Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D9P8

Protein Details
Accession B0D9P8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-295VPTPLGTGKKRRKKAKHRSVETGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-289GKKRRKKAKHR
Subcellular Location(s) cyto 10.5cyto_mito 10.5, mito 9.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR044285  PWP1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_190410  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSNLISSVAWVRRGVSAQHPTKYILDDQELERVSALARIELEDARIELERAHLAALSMGKGAEGDEADDVVDDDDEANWWPIDRHEDGDAMDVDSGPTKPKPKTDDLSEYNLDDYDDDAKTTAVGPFSNIKGLTYYRDNEEDPYITLKDEDNDEREELEVLPTDNLLVVAKTEDEISQLEIYVYDESEENLYVHHDLMLPNFPLCLEWLDFPPASSSSNSIPGPNNPDKPGFGNYIAVGTLDPEIEIWSLDVLDAMYPTSILGRPDQTKAHVPTPLGTGKKRRKKAKHRSVETGYHVDAVLGLSWNKIQRNLLASASADRTVKLWDLTRDPTINGGGEGGGGAIRSFDVHKDKVQAVQWNAQDPTVLLTGSYDRTIRTFDSRAPGSGVGAIVGSDVEALKWDPWESHGFYASLENGLVLNFDARALPSNLDNPSPARFTLSAHDGAASAIDVNPHIKGCIVTGGMDKLVKVWNINDEDGGKRTVSLVTSRDLGVGKVFSTVFSPDHPLTVAAAGSKAKLQIWDVGANFGTRKAFASKLREAGRVLKEKEASQGGVIGVVSDNEESGDEAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.38
4 0.43
5 0.46
6 0.47
7 0.46
8 0.47
9 0.47
10 0.42
11 0.36
12 0.34
13 0.33
14 0.33
15 0.37
16 0.35
17 0.32
18 0.27
19 0.23
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.12
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.07
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.23
76 0.22
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.2
86 0.23
87 0.3
88 0.36
89 0.43
90 0.49
91 0.53
92 0.59
93 0.58
94 0.62
95 0.57
96 0.51
97 0.44
98 0.37
99 0.29
100 0.2
101 0.16
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.21
121 0.21
122 0.23
123 0.23
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.28
128 0.24
129 0.21
130 0.22
131 0.19
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.14
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.14
145 0.13
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.27
211 0.3
212 0.32
213 0.29
214 0.3
215 0.29
216 0.3
217 0.3
218 0.25
219 0.2
220 0.19
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.22
256 0.25
257 0.26
258 0.25
259 0.23
260 0.22
261 0.25
262 0.27
263 0.23
264 0.23
265 0.3
266 0.38
267 0.47
268 0.54
269 0.61
270 0.67
271 0.76
272 0.85
273 0.86
274 0.87
275 0.84
276 0.84
277 0.8
278 0.75
279 0.67
280 0.59
281 0.48
282 0.38
283 0.31
284 0.23
285 0.17
286 0.12
287 0.08
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.06
292 0.09
293 0.09
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.16
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.16
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.15
321 0.12
322 0.1
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.07
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.19
339 0.2
340 0.24
341 0.27
342 0.29
343 0.28
344 0.32
345 0.32
346 0.32
347 0.32
348 0.27
349 0.24
350 0.18
351 0.18
352 0.12
353 0.11
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.1
362 0.12
363 0.13
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.24
368 0.25
369 0.25
370 0.25
371 0.24
372 0.19
373 0.19
374 0.16
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.1
391 0.14
392 0.16
393 0.17
394 0.18
395 0.17
396 0.17
397 0.19
398 0.16
399 0.13
400 0.1
401 0.09
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.15
416 0.17
417 0.17
418 0.18
419 0.17
420 0.19
421 0.2
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.18
426 0.21
427 0.24
428 0.22
429 0.21
430 0.21
431 0.17
432 0.16
433 0.15
434 0.1
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.21
460 0.24
461 0.25
462 0.24
463 0.23
464 0.25
465 0.26
466 0.26
467 0.19
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.15
472 0.17
473 0.17
474 0.17
475 0.19
476 0.19
477 0.21
478 0.19
479 0.18
480 0.16
481 0.15
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.12
486 0.13
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.21
491 0.18
492 0.2
493 0.2
494 0.19
495 0.17
496 0.17
497 0.16
498 0.1
499 0.12
500 0.11
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.15
506 0.16
507 0.2
508 0.23
509 0.27
510 0.26
511 0.27
512 0.27
513 0.26
514 0.25
515 0.22
516 0.19
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.23
521 0.29
522 0.37
523 0.4
524 0.47
525 0.51
526 0.52
527 0.51
528 0.54
529 0.56
530 0.57
531 0.54
532 0.53
533 0.51
534 0.49
535 0.53
536 0.48
537 0.4
538 0.31
539 0.31
540 0.24
541 0.22
542 0.21
543 0.15
544 0.11
545 0.1
546 0.11
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.08