FuNGI

M2YLP0

Protein Details

Accession

M2YLP0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-51	QDPASRQPSGRYRPRRDSSAS	Hydrophilic
202-224	ERPGQPRRKSSAQYRRNRNEPTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
356-365	KRRRRENVKK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MSSPSPRFSIDSIRSPVSPNSSRSAFPFPPQDPASRQPSGRYRPRRDSSASTLSVGSIGGSLDIQGRRGSTVLETSQNAISTLLQPPIVRTGLLPHTQATAVASGYKAPTTKDIPPVTLTNVPHVPPENFREYLHRVGPLFESFQRGRAEPEHSQWLKKDKELEKTDRFQEALERKLSRDTSAPTSPTISRQALSSVSSPVERPGQPRRKSSAQYRRNRNEPTPLSTIPVVYFDADFHLENPRTFDIVSERAEIVRPPPGIQNEEKAPNGTPLPPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEESVAKIQSLREDLRRLDQEVAVSGLEVAAKRRRRENVKKLGKATAQVQSVVEAVKKADDLVDEGEYDEASDQMDRVGKLICGEQEPGQDDQELIDLRRLKALQGLDSGLQELQLRIGTGYASRFTTILINDLRRHMEKVASHDTLKRWSRQRGITPTYMETSGDFRKDLLAALKGLEKVGHTEPASAAYREAVNKEMKSIIRKFLPSSSDDDADSMVSTSTRGGTKLSQQEKSSILARNLRALEPEDAEKLLVGVYTSVSEALRRVSTQTKVLLDITSSMDAPESKSSSRPSTSDGQLPNGAPVPPPKATVQEKLSQALDMSSLLGVAVDTAQTQITRVLKVRNEQSIRLPKELFLRYFTLNRLFADECEAVSGRGGNVLKGIINAQISGFVQVLGTSETERIATLLDVDNWSAVDFTEDQNVILQRILAAMSSDPAEWSKGAAPLWEEPEAGPHQNGSPNTANGADTPSTNGTPAKKETKAAYVDETRFILVASVSSLLPTIDAFLSLTSVLPSMTPQISTSLLEVLRMFDSRSRQLILGAGATRSAGLKNITTKHLALASQALSFVIALVPYMRECVRRHISGGQGNALAEFDKLKRVYQEHQSSLHDKLVDIMTSRSQTHVKAMLAIRFDGSASTDDKASPYMETLTKETSTLHRVLTKHLGEMDVSMIMRQIFSSYKEQWTKGFGEVDVKTDKGEKRLLKDAEAFESRLGKIEEFGDIGKEVLGVVQAKVAEGGGGKDEKKAGANSEKMEMMFDVEEANVEGDEQVEDEKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.45
3	0.46
4	0.45
5	0.44
6	0.39
7	0.41
8	0.41
9	0.41
10	0.42
11	0.47
12	0.41
13	0.41
14	0.46
15	0.41
16	0.47
17	0.48
18	0.49
19	0.46
20	0.5
21	0.52
22	0.48
23	0.48
24	0.49
25	0.56
26	0.6
27	0.65
28	0.69
29	0.72
30	0.77
31	0.83
32	0.82
33	0.79
34	0.77
35	0.75
36	0.73
37	0.65
38	0.56
39	0.5
40	0.42
41	0.36
42	0.27
43	0.19
44	0.1
45	0.08
46	0.06
47	0.06
48	0.06
49	0.11
50	0.12
51	0.13
52	0.14
53	0.15
54	0.16
55	0.16
56	0.17
57	0.14
58	0.18
59	0.2
60	0.24
61	0.24
62	0.26
63	0.27
64	0.26
65	0.25
66	0.2
67	0.18
68	0.17
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.17
73	0.19
74	0.23
75	0.22
76	0.19
77	0.16
78	0.21
79	0.25
80	0.28
81	0.28
82	0.24
83	0.25
84	0.25
85	0.25
86	0.2
87	0.15
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.13
93	0.14
94	0.14
95	0.14
96	0.19
97	0.23
98	0.28
99	0.35
100	0.36
101	0.37
102	0.39
103	0.4
104	0.4
105	0.41
106	0.36
107	0.33
108	0.34
109	0.32
110	0.32
111	0.34
112	0.31
113	0.3
114	0.36
115	0.35
116	0.34
117	0.34
118	0.38
119	0.4
120	0.43
121	0.41
122	0.39
123	0.33
124	0.34
125	0.35
126	0.31
127	0.29
128	0.25
129	0.29
130	0.26
131	0.31
132	0.32
133	0.29
134	0.31
135	0.31
136	0.36
137	0.33
138	0.37
139	0.43
140	0.42
141	0.45
142	0.46
143	0.51
144	0.47
145	0.47
146	0.52
147	0.47
148	0.55
149	0.6
150	0.65
151	0.64
152	0.67
153	0.68
154	0.62
155	0.56
156	0.46
157	0.47
158	0.44
159	0.41
160	0.41
161	0.38
162	0.35
163	0.42
164	0.42
165	0.35
166	0.34
167	0.33
168	0.34
169	0.37
170	0.38
171	0.32
172	0.35
173	0.34
174	0.34
175	0.35
176	0.3
177	0.25
178	0.25
179	0.26
180	0.23
181	0.24
182	0.22
183	0.18
184	0.17
185	0.18
186	0.17
187	0.18
188	0.22
189	0.22
190	0.27
191	0.36
192	0.44
193	0.5
194	0.56
195	0.61
196	0.63
197	0.68
198	0.73
199	0.73
200	0.74
201	0.78
202	0.82
203	0.83
204	0.83
205	0.83
206	0.77
207	0.76
208	0.71
209	0.67
210	0.62
211	0.54
212	0.49
213	0.43
214	0.39
215	0.29
216	0.26
217	0.2
218	0.14
219	0.13
220	0.1
221	0.12
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.18
226	0.19
227	0.19
228	0.23
229	0.22
230	0.21
231	0.21
232	0.22
233	0.19
234	0.21
235	0.23
236	0.22
237	0.21
238	0.2
239	0.21
240	0.21
241	0.18
242	0.19
243	0.18
244	0.17
245	0.22
246	0.24
247	0.28
248	0.3
249	0.33
250	0.32
251	0.35
252	0.34
253	0.31
254	0.28
255	0.26
256	0.26
257	0.26
258	0.29
259	0.33
260	0.38
261	0.39
262	0.39
263	0.4
264	0.42
265	0.4
266	0.39
267	0.34
268	0.32
269	0.34
270	0.34
271	0.31
272	0.27
273	0.25
274	0.19
275	0.18
276	0.15
277	0.11
278	0.11
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.16
322	0.19
323	0.2
324	0.23
325	0.24
326	0.3
327	0.32
328	0.32
329	0.3
330	0.28
331	0.24
332	0.21
333	0.21
334	0.14
335	0.11
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.09
341	0.15
342	0.21
343	0.24
344	0.3
345	0.38
346	0.48
347	0.59
348	0.66
349	0.7
350	0.76
351	0.8
352	0.76
353	0.75
354	0.66
355	0.58
356	0.51
357	0.46
358	0.37
359	0.31
360	0.28
361	0.22
362	0.21
363	0.18
364	0.14
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.06
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.08
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.11
393	0.11
394	0.1
395	0.12
396	0.13
397	0.14
398	0.16
399	0.17
400	0.16
401	0.15
402	0.13
403	0.12
404	0.13
405	0.11
406	0.09
407	0.12
408	0.14
409	0.14
410	0.17
411	0.17
412	0.15
413	0.19
414	0.19
415	0.17
416	0.16
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.15
421	0.1
422	0.1
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.06
430	0.05
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.11
439	0.1
440	0.13
441	0.14
442	0.16
443	0.17
444	0.19
445	0.22
446	0.21
447	0.22
448	0.19
449	0.2
450	0.19
451	0.25
452	0.29
453	0.28
454	0.28
455	0.3
456	0.3
457	0.35
458	0.36
459	0.36
460	0.36
461	0.4
462	0.46
463	0.48
464	0.55
465	0.55
466	0.57
467	0.54
468	0.5
469	0.45
470	0.4
471	0.35
472	0.27
473	0.19
474	0.18
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.1
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.11
487	0.11
488	0.11
489	0.1
490	0.08
491	0.1
492	0.11
493	0.14
494	0.12
495	0.12
496	0.12
497	0.16
498	0.17
499	0.14
500	0.13
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.13
505	0.12
506	0.14
507	0.13
508	0.14
509	0.17
510	0.17
511	0.22
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.25
516	0.25
517	0.26
518	0.26
519	0.22
520	0.25
521	0.23
522	0.21
523	0.2
524	0.19
525	0.16
526	0.14
527	0.12
528	0.07
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.08
538	0.14
539	0.23
540	0.27
541	0.28
542	0.29
543	0.31
544	0.31
545	0.32
546	0.3
547	0.24
548	0.23
549	0.25
550	0.24
551	0.27
552	0.26
553	0.25
554	0.22
555	0.21
556	0.19
557	0.15
558	0.16
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.09
563	0.07
564	0.06
565	0.05
566	0.04
567	0.03
568	0.03
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.09
579	0.13
580	0.14
581	0.17
582	0.19
583	0.18
584	0.19
585	0.2
586	0.17
587	0.13
588	0.13
589	0.12
590	0.1
591	0.09
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.12
600	0.15
601	0.18
602	0.2
603	0.19
604	0.21
605	0.25
606	0.26
607	0.3
608	0.28
609	0.27
610	0.27
611	0.27
612	0.24
613	0.2
614	0.18
615	0.13
616	0.14
617	0.15
618	0.14
619	0.16
620	0.15
621	0.21
622	0.24
623	0.28
624	0.29
625	0.31
626	0.32
627	0.32
628	0.32
629	0.25
630	0.22
631	0.17
632	0.14
633	0.08
634	0.07
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.02
643	0.03
644	0.03
645	0.04
646	0.04
647	0.05
648	0.08
649	0.09
650	0.11
651	0.13
652	0.17
653	0.2
654	0.25
655	0.29
656	0.34
657	0.35
658	0.35
659	0.41
660	0.47
661	0.47
662	0.46
663	0.41
664	0.35
665	0.4
666	0.42
667	0.35
668	0.28
669	0.28
670	0.27
671	0.28
672	0.29
673	0.26
674	0.24
675	0.23
676	0.23
677	0.21
678	0.19
679	0.22
680	0.2
681	0.15
682	0.16
683	0.16
684	0.12
685	0.11
686	0.12
687	0.06
688	0.1
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.1
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.07
700	0.08
701	0.08
702	0.09
703	0.08
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.06
716	0.06
717	0.05
718	0.06
719	0.07
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.06
727	0.05
728	0.06
729	0.07
730	0.07
731	0.11
732	0.11
733	0.11
734	0.13
735	0.14
736	0.13
737	0.12
738	0.11
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.08
751	0.07
752	0.09
753	0.1
754	0.11
755	0.11
756	0.11
757	0.13
758	0.14
759	0.18
760	0.17
761	0.16
762	0.13
763	0.17
764	0.19
765	0.18
766	0.15
767	0.13
768	0.14
769	0.19
770	0.19
771	0.21
772	0.21
773	0.2
774	0.22
775	0.22
776	0.2
777	0.16
778	0.19
779	0.14
780	0.11
781	0.14
782	0.15
783	0.14
784	0.15
785	0.17
786	0.16
787	0.19
788	0.25
789	0.29
790	0.28
791	0.31
792	0.33
793	0.37
794	0.38
795	0.36
796	0.36
797	0.36
798	0.36
799	0.35
800	0.33
801	0.26
802	0.23
803	0.21
804	0.15
805	0.09
806	0.07
807	0.06
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.07
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.05
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.07
823	0.05
824	0.06
825	0.05
826	0.05
827	0.06
828	0.09
829	0.09
830	0.09
831	0.1
832	0.12
833	0.13
834	0.14
835	0.14
836	0.14
837	0.13
838	0.14
839	0.14
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.13
844	0.13
845	0.18
846	0.21
847	0.23
848	0.23
849	0.22
850	0.23
851	0.24
852	0.21
853	0.2
854	0.17
855	0.15
856	0.13
857	0.12
858	0.12
859	0.11
860	0.1
861	0.09
862	0.09
863	0.12
864	0.18
865	0.21
866	0.24
867	0.26
868	0.26
869	0.26
870	0.27
871	0.24
872	0.2
873	0.2
874	0.18
875	0.16
876	0.15
877	0.13
878	0.11
879	0.1
880	0.09
881	0.06
882	0.04
883	0.04
884	0.05
885	0.06
886	0.06
887	0.09
888	0.1
889	0.15
890	0.16
891	0.26
892	0.31
893	0.32
894	0.36
895	0.38
896	0.44
897	0.44
898	0.45
899	0.39
900	0.33
901	0.32
902	0.28
903	0.24
904	0.16
905	0.12
906	0.12
907	0.1
908	0.15
909	0.16
910	0.18
911	0.23
912	0.27
913	0.32
914	0.4
915	0.48
916	0.46
917	0.49
918	0.53
919	0.51
920	0.49
921	0.47
922	0.37
923	0.28
924	0.27
925	0.25
926	0.21
927	0.19
928	0.18
929	0.18
930	0.21
931	0.21
932	0.21
933	0.22
934	0.22
935	0.25
936	0.28
937	0.25
938	0.29
939	0.32
940	0.33
941	0.32
942	0.32
943	0.27
944	0.22
945	0.22
946	0.15
947	0.14
948	0.12
949	0.12
950	0.13
951	0.13
952	0.13
953	0.14
954	0.15
955	0.14
956	0.12
957	0.12
958	0.15
959	0.17
960	0.19
961	0.22
962	0.24
963	0.23
964	0.23
965	0.24
966	0.25
967	0.27
968	0.26
969	0.26
970	0.28
971	0.29
972	0.34
973	0.41
974	0.38
975	0.35
976	0.34
977	0.32
978	0.27
979	0.27
980	0.22
981	0.16
982	0.14
983	0.12
984	0.12
985	0.11
986	0.11
987	0.1
988	0.11
989	0.1
990	0.15
991	0.21
992	0.24
993	0.33
994	0.38
995	0.4
996	0.4
997	0.43
998	0.41
999	0.39
1000	0.37
1001	0.29
1002	0.31
1003	0.3
1004	0.32
1005	0.3
1006	0.28
1007	0.25
1008	0.29
1009	0.31
1010	0.29
1011	0.37
1012	0.38
1013	0.41
1014	0.5
1015	0.51
1016	0.49
1017	0.53
1018	0.51
1019	0.5
1020	0.48
1021	0.43
1022	0.36
1023	0.38
1024	0.33
1025	0.3
1026	0.29
1027	0.22
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.2
1031	0.17
1032	0.17
1033	0.15
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.1
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.11
1048	0.09
1049	0.09
1050	0.1
1051	0.11
1052	0.15
1053	0.16
1054	0.18
1055	0.2
1056	0.21
1057	0.24
1058	0.26
1059	0.29
1060	0.34
1061	0.39
1062	0.38
1063	0.41
1064	0.41
1065	0.37
1066	0.36
1067	0.29
1068	0.23
1069	0.18
1070	0.15
1071	0.13
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.07

M2YLP0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer