FuNGI

N1PFK6

Protein Details

Accession

N1PFK6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-62	VVNIFNSKRKPPVRKAPPPTQQKPNPPVRAL	Hydrophilic
190-211	SDPVKAGKKKPSKKVEEGRDNS	Basic
415-439	EQAEAKKQKRARRLLRKNEHQGQYE	Hydrophilic
555-575	TDTSRKGRTKLKLKNSPPGSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-48	KRKPPVRKAP
194-203	KAGKKKPSKK
419-431	AKKQKRARRLLRK
493-502	GRPEKRTKRP
560-600	KGRTKLKLKNSPPGSPSTGTPAGSRAGSPTPGGKPKAKKPV

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MGASPAQQPSGPSSVTPTAGGLPAPIVRRKPVVNIFNSKRKPPVRKAPPPTQQKPNPPVRALDGAPAQSLAIGATDAAPPAGEAGTYDEYPIYITKDPVTTTGQRFHVAKLQARFDETTKETVQVNPFDEKDFVRPLRLHRRFARDKMEALEQSDAAGADDKERELMSARRAERQAEREENQKLIAPSGSDPVKAGKKKPSKKVEEGRDNSDPVRQKRQQLRYEEARPWHLEDFESKNIWVGSYEQALSEGSLMFKVEPSGFRVVPIEKWYKFTQTNKVNAMDPEEAEKHMNKKFNVGRWAMKTQPGGTGMKQEYQIMQRRPVTRPTRDDEDDGPIWGDDTGDFQADRDMLDMEFNDEFQDDDEGALFQDFDGEDGKEIEARLRLEMREAGLGGTGVKDEEIDTYEEERKKQEVEQAEAKKQKRARRLLRKNEHQGQYETDESDLDPYADSDDSEDSEEEREREEEQKKEEAKRWANGDKSGASSRGTNTPSGRPEKRTKRPGSADASEASGNESSRKRVKGANGAAIPATHGSARSLSPDAAKSTLGAGSGSDTDTSRKGRTKLKLKNSPPGSPSTGTPAGSRAGSPTPGGKPKAKKPVASSKPFPTLEEIRAAIPADGIEVKQILDIFRPRLGAKGKEFIALVKQAGVTDKITGKIVPKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.26
4	0.22
5	0.2
6	0.2
7	0.2
8	0.14
9	0.13
10	0.16
11	0.2
12	0.24
13	0.25
14	0.28
15	0.33
16	0.34
17	0.41
18	0.47
19	0.51
20	0.53
21	0.61
22	0.65
23	0.71
24	0.74
25	0.7
26	0.7
27	0.72
28	0.74
29	0.73
30	0.77
31	0.77
32	0.83
33	0.88
34	0.88
35	0.89
36	0.89
37	0.87
38	0.87
39	0.84
40	0.84
41	0.85
42	0.84
43	0.83
44	0.74
45	0.69
46	0.64
47	0.61
48	0.51
49	0.47
50	0.4
51	0.33
52	0.31
53	0.28
54	0.22
55	0.16
56	0.15
57	0.1
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.1
72	0.13
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.14
78	0.15
79	0.13
80	0.12
81	0.14
82	0.16
83	0.18
84	0.18
85	0.2
86	0.25
87	0.28
88	0.3
89	0.36
90	0.36
91	0.38
92	0.38
93	0.38
94	0.39
95	0.38
96	0.4
97	0.39
98	0.42
99	0.4
100	0.42
101	0.42
102	0.36
103	0.38
104	0.34
105	0.33
106	0.28
107	0.29
108	0.27
109	0.29
110	0.33
111	0.29
112	0.3
113	0.29
114	0.29
115	0.28
116	0.29
117	0.26
118	0.25
119	0.29
120	0.27
121	0.28
122	0.3
123	0.37
124	0.47
125	0.52
126	0.56
127	0.57
128	0.66
129	0.69
130	0.73
131	0.73
132	0.65
133	0.61
134	0.57
135	0.56
136	0.47
137	0.41
138	0.36
139	0.27
140	0.24
141	0.22
142	0.18
143	0.11
144	0.12
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.15
154	0.18
155	0.25
156	0.27
157	0.32
158	0.34
159	0.38
160	0.41
161	0.44
162	0.47
163	0.46
164	0.47
165	0.47
166	0.48
167	0.45
168	0.39
169	0.37
170	0.29
171	0.23
172	0.22
173	0.16
174	0.14
175	0.18
176	0.18
177	0.15
178	0.15
179	0.19
180	0.26
181	0.28
182	0.32
183	0.37
184	0.47
185	0.55
186	0.65
187	0.7
188	0.71
189	0.78
190	0.83
191	0.83
192	0.84
193	0.79
194	0.76
195	0.69
196	0.63
197	0.53
198	0.49
199	0.46
200	0.4
201	0.46
202	0.43
203	0.49
204	0.57
205	0.66
206	0.67
207	0.66
208	0.69
209	0.67
210	0.69
211	0.65
212	0.59
213	0.53
214	0.48
215	0.44
216	0.38
217	0.3
218	0.25
219	0.24
220	0.26
221	0.25
222	0.24
223	0.21
224	0.21
225	0.2
226	0.2
227	0.16
228	0.12
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.1
233	0.11
234	0.1
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.11
247	0.14
248	0.14
249	0.15
250	0.17
251	0.16
252	0.17
253	0.21
254	0.24
255	0.21
256	0.25
257	0.26
258	0.29
259	0.33
260	0.36
261	0.41
262	0.41
263	0.46
264	0.46
265	0.46
266	0.43
267	0.38
268	0.38
269	0.29
270	0.23
271	0.2
272	0.18
273	0.17
274	0.17
275	0.18
276	0.18
277	0.21
278	0.25
279	0.22
280	0.3
281	0.33
282	0.37
283	0.41
284	0.4
285	0.41
286	0.41
287	0.44
288	0.38
289	0.38
290	0.33
291	0.28
292	0.27
293	0.25
294	0.22
295	0.18
296	0.23
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.19
301	0.18
302	0.23
303	0.3
304	0.25
305	0.29
306	0.32
307	0.35
308	0.37
309	0.44
310	0.45
311	0.44
312	0.48
313	0.47
314	0.49
315	0.47
316	0.47
317	0.39
318	0.37
319	0.31
320	0.26
321	0.22
322	0.15
323	0.13
324	0.11
325	0.09
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.14
374	0.13
375	0.11
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.06
389	0.07
390	0.08
391	0.11
392	0.17
393	0.18
394	0.19
395	0.2
396	0.2
397	0.21
398	0.22
399	0.25
400	0.23
401	0.27
402	0.35
403	0.38
404	0.43
405	0.49
406	0.49
407	0.49
408	0.51
409	0.52
410	0.53
411	0.59
412	0.63
413	0.67
414	0.77
415	0.82
416	0.87
417	0.9
418	0.9
419	0.89
420	0.84
421	0.75
422	0.66
423	0.58
424	0.52
425	0.43
426	0.34
427	0.25
428	0.19
429	0.16
430	0.15
431	0.12
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.1
445	0.12
446	0.11
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.21
451	0.25
452	0.27
453	0.3
454	0.37
455	0.41
456	0.46
457	0.5
458	0.52
459	0.52
460	0.53
461	0.56
462	0.54
463	0.52
464	0.49
465	0.46
466	0.38
467	0.36
468	0.34
469	0.29
470	0.24
471	0.23
472	0.22
473	0.26
474	0.26
475	0.25
476	0.26
477	0.31
478	0.36
479	0.43
480	0.45
481	0.46
482	0.55
483	0.62
484	0.69
485	0.74
486	0.74
487	0.75
488	0.78
489	0.78
490	0.76
491	0.68
492	0.6
493	0.5
494	0.46
495	0.36
496	0.29
497	0.23
498	0.17
499	0.14
500	0.17
501	0.18
502	0.21
503	0.27
504	0.29
505	0.3
506	0.34
507	0.4
508	0.45
509	0.49
510	0.52
511	0.47
512	0.46
513	0.43
514	0.38
515	0.32
516	0.22
517	0.17
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.13
524	0.15
525	0.15
526	0.17
527	0.19
528	0.21
529	0.2
530	0.2
531	0.17
532	0.16
533	0.16
534	0.14
535	0.11
536	0.09
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.12
543	0.16
544	0.19
545	0.23
546	0.28
547	0.33
548	0.41
549	0.5
550	0.58
551	0.65
552	0.72
553	0.78
554	0.78
555	0.83
556	0.81
557	0.77
558	0.69
559	0.65
560	0.6
561	0.51
562	0.46
563	0.43
564	0.4
565	0.34
566	0.32
567	0.28
568	0.25
569	0.23
570	0.23
571	0.18
572	0.18
573	0.18
574	0.19
575	0.22
576	0.27
577	0.34
578	0.38
579	0.43
580	0.49
581	0.57
582	0.66
583	0.67
584	0.66
585	0.67
586	0.73
587	0.75
588	0.76
589	0.73
590	0.69
591	0.73
592	0.68
593	0.61
594	0.57
595	0.52
596	0.46
597	0.44
598	0.38
599	0.29
600	0.3
601	0.29
602	0.22
603	0.17
604	0.14
605	0.11
606	0.11
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.11
612	0.12
613	0.11
614	0.16
615	0.21
616	0.22
617	0.24
618	0.27
619	0.26
620	0.32
621	0.38
622	0.39
623	0.4
624	0.44
625	0.43
626	0.43
627	0.43
628	0.38
629	0.38
630	0.33
631	0.29
632	0.23
633	0.23
634	0.21
635	0.23
636	0.24
637	0.19
638	0.2
639	0.22
640	0.22
641	0.23
642	0.25

N1PFK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer