Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PN54

Protein Details
Accession N1PN54    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28ERQTARKSASPPPRKPKEPTPDLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MRQLERQTARKSASPPPRKPKEPTPDLTEVTSVLERKRRLTQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPQKLQAFMNQPGGEANKTALKPSTARQSKRLLIYNIPASATEDTIMDFFNLQLNGLNVTRGADPCISAQLSQDKAYALLEFKTPEDATNAMAFDGINMEPEAMVTSGNEDENGGARGLDIKRPKDYIVPVVTDGTENDAGVLSNVVPDTQNKISITNIPAYVDEEQTMELLNSFGELKNFVLVKDASTEESRGIAFCEYKDPNSTKVAVESLHGMTLGDAAMKVRLASIGIQQVSGEMSVNAMSLMAGTARADGEGGRVLSLMNMITPEELMDPDEADEILEDVKEECAKYGPLLDVKMPRPTGGSRQSNGIGKIYLKYESTESAAKALAALAGRKFADRTVVVTYFGEEYFDVNAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.7
3 0.74
4 0.8
5 0.81
6 0.84
7 0.84
8 0.84
9 0.83
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.68
14 0.62
15 0.52
16 0.42
17 0.36
18 0.33
19 0.27
20 0.25
21 0.3
22 0.31
23 0.34
24 0.43
25 0.45
26 0.49
27 0.56
28 0.61
29 0.65
30 0.74
31 0.76
32 0.69
33 0.66
34 0.61
35 0.57
36 0.5
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.34
41 0.31
42 0.29
43 0.23
44 0.2
45 0.18
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.15
53 0.17
54 0.19
55 0.23
56 0.22
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.35
61 0.41
62 0.47
63 0.45
64 0.48
65 0.46
66 0.46
67 0.45
68 0.41
69 0.38
70 0.33
71 0.38
72 0.33
73 0.3
74 0.29
75 0.31
76 0.26
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.21
85 0.24
86 0.34
87 0.37
88 0.4
89 0.44
90 0.5
91 0.53
92 0.57
93 0.6
94 0.52
95 0.47
96 0.5
97 0.48
98 0.42
99 0.36
100 0.3
101 0.26
102 0.23
103 0.19
104 0.14
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.1
180 0.1
181 0.15
182 0.19
183 0.2
184 0.22
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.26
190 0.24
191 0.23
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.17
196 0.15
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.09
212 0.1
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.12
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.11
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.21
264 0.22
265 0.24
266 0.26
267 0.27
268 0.21
269 0.21
270 0.21
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.09
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.1
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.16
356 0.18
357 0.19
358 0.23
359 0.29
360 0.31
361 0.37
362 0.35
363 0.32
364 0.33
365 0.34
366 0.39
367 0.42
368 0.46
369 0.41
370 0.45
371 0.49
372 0.51
373 0.49
374 0.43
375 0.35
376 0.29
377 0.3
378 0.27
379 0.25
380 0.21
381 0.21
382 0.21
383 0.21
384 0.23
385 0.24
386 0.22
387 0.22
388 0.21
389 0.19
390 0.17
391 0.15
392 0.14
393 0.12
394 0.14
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.19
399 0.19
400 0.18
401 0.23
402 0.2
403 0.23
404 0.26
405 0.26
406 0.27
407 0.27
408 0.28
409 0.23
410 0.22
411 0.2
412 0.14
413 0.14