Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CNS0

Protein Details
Accession B0CNS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-300GNGVNDTAKLPRKRKRRRRNTVTKPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-294KLPRKRKRRRRN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_321101  -  
Amino Acid Sequences MIVTTRPDYGSVAIDIGINNVDGLQTRDLVKSYLEQMPALRPLILVFKRFLEQRELNNASKSGLGSYAATLMCINFLQTNPCQRPREVLDNPFKMRSLGTILFDFLNYYGSQYPHDDSVYMSISEGKVLESDSAETKKLRLDIRCPISGGNTAKSLGASFLKDMIRSFKLCSAAILQSGATDRNVLGPVVSVDQNMIDKRTCIHDFVHSGNLDELCNFVAQTTSRWQNYKSQSGSGAFVMPALLPFPGSVEKSDEQQQRCFPESSRHGDRSVLDGNGVNDTAKLPRKRKRRRRNTVTKPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.13
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.26
25 0.28
26 0.26
27 0.21
28 0.16
29 0.16
30 0.24
31 0.25
32 0.23
33 0.22
34 0.23
35 0.26
36 0.28
37 0.29
38 0.29
39 0.31
40 0.34
41 0.43
42 0.46
43 0.45
44 0.46
45 0.44
46 0.36
47 0.33
48 0.28
49 0.18
50 0.14
51 0.12
52 0.1
53 0.1
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.14
66 0.24
67 0.29
68 0.36
69 0.38
70 0.38
71 0.43
72 0.45
73 0.52
74 0.48
75 0.51
76 0.53
77 0.56
78 0.58
79 0.53
80 0.48
81 0.39
82 0.33
83 0.26
84 0.22
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.1
93 0.09
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.16
126 0.19
127 0.19
128 0.22
129 0.29
130 0.34
131 0.34
132 0.33
133 0.29
134 0.26
135 0.29
136 0.26
137 0.19
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.11
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.21
192 0.23
193 0.25
194 0.3
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.23
199 0.18
200 0.15
201 0.14
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.1
209 0.15
210 0.21
211 0.24
212 0.26
213 0.28
214 0.35
215 0.42
216 0.48
217 0.44
218 0.4
219 0.4
220 0.4
221 0.4
222 0.32
223 0.27
224 0.18
225 0.16
226 0.14
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.07
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.17
238 0.18
239 0.21
240 0.3
241 0.35
242 0.36
243 0.41
244 0.45
245 0.45
246 0.48
247 0.47
248 0.4
249 0.43
250 0.46
251 0.49
252 0.52
253 0.49
254 0.47
255 0.48
256 0.47
257 0.43
258 0.4
259 0.32
260 0.25
261 0.25
262 0.24
263 0.23
264 0.22
265 0.16
266 0.13
267 0.14
268 0.19
269 0.25
270 0.33
271 0.4
272 0.49
273 0.6
274 0.72
275 0.82
276 0.87
277 0.89
278 0.92
279 0.94
280 0.97