Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTI0

Protein Details
Accession B0CTI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-273KSNLPAPRGRGRPRKDRSLAEKQENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-265PPKPKSNLPAPRGRGRPRKDR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001025  BAH_dom  
IPR043151  BAH_sf  
IPR029617  Snt2  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_244290  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01426  BAH  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51038  BAH  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15497  PHD1_Snt2p_like  
Amino Acid Sequences MSFPVYLKNGDQVKVNDHVYCSPSWDTRDGTPYSVARIMQFLPPADAPKGEEGKNYLYTRVRLAWYYRPSDVSDRPVADSRLLLAAIYSEVCDINQLRAKCHVVHRDKISDLSGWKKRPDRFYFNRLFDPYIKKEFEVIPSQNVRNLPDSIRDVLISRYEYVVAEKEVIPDLTDHVRLCDSCQGWCPSPDTVQCDRCKRYFHMRCVQPPLMAKPSRGYGWTCAPCSRKHEQEVDSHEIRHPTPVPPKPKSNLPAPRGRGRPRKDRSLAEKQENLPVKHFNLWPFRYFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.32
4 0.3
5 0.33
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.26
10 0.28
11 0.3
12 0.31
13 0.3
14 0.31
15 0.37
16 0.34
17 0.32
18 0.33
19 0.3
20 0.3
21 0.3
22 0.28
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.21
27 0.22
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.23
36 0.26
37 0.24
38 0.24
39 0.24
40 0.28
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.31
45 0.32
46 0.33
47 0.34
48 0.31
49 0.27
50 0.3
51 0.34
52 0.36
53 0.39
54 0.37
55 0.36
56 0.37
57 0.4
58 0.39
59 0.36
60 0.35
61 0.32
62 0.34
63 0.35
64 0.33
65 0.28
66 0.24
67 0.19
68 0.16
69 0.15
70 0.11
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.07
81 0.11
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.21
86 0.24
87 0.24
88 0.31
89 0.36
90 0.38
91 0.44
92 0.47
93 0.46
94 0.45
95 0.43
96 0.38
97 0.3
98 0.26
99 0.28
100 0.3
101 0.3
102 0.35
103 0.4
104 0.44
105 0.51
106 0.56
107 0.57
108 0.58
109 0.63
110 0.66
111 0.63
112 0.62
113 0.55
114 0.5
115 0.44
116 0.44
117 0.39
118 0.36
119 0.33
120 0.29
121 0.29
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.23
126 0.22
127 0.25
128 0.25
129 0.25
130 0.25
131 0.23
132 0.2
133 0.2
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.15
168 0.14
169 0.19
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.24
174 0.2
175 0.23
176 0.24
177 0.27
178 0.3
179 0.35
180 0.4
181 0.45
182 0.48
183 0.48
184 0.5
185 0.48
186 0.54
187 0.56
188 0.59
189 0.61
190 0.64
191 0.67
192 0.71
193 0.68
194 0.6
195 0.54
196 0.51
197 0.49
198 0.44
199 0.39
200 0.33
201 0.34
202 0.31
203 0.3
204 0.27
205 0.23
206 0.3
207 0.34
208 0.34
209 0.36
210 0.38
211 0.4
212 0.45
213 0.48
214 0.46
215 0.47
216 0.52
217 0.49
218 0.54
219 0.57
220 0.58
221 0.52
222 0.47
223 0.44
224 0.39
225 0.36
226 0.34
227 0.29
228 0.28
229 0.36
230 0.43
231 0.49
232 0.52
233 0.6
234 0.59
235 0.66
236 0.64
237 0.65
238 0.67
239 0.64
240 0.68
241 0.67
242 0.71
243 0.71
244 0.77
245 0.77
246 0.75
247 0.79
248 0.77
249 0.81
250 0.79
251 0.8
252 0.79
253 0.8
254 0.82
255 0.8
256 0.79
257 0.7
258 0.72
259 0.7
260 0.63
261 0.56
262 0.52
263 0.47
264 0.46
265 0.47
266 0.45
267 0.48
268 0.49