Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PFA4

Protein Details
Accession N1PFA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-88EMNLDSLRKKRCKRLGIKGVKTFNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAAASDKARFYLEQYVPELQEYQQKGIFTREEITAITSKRSGFEHTLNARGSTPADYARYATYEMNLDSLRKKRCKRLGIKGVKTFNGQRTVFFVLDRATKKFPGDMGLWMQYIDFCRKEKASKKLAKVLTSVLRLHPRNSSLWILAAKHYAETQGDMGTARSYFQRGLRFCKDEAKLYLEYARLEMVYLAKLKARKQLLGLDENREKKTQDEDDNMITLPIITAEDIDPNAEKGLEEVNEDVLKRLESAPAFSGAIPTAIFDAAMKQFTTSRNAASVAESFYDLVATFENVHAAPTVLQHILSYLREQEASSVERVICDAKHELYAVDTQSAEFPPSLTKLLAVIKKGLGDVTEKKQPLLAEKAALLLLTYTAASTAGERELDADIAMVLAVSVKRYLRRYPISYIHRADHRAALATYALHPAGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.36
4 0.37
5 0.35
6 0.27
7 0.32
8 0.3
9 0.29
10 0.28
11 0.28
12 0.28
13 0.32
14 0.32
15 0.26
16 0.26
17 0.24
18 0.23
19 0.22
20 0.24
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.24
27 0.25
28 0.27
29 0.27
30 0.31
31 0.37
32 0.39
33 0.44
34 0.43
35 0.43
36 0.38
37 0.34
38 0.31
39 0.24
40 0.22
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.22
56 0.29
57 0.37
58 0.44
59 0.5
60 0.58
61 0.67
62 0.75
63 0.79
64 0.83
65 0.84
66 0.86
67 0.88
68 0.87
69 0.82
70 0.74
71 0.69
72 0.64
73 0.59
74 0.57
75 0.48
76 0.4
77 0.39
78 0.41
79 0.37
80 0.3
81 0.26
82 0.19
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.27
91 0.24
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.2
105 0.22
106 0.31
107 0.37
108 0.44
109 0.5
110 0.56
111 0.61
112 0.66
113 0.68
114 0.62
115 0.56
116 0.52
117 0.47
118 0.43
119 0.39
120 0.34
121 0.38
122 0.37
123 0.37
124 0.35
125 0.32
126 0.3
127 0.32
128 0.3
129 0.22
130 0.23
131 0.23
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.14
153 0.21
154 0.22
155 0.3
156 0.35
157 0.37
158 0.37
159 0.43
160 0.41
161 0.37
162 0.37
163 0.35
164 0.29
165 0.27
166 0.29
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.15
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.13
180 0.14
181 0.21
182 0.22
183 0.21
184 0.23
185 0.28
186 0.29
187 0.34
188 0.33
189 0.33
190 0.36
191 0.39
192 0.39
193 0.34
194 0.31
195 0.25
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.27
201 0.27
202 0.27
203 0.26
204 0.2
205 0.15
206 0.1
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.11
256 0.13
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.17
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.14
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.21
330 0.23
331 0.23
332 0.23
333 0.23
334 0.23
335 0.23
336 0.21
337 0.15
338 0.17
339 0.22
340 0.25
341 0.31
342 0.31
343 0.31
344 0.33
345 0.33
346 0.34
347 0.35
348 0.32
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.24
353 0.23
354 0.17
355 0.1
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.04
377 0.03
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.1
382 0.12
383 0.19
384 0.23
385 0.3
386 0.37
387 0.46
388 0.5
389 0.55
390 0.62
391 0.65
392 0.69
393 0.68
394 0.65
395 0.63
396 0.62
397 0.57
398 0.53
399 0.47
400 0.42
401 0.37
402 0.32
403 0.26
404 0.24
405 0.22
406 0.2