Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DAC4

Protein Details
Accession B0DAC4    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-114DVDNTLKWIKRSKKKEKELAKKRQEEIDNHydrophilic
169-188AEEERRQKIKELKIKKRDYTBasic
268-293EGDFGFKKPKTKKKRPSRRAPADVEDBasic
674-699AQPLAKGKTEKAKKKKENQASKPAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-108IKRSKKKEKELAKKR
274-287KKPKTKKKRPSRRA
330-336RKAKLLK
601-627SHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKK
679-690KGKTEKAKKKKE
770-786KRKAGQEAAGSPPPKRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_297245  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPADDKDKQAEDNYAKQRDREAKDRQAKTIQDRITKVRNRRELNASLKGATLGDAEGDVDNTLKWIKRSKKKEKELAKKRQEEIDNRDKASEPEYSERDLVGLKVSHDFDGMDEGEAHILTLKDSRILDNEEDELQNVEMAEEERRQKIKELKIKKRDYTGYDDDEFTEGNQGVMKRSVLAKYDEDIEGTRETDFRLGSSITSGKREQAEQRQAATAAVNKSLLTIDYAKNLETRDYLQEGDFGFKKPKTKKKRPSRRAPADVEDILESKMDVDQPIVPRVRDLDANFVDDDELQAALARSRKAKLLKTKKLTPEELARKITERRELEMDASLKVEVVDDDKEETGLTFDDTSEFVRAVGSNQPLVKPKPEPKEIPVPNGRSEPQRSPSRDQVMVSGDIVLDELEAGEVRVKDEEDEDYDMAMMEAVDGLIRSVEAEGLAVDLDKSSLEDGVGTSSEQTFSTGMASTLSILRQQGIIAQPSAELGQRERRQLERDRFVADQRLRDAQREIDRLQSRGSNKDQAQREYENRLREQQDARDKMEAFKDYKPDVNIVYYDEFGRALTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKKEAMASGDTPLSMNKAFQQRQEKAGQAHFVLSVGNRGAVPQAEDFLDAQPLAKGKTEKAKKKKENQASKPAADAGFMTVPAPPVQIMSAGSSPGPSGLNSISGSPVPRAGFSRISSAVDTPSQSQGGTPVPADRAKVAFGLGLKRKAGQEAAGSPPPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.4
13 0.34
14 0.28
15 0.31
16 0.33
17 0.32
18 0.34
19 0.38
20 0.41
21 0.47
22 0.46
23 0.4
24 0.41
25 0.47
26 0.46
27 0.48
28 0.53
29 0.53
30 0.53
31 0.52
32 0.59
33 0.6
34 0.62
35 0.61
36 0.62
37 0.64
38 0.73
39 0.75
40 0.73
41 0.71
42 0.71
43 0.7
44 0.69
45 0.65
46 0.62
47 0.63
48 0.64
49 0.66
50 0.67
51 0.69
52 0.71
53 0.74
54 0.71
55 0.74
56 0.75
57 0.73
58 0.73
59 0.72
60 0.64
61 0.55
62 0.5
63 0.43
64 0.35
65 0.27
66 0.2
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.15
80 0.24
81 0.34
82 0.44
83 0.56
84 0.66
85 0.74
86 0.82
87 0.89
88 0.91
89 0.92
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.9
94 0.83
95 0.82
96 0.79
97 0.76
98 0.74
99 0.74
100 0.69
101 0.61
102 0.59
103 0.51
104 0.45
105 0.39
106 0.34
107 0.28
108 0.29
109 0.31
110 0.32
111 0.32
112 0.3
113 0.28
114 0.24
115 0.2
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.14
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.13
158 0.16
159 0.21
160 0.23
161 0.25
162 0.31
163 0.38
164 0.46
165 0.51
166 0.59
167 0.65
168 0.73
169 0.81
170 0.79
171 0.78
172 0.75
173 0.7
174 0.67
175 0.63
176 0.58
177 0.51
178 0.47
179 0.4
180 0.35
181 0.3
182 0.21
183 0.18
184 0.12
185 0.1
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.23
199 0.21
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.12
215 0.16
216 0.15
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.23
221 0.26
222 0.3
223 0.36
224 0.44
225 0.42
226 0.43
227 0.41
228 0.4
229 0.37
230 0.31
231 0.25
232 0.18
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.12
241 0.11
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.14
249 0.16
250 0.15
251 0.17
252 0.17
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.19
260 0.2
261 0.28
262 0.35
263 0.45
264 0.52
265 0.63
266 0.72
267 0.79
268 0.88
269 0.91
270 0.93
271 0.94
272 0.94
273 0.91
274 0.86
275 0.8
276 0.73
277 0.63
278 0.53
279 0.42
280 0.32
281 0.23
282 0.17
283 0.12
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.09
290 0.11
291 0.16
292 0.18
293 0.17
294 0.16
295 0.18
296 0.18
297 0.19
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.22
302 0.21
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.07
308 0.06
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.09
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.18
318 0.22
319 0.28
320 0.38
321 0.46
322 0.54
323 0.6
324 0.66
325 0.7
326 0.71
327 0.67
328 0.59
329 0.58
330 0.56
331 0.54
332 0.49
333 0.42
334 0.39
335 0.4
336 0.4
337 0.38
338 0.31
339 0.29
340 0.3
341 0.3
342 0.28
343 0.28
344 0.25
345 0.18
346 0.17
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.1
375 0.1
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.2
382 0.21
383 0.28
384 0.32
385 0.37
386 0.38
387 0.38
388 0.47
389 0.46
390 0.48
391 0.47
392 0.43
393 0.4
394 0.4
395 0.37
396 0.32
397 0.34
398 0.31
399 0.32
400 0.37
401 0.4
402 0.42
403 0.48
404 0.48
405 0.46
406 0.42
407 0.38
408 0.32
409 0.28
410 0.23
411 0.17
412 0.12
413 0.1
414 0.09
415 0.06
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.02
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.05
439 0.03
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.11
491 0.13
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.1
498 0.08
499 0.09
500 0.19
501 0.22
502 0.26
503 0.28
504 0.31
505 0.36
506 0.45
507 0.52
508 0.49
509 0.47
510 0.47
511 0.46
512 0.45
513 0.48
514 0.41
515 0.35
516 0.31
517 0.37
518 0.34
519 0.35
520 0.35
521 0.32
522 0.36
523 0.37
524 0.35
525 0.37
526 0.38
527 0.37
528 0.37
529 0.36
530 0.32
531 0.34
532 0.37
533 0.36
534 0.37
535 0.44
536 0.48
537 0.46
538 0.49
539 0.48
540 0.48
541 0.49
542 0.5
543 0.48
544 0.45
545 0.48
546 0.45
547 0.45
548 0.45
549 0.45
550 0.5
551 0.49
552 0.49
553 0.47
554 0.45
555 0.43
556 0.43
557 0.39
558 0.32
559 0.31
560 0.34
561 0.31
562 0.34
563 0.33
564 0.3
565 0.27
566 0.25
567 0.23
568 0.2
569 0.2
570 0.17
571 0.16
572 0.14
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.13
580 0.16
581 0.19
582 0.21
583 0.21
584 0.24
585 0.29
586 0.34
587 0.4
588 0.41
589 0.46
590 0.47
591 0.48
592 0.53
593 0.5
594 0.51
595 0.51
596 0.54
597 0.51
598 0.56
599 0.59
600 0.6
601 0.67
602 0.67
603 0.66
604 0.68
605 0.66
606 0.68
607 0.73
608 0.74
609 0.75
610 0.75
611 0.74
612 0.72
613 0.72
614 0.61
615 0.53
616 0.45
617 0.39
618 0.33
619 0.3
620 0.23
621 0.2
622 0.2
623 0.19
624 0.18
625 0.14
626 0.12
627 0.15
628 0.25
629 0.27
630 0.34
631 0.44
632 0.44
633 0.5
634 0.54
635 0.53
636 0.48
637 0.49
638 0.45
639 0.36
640 0.34
641 0.28
642 0.23
643 0.2
644 0.15
645 0.14
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.12
651 0.11
652 0.13
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.11
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.16
666 0.17
667 0.2
668 0.3
669 0.4
670 0.49
671 0.59
672 0.69
673 0.75
674 0.84
675 0.9
676 0.91
677 0.92
678 0.91
679 0.91
680 0.88
681 0.79
682 0.71
683 0.64
684 0.53
685 0.43
686 0.34
687 0.26
688 0.19
689 0.18
690 0.15
691 0.12
692 0.13
693 0.13
694 0.13
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.1
699 0.1
700 0.12
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.12
705 0.12
706 0.12
707 0.12
708 0.09
709 0.11
710 0.11
711 0.14
712 0.14
713 0.15
714 0.16
715 0.16
716 0.18
717 0.16
718 0.2
719 0.18
720 0.2
721 0.22
722 0.25
723 0.28
724 0.28
725 0.33
726 0.31
727 0.33
728 0.32
729 0.3
730 0.29
731 0.27
732 0.27
733 0.24
734 0.25
735 0.23
736 0.21
737 0.2
738 0.2
739 0.21
740 0.21
741 0.19
742 0.18
743 0.22
744 0.24
745 0.25
746 0.25
747 0.23
748 0.23
749 0.22
750 0.2
751 0.18
752 0.19
753 0.27
754 0.31
755 0.34
756 0.34
757 0.37
758 0.38
759 0.4
760 0.39
761 0.33
762 0.32
763 0.32
764 0.38
765 0.42
766 0.42