Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PMD8

Protein Details
Accession N1PMD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-56PAFASIPKTTSKKKKKKKKAKNTGGTETPENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-46SKKKKKKKKAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MLLEDELEPEDADDDIEEDHTTTEAPAFASIPKTTSKKKKKKKKAKNTGGTETPENGRGQELDEIDAALKELSMSKNASQAATTAGIDQKVNESSKLLAIDTNHLHAQNEMRRLFGRAALQQDDDEQPAPEAVGGNRRQQRRVQQVGLAQALRGQQQGGRSGLSAIALRRNILVQGKEEWPMATSGGLSMDVEEKRADGTVLYRFVHNAAYQDVQSQFETCVASMDPMLRLNPYHISTLLQVSEIAKQDRDHATSGDLLERALFSFGRAVHSTFAKNLAEGKARLDFRRAENREFWLASWRYMQNLTMRATWRTVYEWAKLLLSLSPEDDPYALWLVLDQYALRSRQDLDFLNISRNAILSDVHRDMPNVQLSQGLAEFRAGNQGKGKQALFRAIGRYPWVVARLCQELNLDPPPGVWGKEARTEREKLHAELYATRAKDLWNTSETTALLNEIASALPPDTPSAAVDSEEISREEARHVLLSDVPALIALIPRSYTAQLESSSDPLPPEDSYMSYLSRVNGRARGGGDQMGLDQIENSVQEIQNLHQFFARLFPWFRRGGQAGDEPGNNDGAREGDQVEDEDALPPDQETLMRQVEEAGYTREEFEQRAQRLIALQDQLFGGGRGFGSEALAAIATEQINNAAIPHEDDEGQGVPSEFHQPRVEDDTEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.12
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.22
20 0.28
21 0.37
22 0.47
23 0.57
24 0.65
25 0.75
26 0.85
27 0.89
28 0.95
29 0.96
30 0.97
31 0.97
32 0.97
33 0.97
34 0.94
35 0.92
36 0.88
37 0.81
38 0.73
39 0.66
40 0.57
41 0.5
42 0.42
43 0.33
44 0.28
45 0.23
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.14
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.1
59 0.1
60 0.13
61 0.16
62 0.17
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.2
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.2
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.21
83 0.21
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.21
88 0.22
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.28
95 0.28
96 0.34
97 0.31
98 0.31
99 0.32
100 0.34
101 0.34
102 0.3
103 0.29
104 0.26
105 0.3
106 0.31
107 0.31
108 0.28
109 0.3
110 0.28
111 0.25
112 0.21
113 0.17
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.17
121 0.19
122 0.27
123 0.34
124 0.38
125 0.41
126 0.47
127 0.56
128 0.58
129 0.63
130 0.58
131 0.56
132 0.56
133 0.57
134 0.54
135 0.44
136 0.33
137 0.28
138 0.26
139 0.23
140 0.19
141 0.15
142 0.13
143 0.15
144 0.19
145 0.18
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.12
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.17
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.2
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.06
186 0.09
187 0.12
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.16
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.19
236 0.21
237 0.23
238 0.2
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.19
243 0.16
244 0.13
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.08
253 0.08
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.16
259 0.16
260 0.14
261 0.17
262 0.14
263 0.13
264 0.15
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.23
273 0.24
274 0.26
275 0.37
276 0.38
277 0.36
278 0.37
279 0.4
280 0.39
281 0.37
282 0.32
283 0.29
284 0.27
285 0.24
286 0.26
287 0.22
288 0.21
289 0.21
290 0.22
291 0.17
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.22
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.18
300 0.16
301 0.19
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.16
338 0.17
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.14
343 0.13
344 0.11
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.17
355 0.19
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.09
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.21
372 0.22
373 0.25
374 0.25
375 0.19
376 0.21
377 0.24
378 0.23
379 0.22
380 0.23
381 0.21
382 0.22
383 0.21
384 0.2
385 0.16
386 0.15
387 0.16
388 0.13
389 0.14
390 0.16
391 0.17
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.15
396 0.18
397 0.18
398 0.16
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.1
405 0.11
406 0.13
407 0.2
408 0.23
409 0.25
410 0.29
411 0.31
412 0.32
413 0.37
414 0.38
415 0.32
416 0.32
417 0.3
418 0.27
419 0.26
420 0.29
421 0.25
422 0.22
423 0.21
424 0.19
425 0.18
426 0.21
427 0.2
428 0.2
429 0.17
430 0.19
431 0.19
432 0.21
433 0.21
434 0.17
435 0.15
436 0.12
437 0.1
438 0.08
439 0.07
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.16
488 0.17
489 0.18
490 0.17
491 0.17
492 0.16
493 0.14
494 0.15
495 0.12
496 0.14
497 0.12
498 0.13
499 0.15
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.17
504 0.16
505 0.2
506 0.22
507 0.22
508 0.25
509 0.26
510 0.28
511 0.28
512 0.29
513 0.27
514 0.25
515 0.22
516 0.17
517 0.16
518 0.14
519 0.12
520 0.1
521 0.08
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.13
530 0.14
531 0.2
532 0.2
533 0.2
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.19
538 0.19
539 0.17
540 0.19
541 0.22
542 0.27
543 0.29
544 0.3
545 0.33
546 0.34
547 0.32
548 0.34
549 0.35
550 0.34
551 0.34
552 0.33
553 0.28
554 0.27
555 0.27
556 0.22
557 0.17
558 0.13
559 0.11
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.14
579 0.17
580 0.17
581 0.17
582 0.18
583 0.18
584 0.2
585 0.2
586 0.17
587 0.16
588 0.16
589 0.18
590 0.2
591 0.2
592 0.2
593 0.26
594 0.33
595 0.32
596 0.36
597 0.34
598 0.32
599 0.34
600 0.35
601 0.32
602 0.28
603 0.26
604 0.24
605 0.23
606 0.23
607 0.2
608 0.18
609 0.13
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.08
620 0.06
621 0.06
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.11
633 0.13
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.14
641 0.13
642 0.11
643 0.13
644 0.22
645 0.2
646 0.24
647 0.28
648 0.28
649 0.32
650 0.39
651 0.39