Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PVA9

Protein Details
Accession N1PVA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-452MDETPEHRANKKRERLRKEMQNKHPVKKKKRKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-452RANKKRERLRKEMQNKHPVKKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MVSPNTWKLLDFGQDLPRLLVKTRFDEEGYEIQLTDLSRIWGETLKYNAIVERAAEERCSIDPSENDQYQILLDKIDGSFSGAKGTTLELHYEDGENDLSLDLSAPLPGCLPPLKWMIRFEQRRQSDIAEELVKPLLQQANRLRHQIQFLVDEVTAKDRVIGKITDRLESSGNDLTTVFPGVSNIKPNRKRSQKQQLAAHVEGLADFDEATWRASILPKFDHFEVSPTLLNDILADLPAPGSSEFKENAREEWWEAIGRGKRGNVERGAHNTSCWAKRGGGVGSVQPKLSNGEGAEDDDFQKQETPPHLNNRSRDALADDDETEDEDDLDALGAIGGRKASPTPSKIDGPLAEESLPPRSKQRAMLGPYGGKKKSSTPETEDEEPVGWIPKPKSKLGAFGGRAKEPATRKVDRLSEEATMDETPEHRANKKRERLRKEMQNKHPVKKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.34
4 0.34
5 0.3
6 0.3
7 0.32
8 0.29
9 0.32
10 0.35
11 0.36
12 0.33
13 0.35
14 0.37
15 0.36
16 0.34
17 0.29
18 0.26
19 0.23
20 0.24
21 0.22
22 0.18
23 0.14
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.19
31 0.22
32 0.23
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.21
37 0.2
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.18
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.25
51 0.33
52 0.31
53 0.31
54 0.28
55 0.28
56 0.25
57 0.25
58 0.19
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.13
67 0.12
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.16
76 0.13
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.13
100 0.2
101 0.23
102 0.25
103 0.28
104 0.33
105 0.41
106 0.48
107 0.51
108 0.55
109 0.54
110 0.53
111 0.53
112 0.48
113 0.41
114 0.35
115 0.32
116 0.25
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.14
122 0.16
123 0.17
124 0.14
125 0.22
126 0.28
127 0.37
128 0.4
129 0.44
130 0.42
131 0.41
132 0.44
133 0.39
134 0.33
135 0.25
136 0.23
137 0.22
138 0.2
139 0.18
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.21
154 0.22
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.18
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.09
166 0.05
167 0.07
168 0.09
169 0.1
170 0.17
171 0.21
172 0.3
173 0.37
174 0.44
175 0.53
176 0.61
177 0.65
178 0.68
179 0.75
180 0.74
181 0.75
182 0.75
183 0.74
184 0.7
185 0.65
186 0.55
187 0.44
188 0.35
189 0.27
190 0.21
191 0.13
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.15
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.16
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.21
249 0.23
250 0.28
251 0.27
252 0.28
253 0.29
254 0.34
255 0.38
256 0.34
257 0.31
258 0.3
259 0.3
260 0.29
261 0.27
262 0.23
263 0.18
264 0.21
265 0.24
266 0.21
267 0.18
268 0.17
269 0.2
270 0.23
271 0.23
272 0.21
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.11
288 0.13
289 0.12
290 0.15
291 0.19
292 0.24
293 0.28
294 0.37
295 0.46
296 0.49
297 0.51
298 0.54
299 0.53
300 0.47
301 0.43
302 0.36
303 0.3
304 0.26
305 0.25
306 0.19
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.13
311 0.11
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.12
328 0.17
329 0.2
330 0.24
331 0.28
332 0.31
333 0.32
334 0.36
335 0.32
336 0.3
337 0.29
338 0.25
339 0.22
340 0.2
341 0.2
342 0.24
343 0.24
344 0.21
345 0.25
346 0.29
347 0.32
348 0.37
349 0.44
350 0.44
351 0.48
352 0.53
353 0.52
354 0.53
355 0.55
356 0.57
357 0.5
358 0.43
359 0.4
360 0.41
361 0.45
362 0.46
363 0.46
364 0.46
365 0.51
366 0.56
367 0.59
368 0.53
369 0.45
370 0.39
371 0.33
372 0.27
373 0.22
374 0.17
375 0.19
376 0.21
377 0.27
378 0.3
379 0.32
380 0.39
381 0.39
382 0.46
383 0.46
384 0.53
385 0.5
386 0.54
387 0.56
388 0.5
389 0.49
390 0.42
391 0.42
392 0.37
393 0.42
394 0.41
395 0.41
396 0.43
397 0.5
398 0.55
399 0.52
400 0.52
401 0.46
402 0.41
403 0.38
404 0.35
405 0.3
406 0.24
407 0.21
408 0.18
409 0.15
410 0.17
411 0.22
412 0.26
413 0.3
414 0.39
415 0.49
416 0.58
417 0.68
418 0.73
419 0.78
420 0.83
421 0.86
422 0.87
423 0.88
424 0.88
425 0.89
426 0.89
427 0.89
428 0.89
429 0.89
430 0.89
431 0.88
432 0.89