Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PDR4

Protein Details
Accession N1PDR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-327DAVGPQKHGSPTRRRKRQPKKEAVDIEDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-318GSPTRRRKRQPKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006886  RNA_pol_III_Rpc5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04801  RPC5  
Amino Acid Sequences PTAVKTEDDPVVAEYDVFLTPPTEEQIYLLQYPNRVRSRPYNSKFGATPHAMRIKPNSGFLEMDIKLSTENNFNKYMGLKWGDANKSAQELHNASGTYGPAAGLAPAKPRGPGGRNQAKDKGDRELGIENDLRAFRDAERNDRVHAKQTLGGQLIRHDSEAEAGKPHYFVGAFQGDHLFLTKVDGTAQLRPNFHHLDAEEERARIAVSRAQAEAAGPQPQGPGRTIKQQDESEIDKTTVEYKLGKALRQARTEGWIKMDYIDDEDQIAYDAFEKNLKVVNTVEAPVLKSEMDNDTFLDAVGPQKHGSPTRRRKRQPKKEAVDIEDEDMEDAEAGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.17
14 0.19
15 0.2
16 0.23
17 0.22
18 0.26
19 0.31
20 0.38
21 0.41
22 0.39
23 0.42
24 0.49
25 0.57
26 0.63
27 0.64
28 0.65
29 0.61
30 0.64
31 0.61
32 0.54
33 0.52
34 0.45
35 0.44
36 0.41
37 0.47
38 0.43
39 0.44
40 0.46
41 0.46
42 0.44
43 0.46
44 0.41
45 0.35
46 0.35
47 0.34
48 0.34
49 0.27
50 0.26
51 0.21
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.23
59 0.25
60 0.25
61 0.25
62 0.26
63 0.26
64 0.24
65 0.24
66 0.21
67 0.22
68 0.3
69 0.3
70 0.31
71 0.31
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.22
80 0.21
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.15
97 0.19
98 0.21
99 0.27
100 0.34
101 0.41
102 0.45
103 0.49
104 0.54
105 0.52
106 0.54
107 0.49
108 0.44
109 0.37
110 0.34
111 0.31
112 0.28
113 0.25
114 0.23
115 0.22
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.18
124 0.2
125 0.24
126 0.29
127 0.29
128 0.3
129 0.35
130 0.35
131 0.32
132 0.33
133 0.28
134 0.25
135 0.26
136 0.28
137 0.24
138 0.24
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.09
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.1
173 0.16
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.24
182 0.19
183 0.22
184 0.23
185 0.27
186 0.24
187 0.21
188 0.21
189 0.19
190 0.19
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.17
210 0.17
211 0.26
212 0.3
213 0.32
214 0.37
215 0.36
216 0.38
217 0.37
218 0.38
219 0.32
220 0.29
221 0.26
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.2
230 0.22
231 0.23
232 0.27
233 0.35
234 0.4
235 0.42
236 0.44
237 0.37
238 0.41
239 0.44
240 0.38
241 0.33
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.24
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.18
271 0.19
272 0.17
273 0.17
274 0.14
275 0.11
276 0.13
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.14
285 0.1
286 0.13
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.19
291 0.24
292 0.31
293 0.39
294 0.45
295 0.54
296 0.64
297 0.74
298 0.82
299 0.88
300 0.92
301 0.95
302 0.95
303 0.95
304 0.93
305 0.93
306 0.91
307 0.84
308 0.81
309 0.72
310 0.64
311 0.53
312 0.44
313 0.34
314 0.25
315 0.2