Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1Q1W5

Protein Details
Accession N1Q1W5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-122SLAARRKKPKTNEQASDPRMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR045241  Prp46/PLRG1-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAEVAVATPVPATVAAATPAEVTERAARAVRTSSKRTRETFAADFGQLSALRKPSQPAVAPTDPSPYDRAQKASVAARIRLEYADVKELPAALAQKQVNAATSLAARRKKPKTNEQASDPRMAKMIEDASTSTSRQQHGQANGTLTALTRIKGTVNAKLPPNANGPTPQRNTPSTSLVRRDTVRQQKPEWHPPWKLLRVISGHLGWVRALATEPGNQWFASGAGDRTIKIWDLATGTLKLTLTGHISSVRGLAVSPRHPYLFSCGEDKMVKCWDLETNKVIRHYHGHLSGVYTLSLHPTLDVLCTGGRDGVVRVWDMRTRSNIHVLGGHKQTVTDIVTQSTDPQIISSSLDSTVRMYDLAAGKTMGVLTHHKKGVRSLTTHPTEFTFASASPGQIKQWLCPKGDFMMNFEGHNSVINSLSVNEENVLFSGGDNGSVAFWDWKTGHRFQYEDSVAQPGSLDAEAGIMTSTFDQTGLRLITGEADKTIKVWKQDENATEETHPLDWRPTLGRQKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.1
9 0.12
10 0.16
11 0.16
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.22
16 0.29
17 0.36
18 0.38
19 0.46
20 0.54
21 0.6
22 0.68
23 0.68
24 0.68
25 0.64
26 0.64
27 0.58
28 0.54
29 0.49
30 0.41
31 0.38
32 0.32
33 0.29
34 0.23
35 0.22
36 0.2
37 0.21
38 0.22
39 0.24
40 0.27
41 0.29
42 0.34
43 0.36
44 0.37
45 0.42
46 0.43
47 0.44
48 0.42
49 0.43
50 0.37
51 0.35
52 0.34
53 0.29
54 0.32
55 0.33
56 0.36
57 0.32
58 0.33
59 0.36
60 0.37
61 0.4
62 0.37
63 0.37
64 0.35
65 0.34
66 0.33
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.22
71 0.26
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.22
76 0.19
77 0.18
78 0.17
79 0.11
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.2
84 0.21
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.12
89 0.15
90 0.19
91 0.24
92 0.29
93 0.32
94 0.41
95 0.49
96 0.57
97 0.63
98 0.69
99 0.73
100 0.78
101 0.8
102 0.79
103 0.81
104 0.75
105 0.74
106 0.64
107 0.54
108 0.45
109 0.39
110 0.3
111 0.23
112 0.23
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.29
124 0.32
125 0.35
126 0.39
127 0.37
128 0.35
129 0.34
130 0.31
131 0.26
132 0.19
133 0.18
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.17
140 0.19
141 0.22
142 0.26
143 0.29
144 0.31
145 0.35
146 0.35
147 0.32
148 0.35
149 0.29
150 0.26
151 0.28
152 0.31
153 0.36
154 0.38
155 0.38
156 0.38
157 0.39
158 0.43
159 0.39
160 0.41
161 0.38
162 0.4
163 0.42
164 0.4
165 0.42
166 0.38
167 0.4
168 0.43
169 0.48
170 0.5
171 0.5
172 0.51
173 0.57
174 0.63
175 0.69
176 0.65
177 0.62
178 0.56
179 0.58
180 0.63
181 0.58
182 0.54
183 0.43
184 0.42
185 0.36
186 0.36
187 0.32
188 0.24
189 0.21
190 0.18
191 0.18
192 0.13
193 0.11
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.18
248 0.19
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.2
253 0.22
254 0.21
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.21
264 0.23
265 0.24
266 0.27
267 0.27
268 0.23
269 0.25
270 0.26
271 0.26
272 0.24
273 0.24
274 0.21
275 0.22
276 0.22
277 0.18
278 0.14
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.22
307 0.24
308 0.29
309 0.28
310 0.26
311 0.29
312 0.28
313 0.3
314 0.28
315 0.27
316 0.21
317 0.2
318 0.2
319 0.17
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.11
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.08
353 0.07
354 0.13
355 0.17
356 0.23
357 0.26
358 0.28
359 0.29
360 0.34
361 0.41
362 0.4
363 0.4
364 0.4
365 0.46
366 0.49
367 0.49
368 0.44
369 0.37
370 0.35
371 0.31
372 0.26
373 0.18
374 0.13
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.17
381 0.21
382 0.21
383 0.21
384 0.29
385 0.33
386 0.32
387 0.32
388 0.34
389 0.32
390 0.36
391 0.32
392 0.28
393 0.3
394 0.29
395 0.28
396 0.26
397 0.24
398 0.19
399 0.2
400 0.17
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.08
415 0.07
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.12
427 0.13
428 0.18
429 0.24
430 0.29
431 0.35
432 0.36
433 0.38
434 0.36
435 0.45
436 0.42
437 0.38
438 0.34
439 0.32
440 0.28
441 0.26
442 0.24
443 0.14
444 0.13
445 0.12
446 0.11
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.04
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.12
461 0.13
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.16
466 0.18
467 0.18
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.24
473 0.22
474 0.26
475 0.29
476 0.34
477 0.39
478 0.47
479 0.5
480 0.5
481 0.49
482 0.46
483 0.43
484 0.38
485 0.34
486 0.29
487 0.26
488 0.2
489 0.22
490 0.2
491 0.23
492 0.25
493 0.32