Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PZ86

Protein Details
Accession N1PZ86    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-324EKSNGDRKGSKSSKKDRRKSRPATSPTTPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-316EKSNGDRKGSKSSKKDRRKSRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MQQAGNDMHTYNLSLNRQALEENLRRRPGLEYMIVGQPQPHPDPALAAQGVTTGVYTIRKQDRQRAPPDVYLRPPHVLTEKSHDGKGSWELTVLGTYFAVGEAIYQAPSVFDIVGNRLLSAASSLNKFYNIADGLPRYTPATGYHYLPRSSKPVATATSATGTPARSREGSLAPATDSQSMRSGSVRPESQAGITSAAATLLETSLLAKSLEDSIRYGDEYTDENPLLGAPGTFYFQSSNTEVRKRREKEAAALKARLEQHTAMSSHTVVSTAEETVKIQSPPAVFTQERALKAEKSNGDRKGSKSSKKDRRKSRPATSPTTPASATSPQVPMSTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.28
8 0.33
9 0.38
10 0.44
11 0.46
12 0.45
13 0.46
14 0.46
15 0.42
16 0.39
17 0.34
18 0.29
19 0.29
20 0.34
21 0.33
22 0.29
23 0.26
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.24
31 0.24
32 0.27
33 0.21
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.12
39 0.1
40 0.05
41 0.06
42 0.09
43 0.1
44 0.18
45 0.26
46 0.33
47 0.38
48 0.48
49 0.57
50 0.63
51 0.7
52 0.7
53 0.67
54 0.67
55 0.69
56 0.64
57 0.6
58 0.56
59 0.52
60 0.47
61 0.42
62 0.38
63 0.36
64 0.33
65 0.29
66 0.32
67 0.37
68 0.37
69 0.37
70 0.35
71 0.31
72 0.31
73 0.33
74 0.27
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.13
81 0.09
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.08
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.15
129 0.16
130 0.18
131 0.22
132 0.24
133 0.26
134 0.26
135 0.26
136 0.25
137 0.25
138 0.24
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.21
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.13
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.18
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.13
225 0.14
226 0.19
227 0.23
228 0.31
229 0.36
230 0.42
231 0.52
232 0.52
233 0.56
234 0.6
235 0.59
236 0.6
237 0.64
238 0.67
239 0.61
240 0.59
241 0.53
242 0.5
243 0.5
244 0.42
245 0.35
246 0.26
247 0.24
248 0.26
249 0.26
250 0.21
251 0.2
252 0.19
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.15
266 0.14
267 0.17
268 0.17
269 0.19
270 0.2
271 0.24
272 0.21
273 0.22
274 0.31
275 0.33
276 0.34
277 0.35
278 0.36
279 0.33
280 0.37
281 0.43
282 0.41
283 0.42
284 0.49
285 0.51
286 0.56
287 0.57
288 0.57
289 0.6
290 0.63
291 0.65
292 0.67
293 0.72
294 0.76
295 0.82
296 0.88
297 0.89
298 0.91
299 0.93
300 0.93
301 0.92
302 0.92
303 0.89
304 0.87
305 0.82
306 0.79
307 0.71
308 0.65
309 0.54
310 0.45
311 0.42
312 0.38
313 0.34
314 0.3
315 0.29
316 0.26