Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DNN1

Protein Details
Accession B0DNN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
520-540GLKKKDKEKAERNQSRRRIRGBasic
830-849MKSYAKPSHKYPPKKGPSGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
522-541KKKDKEKAERNQSRRRIRGG
Subcellular Location(s) cysk 18, nucl 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_306768  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSLLLPYHKGILENIHDPATSELLILARGLGLRRIICTLMQIYDSPQNLVLLVNATPEEESGIGEELGIMGCRRPGLRVVGYETASKERKNLYKSGGLISVTSRILVVDMLQSDIPIELITGMLIMHAEQVTPLVLEAFIVRLYREKNKMGFVKAFTDQPEHITSGLSPLKNIMKELQLRTVRIYPRFHEDIKKSLERRRADVVELSQPLTEPMANIHHAIIQCMNTTLSELKRSNTTLDLDDFSVENAYFRSFDIIVRRQLDVVWHKVGPKTKQLVNDLATLRRLLYYLLTYDSLQFHAYLETLIASNTTTPTGGTKQHQSPWMLTDAANIIFGVAERRCYTISSTSKRVVPRVIDLVDDEDAWDALDEAEGRVGGKSKEKEHKPTWVPDGMDPVLEELPKWNLLSDVILEVEEEIIRQQTITRKPPTLGSNTILIMASSTKTCSLLTEFLSTMNHDAPSGTKGRKMMMQKLRVYLWWKSQLLARKQEGKTHFAMPDTSRRAGDGLDGLYGQNDDISEGLKKKDKEKAERNQSRRRIRGGGPTSSSGSRETKTASVDLGPDRVKARDDFSEFWAAQADVGEGPIELCDMQLLDFGSGALEDEFDVHYGLLPPEETVLIRAYSDDSDDRMLAEIEPKFIVMFEPNMEFIRRIEVYRSSSPGLGVRVYHMIYENSCEEHKYLAGIRREKESFERLIKERGTMLMPLLEERREGANEEILKTISSRVAGGRRTLNKEPSRVIVDMREFRSTLPSLLHASSLLVIPATLTIGDYILTPEICVERKSLSDLISSFNSGRLYTQCELMSVHYKHPILLIEFEEDKAFTLDTVTDMKSYAKPSHKYPPKKGPSGNGPESPYSGATIQSKIVLLTLTFPRLRIIWSSSPFATSEIFNDLKLNNPEPDPTKAIAMGTDDDPEAGAGVNGAAEEVLRCLPGISAKNVKYVMGKVGSLREFCELDIKGVQDILGVEPGKACWEFMHRGDRRWGRVVVMKPEIVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.26
4 0.26
5 0.27
6 0.22
7 0.17
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.09
14 0.07
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.22
26 0.2
27 0.21
28 0.19
29 0.21
30 0.27
31 0.27
32 0.24
33 0.23
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.16
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.16
63 0.22
64 0.26
65 0.29
66 0.34
67 0.37
68 0.38
69 0.39
70 0.38
71 0.39
72 0.38
73 0.35
74 0.34
75 0.37
76 0.43
77 0.45
78 0.48
79 0.46
80 0.49
81 0.51
82 0.5
83 0.46
84 0.39
85 0.35
86 0.31
87 0.29
88 0.22
89 0.2
90 0.16
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.06
104 0.06
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.11
130 0.16
131 0.24
132 0.29
133 0.34
134 0.36
135 0.44
136 0.49
137 0.51
138 0.51
139 0.46
140 0.46
141 0.42
142 0.42
143 0.36
144 0.35
145 0.3
146 0.29
147 0.29
148 0.25
149 0.23
150 0.2
151 0.18
152 0.21
153 0.26
154 0.22
155 0.19
156 0.22
157 0.27
158 0.27
159 0.28
160 0.24
161 0.26
162 0.32
163 0.35
164 0.41
165 0.39
166 0.4
167 0.42
168 0.47
169 0.46
170 0.46
171 0.47
172 0.4
173 0.45
174 0.48
175 0.47
176 0.49
177 0.47
178 0.48
179 0.51
180 0.57
181 0.54
182 0.56
183 0.61
184 0.56
185 0.57
186 0.57
187 0.52
188 0.47
189 0.46
190 0.43
191 0.41
192 0.39
193 0.36
194 0.28
195 0.25
196 0.23
197 0.19
198 0.16
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.13
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.1
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.21
218 0.21
219 0.22
220 0.25
221 0.27
222 0.27
223 0.26
224 0.27
225 0.22
226 0.23
227 0.23
228 0.2
229 0.2
230 0.17
231 0.15
232 0.14
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.1
241 0.12
242 0.2
243 0.24
244 0.29
245 0.3
246 0.31
247 0.28
248 0.28
249 0.33
250 0.3
251 0.3
252 0.28
253 0.27
254 0.28
255 0.32
256 0.38
257 0.34
258 0.38
259 0.38
260 0.39
261 0.44
262 0.46
263 0.48
264 0.43
265 0.46
266 0.4
267 0.36
268 0.33
269 0.28
270 0.24
271 0.19
272 0.17
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.11
302 0.15
303 0.17
304 0.23
305 0.27
306 0.31
307 0.36
308 0.35
309 0.34
310 0.32
311 0.32
312 0.26
313 0.22
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.1
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.16
330 0.21
331 0.29
332 0.32
333 0.36
334 0.38
335 0.42
336 0.43
337 0.43
338 0.38
339 0.32
340 0.3
341 0.3
342 0.28
343 0.24
344 0.22
345 0.21
346 0.18
347 0.16
348 0.12
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.13
365 0.16
366 0.23
367 0.32
368 0.37
369 0.45
370 0.46
371 0.55
372 0.53
373 0.55
374 0.53
375 0.48
376 0.44
377 0.37
378 0.39
379 0.3
380 0.26
381 0.21
382 0.17
383 0.14
384 0.12
385 0.11
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.06
408 0.13
409 0.19
410 0.26
411 0.3
412 0.31
413 0.32
414 0.37
415 0.38
416 0.36
417 0.33
418 0.28
419 0.26
420 0.24
421 0.24
422 0.2
423 0.16
424 0.11
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.09
434 0.1
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.1
448 0.13
449 0.12
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.2
454 0.23
455 0.3
456 0.34
457 0.41
458 0.41
459 0.43
460 0.43
461 0.4
462 0.4
463 0.33
464 0.31
465 0.3
466 0.28
467 0.26
468 0.28
469 0.33
470 0.35
471 0.39
472 0.37
473 0.39
474 0.39
475 0.45
476 0.45
477 0.41
478 0.38
479 0.35
480 0.33
481 0.24
482 0.26
483 0.21
484 0.26
485 0.27
486 0.25
487 0.22
488 0.21
489 0.21
490 0.19
491 0.18
492 0.11
493 0.08
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.06
506 0.07
507 0.09
508 0.13
509 0.15
510 0.19
511 0.26
512 0.32
513 0.41
514 0.49
515 0.57
516 0.64
517 0.72
518 0.77
519 0.8
520 0.82
521 0.81
522 0.76
523 0.7
524 0.64
525 0.58
526 0.6
527 0.55
528 0.49
529 0.43
530 0.4
531 0.38
532 0.33
533 0.31
534 0.24
535 0.21
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.16
540 0.17
541 0.16
542 0.14
543 0.12
544 0.14
545 0.14
546 0.15
547 0.14
548 0.14
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.15
553 0.17
554 0.17
555 0.21
556 0.21
557 0.23
558 0.27
559 0.26
560 0.25
561 0.23
562 0.19
563 0.15
564 0.13
565 0.11
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.04
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.08
609 0.08
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.08
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.1
627 0.07
628 0.07
629 0.08
630 0.09
631 0.1
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.1
636 0.14
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.19
641 0.24
642 0.26
643 0.29
644 0.25
645 0.25
646 0.25
647 0.24
648 0.21
649 0.16
650 0.14
651 0.13
652 0.14
653 0.14
654 0.14
655 0.13
656 0.12
657 0.12
658 0.15
659 0.14
660 0.13
661 0.13
662 0.14
663 0.13
664 0.13
665 0.12
666 0.11
667 0.15
668 0.19
669 0.26
670 0.31
671 0.32
672 0.37
673 0.37
674 0.38
675 0.38
676 0.36
677 0.35
678 0.35
679 0.39
680 0.36
681 0.41
682 0.39
683 0.36
684 0.32
685 0.28
686 0.25
687 0.19
688 0.17
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.14
693 0.13
694 0.11
695 0.12
696 0.14
697 0.12
698 0.14
699 0.13
700 0.17
701 0.18
702 0.19
703 0.19
704 0.17
705 0.17
706 0.15
707 0.15
708 0.11
709 0.1
710 0.1
711 0.13
712 0.18
713 0.2
714 0.23
715 0.29
716 0.34
717 0.41
718 0.45
719 0.51
720 0.51
721 0.53
722 0.52
723 0.48
724 0.46
725 0.4
726 0.36
727 0.32
728 0.34
729 0.36
730 0.36
731 0.34
732 0.3
733 0.3
734 0.33
735 0.29
736 0.24
737 0.18
738 0.18
739 0.19
740 0.19
741 0.19
742 0.14
743 0.13
744 0.13
745 0.12
746 0.09
747 0.06
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.04
753 0.04
754 0.04
755 0.04
756 0.05
757 0.05
758 0.06
759 0.07
760 0.07
761 0.06
762 0.07
763 0.1
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.13
769 0.18
770 0.19
771 0.18
772 0.2
773 0.2
774 0.22
775 0.21
776 0.23
777 0.19
778 0.19
779 0.19
780 0.16
781 0.17
782 0.16
783 0.21
784 0.2
785 0.23
786 0.2
787 0.2
788 0.21
789 0.22
790 0.29
791 0.25
792 0.27
793 0.29
794 0.3
795 0.29
796 0.3
797 0.29
798 0.22
799 0.23
800 0.22
801 0.19
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.16
806 0.15
807 0.13
808 0.12
809 0.08
810 0.08
811 0.07
812 0.09
813 0.12
814 0.11
815 0.11
816 0.12
817 0.14
818 0.17
819 0.21
820 0.27
821 0.32
822 0.35
823 0.4
824 0.51
825 0.58
826 0.65
827 0.7
828 0.74
829 0.75
830 0.8
831 0.8
832 0.77
833 0.77
834 0.77
835 0.74
836 0.68
837 0.62
838 0.55
839 0.52
840 0.45
841 0.35
842 0.28
843 0.22
844 0.2
845 0.19
846 0.19
847 0.18
848 0.17
849 0.17
850 0.15
851 0.15
852 0.12
853 0.1
854 0.13
855 0.15
856 0.19
857 0.2
858 0.2
859 0.21
860 0.21
861 0.23
862 0.22
863 0.26
864 0.28
865 0.31
866 0.35
867 0.34
868 0.35
869 0.34
870 0.31
871 0.26
872 0.19
873 0.17
874 0.19
875 0.19
876 0.17
877 0.19
878 0.18
879 0.24
880 0.28
881 0.3
882 0.27
883 0.27
884 0.32
885 0.33
886 0.38
887 0.35
888 0.32
889 0.3
890 0.28
891 0.27
892 0.23
893 0.22
894 0.2
895 0.16
896 0.17
897 0.15
898 0.14
899 0.14
900 0.12
901 0.1
902 0.07
903 0.06
904 0.04
905 0.04
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.03
910 0.04
911 0.04
912 0.06
913 0.06
914 0.06
915 0.07
916 0.07
917 0.08
918 0.14
919 0.18
920 0.22
921 0.31
922 0.32
923 0.38
924 0.38
925 0.39
926 0.36
927 0.35
928 0.35
929 0.29
930 0.29
931 0.26
932 0.33
933 0.35
934 0.33
935 0.32
936 0.29
937 0.27
938 0.26
939 0.31
940 0.24
941 0.24
942 0.25
943 0.25
944 0.21
945 0.21
946 0.2
947 0.14
948 0.15
949 0.13
950 0.15
951 0.15
952 0.14
953 0.15
954 0.15
955 0.18
956 0.17
957 0.16
958 0.13
959 0.19
960 0.24
961 0.29
962 0.39
963 0.39
964 0.44
965 0.54
966 0.59
967 0.59
968 0.6
969 0.57
970 0.51
971 0.56
972 0.58
973 0.56
974 0.54