Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DTS5

Protein Details
Accession B0DTS5    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-43QEARRAKALEEQKRRRAQRIDHydrophilic
104-134QVAAPAEPKKKPRKKNKKRNKPSKWADQCMYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-127EPKKKPRKKNKKRNKPSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_310241  -  
Amino Acid Sequences MFADRKSSYKLPPTTIRDQLVSQEARRAKALEEQKRRRAQRIDSSRQLDLFADLNLGGSDEDEDEDEPISLLTPACVAPYASMIEPSFPVNAITAPQPREVVIQVAAPAEPKKKPRKKNKKRNKPSKWADQCMYAELLEMSPEDPWSSTTDDLNDSLPHDLETGWVAVAPVPVGKRCLAVTHQSSGVAGVVPNTTLRSRLLGKTLIARFPSSLPPLTVLDCILDSNWRDNGILHILDVVKWKGQDVADCEAPFRFWWRDTRLAELSQTYPPSITFSHTETRPRYQFPYPTNLIPIPYHTNTSLSSLDISVIPMARTIRTIPVDVPILLPNPPLQDVSGNGMQVESATTPSFRAKGSIESVSTNVQPDGLLLYVSEASYEPGTSPLSSWIPITGYEKPDEPIGIHPLELFHRLVKRRLQGQPVGDGQGEGSMDMDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.64
4 0.56
5 0.52
6 0.5
7 0.48
8 0.45
9 0.38
10 0.39
11 0.4
12 0.39
13 0.4
14 0.37
15 0.3
16 0.35
17 0.44
18 0.46
19 0.54
20 0.61
21 0.69
22 0.78
23 0.81
24 0.82
25 0.8
26 0.78
27 0.78
28 0.8
29 0.79
30 0.79
31 0.78
32 0.72
33 0.64
34 0.56
35 0.46
36 0.37
37 0.28
38 0.19
39 0.15
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.11
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.14
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.21
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.19
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.2
98 0.28
99 0.39
100 0.48
101 0.58
102 0.68
103 0.77
104 0.84
105 0.91
106 0.94
107 0.94
108 0.96
109 0.97
110 0.97
111 0.96
112 0.93
113 0.93
114 0.92
115 0.87
116 0.78
117 0.73
118 0.63
119 0.54
120 0.46
121 0.34
122 0.25
123 0.17
124 0.15
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.18
167 0.2
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.09
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.23
191 0.24
192 0.24
193 0.22
194 0.21
195 0.19
196 0.2
197 0.22
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.14
233 0.17
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.16
238 0.17
239 0.14
240 0.15
241 0.13
242 0.13
243 0.19
244 0.23
245 0.31
246 0.32
247 0.37
248 0.36
249 0.35
250 0.34
251 0.3
252 0.28
253 0.22
254 0.22
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.15
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.21
264 0.23
265 0.29
266 0.31
267 0.37
268 0.38
269 0.39
270 0.41
271 0.41
272 0.45
273 0.42
274 0.46
275 0.42
276 0.4
277 0.4
278 0.36
279 0.33
280 0.26
281 0.27
282 0.25
283 0.24
284 0.25
285 0.21
286 0.22
287 0.21
288 0.24
289 0.21
290 0.15
291 0.15
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.15
305 0.17
306 0.18
307 0.16
308 0.19
309 0.2
310 0.19
311 0.19
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.17
324 0.18
325 0.16
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.1
336 0.12
337 0.14
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.19
342 0.23
343 0.25
344 0.24
345 0.25
346 0.26
347 0.26
348 0.25
349 0.22
350 0.18
351 0.15
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.08
367 0.1
368 0.12
369 0.11
370 0.12
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.17
378 0.21
379 0.22
380 0.24
381 0.25
382 0.26
383 0.26
384 0.27
385 0.25
386 0.23
387 0.21
388 0.23
389 0.22
390 0.21
391 0.2
392 0.2
393 0.22
394 0.23
395 0.2
396 0.2
397 0.27
398 0.32
399 0.38
400 0.44
401 0.49
402 0.56
403 0.62
404 0.65
405 0.65
406 0.64
407 0.65
408 0.6
409 0.56
410 0.46
411 0.39
412 0.3
413 0.26
414 0.22
415 0.14