCLRIVDPPGVLFFKVADFGSCCRTGSLCCQELYLMRARPNFELMRGQTPLATLVRHNSLALLTTFVAKFQTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.41
4 0.4
5 0.39
6 0.41
7 0.39
8 0.4
9 0.39
10 0.42
11 0.37
12 0.36
13 0.34
14 0.28
15 0.23
16 0.21
17 0.16
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.14
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.21
32 0.28
33 0.29
34 0.28
35 0.31
36 0.31
37 0.37
38 0.38
39 0.43
40 0.45
41 0.47
42 0.47
43 0.46
44 0.45
45 0.39
46 0.35
47 0.32
48 0.27
49 0.3
50 0.32
51 0.34
52 0.31
53 0.27
54 0.26
55 0.24
56 0.21
57 0.2
58 0.18
59 0.16
60 0.18
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.2
65 0.21
66 0.22
67 0.22
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.12
107 0.14
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.29
113 0.27
114 0.29
115 0.3
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.15
130 0.18
131 0.2
132 0.23
133 0.25
134 0.31
135 0.33
136 0.4
137 0.43
138 0.44
139 0.41
140 0.4
141 0.37
142 0.3
143 0.28
144 0.21
145 0.15
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.14
165 0.15
166 0.2
167 0.24
168 0.26
169 0.27
170 0.28
171 0.31
172 0.28
173 0.31
174 0.31
175 0.29
176 0.33
177 0.34
178 0.33
179 0.3
180 0.27
181 0.22
182 0.18
183 0.16
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.22
228 0.28
229 0.34
230 0.42
231 0.46
232 0.49
233 0.56
234 0.58
235 0.57
236 0.6
237 0.59
238 0.6
239 0.63
240 0.69
241 0.72
242 0.78
243 0.8
244 0.81
245 0.84
246 0.84
247 0.87
248 0.86
249 0.87
250 0.86
251 0.86
252 0.84
253 0.78
254 0.7
255 0.6
256 0.51
257 0.4
258 0.3
259 0.19
260 0.1
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.14
272 0.2
273 0.25
274 0.32
275 0.33
276 0.33
277 0.34
278 0.34
279 0.33
280 0.31
281 0.25
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.13
286 0.13
287 0.11
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.04
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.14
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.06
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.17
368 0.2
369 0.2
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.19
377 0.19
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.05
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.2
401 0.24
402 0.24
403 0.28
404 0.37
405 0.4
406 0.47
407 0.52
408 0.53
409 0.59
410 0.65
411 0.7
412 0.68
413 0.71
414 0.68
415 0.67
416 0.69
417 0.67
418 0.66
419 0.67
420 0.62
421 0.57
422 0.5
423 0.49
424 0.42
425 0.33
426 0.24
427 0.14
428 0.13
429 0.1
430 0.1
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.07
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.1
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.15
463 0.16
464 0.21
465 0.2
466 0.23
467 0.26
468 0.27
469 0.27
470 0.24
471 0.24
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.14
476 0.15
477 0.18
478 0.17
479 0.17
480 0.2
481 0.19
482 0.26
483 0.27
484 0.26
485 0.24
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.24
490 0.16
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.12
495 0.1
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.1
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.18
514 0.26
515 0.32
516 0.4
517 0.43
518 0.43
519 0.45
520 0.44
521 0.39
522 0.34
523 0.31
524 0.29
525 0.28
526 0.27
527 0.24
528 0.23
529 0.22
530 0.2
531 0.16
532 0.13
533 0.19
534 0.23
535 0.23
536 0.23
537 0.23
538 0.23
539 0.23
540 0.21
541 0.14
542 0.11
543 0.15
544 0.22
545 0.24
546 0.23
547 0.22
548 0.23
549 0.27
550 0.29
551 0.25
552 0.21
553 0.21
554 0.26
555 0.28
556 0.29
557 0.27
558 0.26
559 0.26
560 0.25
561 0.23
562 0.19
563 0.17
564 0.17
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.15
569 0.15
570 0.14
571 0.14
572 0.13
573 0.19
574 0.21
575 0.21
576 0.21
577 0.22
578 0.21
579 0.26
580 0.26
581 0.22
582 0.24
583 0.27
584 0.28
585 0.29
586 0.3
587 0.28
588 0.28
589 0.27
590 0.21
591 0.18
592 0.15
593 0.14
594 0.13
595 0.12
596 0.13
597 0.15
598 0.2
599 0.2
600 0.2
601 0.19
602 0.2
603 0.21
604 0.28
605 0.35
606 0.33
607 0.32
608 0.32
609 0.32
610 0.33
611 0.35
612 0.33
613 0.29
614 0.31
615 0.35
616 0.37
617 0.38
618 0.43
619 0.41
620 0.36
621 0.4
622 0.39
623 0.41
624 0.4
625 0.38
626 0.32
627 0.31
628 0.32
629 0.25
630 0.23
631 0.18
632 0.21
633 0.26
634 0.26
635 0.25
636 0.22
637 0.2
638 0.21
639 0.2
640 0.17
641 0.13
642 0.17
643 0.17
644 0.17