Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2Y0M4

Protein Details
Accession M2Y0M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKKRRERDRPKSGPDAPYDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-12KKRRERDRPK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9.5, cyto 5, pero 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MGKKRRERDRPKSGPDAPYDPNKRILLSYESSDEEVEDASEQQNGSNDTPMVAVNVASHQFDEYPHEDDEAKLGATWVTADVAKEAGRSIAEGEDAEDAIGSAAKDGGSDEHHWEDEATYQRPVLGPASYENGELDLEEYDSTTEAAMAYLKGVRTERQMLPEVLRANGQVHHHANGDITADDFEGDHDQDGGYYLEDGGYVGAPASTTAVENDLADPQKVFTNALKYRFLTHRKLLHLPTTVEALATLGDGYPISFPQGNSKAYAEWHRLLSSERPNLAQLRSLEQETVFDLLALLQKHFMRRDKNIDSNVSTWIWSLLARLDDVGNMDNNQVYPLRALGKRALFLQLSFLNPEVAAQLEAVGEIGLMSTNDGDGNQKGPDLQDADRSSVARSALPRESITENTLATLDTTLVVIGEVFGQRDLLDFRHHWTVTVEPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.78
3 0.73
4 0.67
5 0.67
6 0.65
7 0.58
8 0.57
9 0.52
10 0.47
11 0.41
12 0.41
13 0.36
14 0.34
15 0.34
16 0.3
17 0.3
18 0.3
19 0.29
20 0.25
21 0.19
22 0.15
23 0.13
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.14
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.18
37 0.17
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.08
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.17
58 0.14
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.12
97 0.15
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.18
104 0.21
105 0.19
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.15
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.15
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.28
147 0.27
148 0.28
149 0.31
150 0.28
151 0.22
152 0.21
153 0.17
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.15
164 0.15
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.17
211 0.2
212 0.23
213 0.25
214 0.24
215 0.28
216 0.34
217 0.38
218 0.35
219 0.38
220 0.4
221 0.42
222 0.46
223 0.44
224 0.42
225 0.4
226 0.35
227 0.3
228 0.26
229 0.22
230 0.17
231 0.15
232 0.1
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.14
246 0.18
247 0.19
248 0.2
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.26
253 0.23
254 0.21
255 0.22
256 0.2
257 0.2
258 0.22
259 0.26
260 0.29
261 0.29
262 0.28
263 0.27
264 0.29
265 0.32
266 0.3
267 0.28
268 0.22
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.18
274 0.18
275 0.14
276 0.14
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.11
285 0.13
286 0.16
287 0.21
288 0.26
289 0.29
290 0.35
291 0.43
292 0.47
293 0.53
294 0.55
295 0.54
296 0.51
297 0.47
298 0.44
299 0.35
300 0.28
301 0.22
302 0.17
303 0.13
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.16
325 0.16
326 0.19
327 0.23
328 0.25
329 0.26
330 0.27
331 0.29
332 0.24
333 0.23
334 0.25
335 0.21
336 0.2
337 0.2
338 0.2
339 0.16
340 0.15
341 0.15
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.08
362 0.09
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.16
369 0.17
370 0.18
371 0.24
372 0.26
373 0.29
374 0.3
375 0.3
376 0.27
377 0.26
378 0.26
379 0.21
380 0.22
381 0.25
382 0.27
383 0.29
384 0.29
385 0.3
386 0.32
387 0.32
388 0.32
389 0.28
390 0.24
391 0.22
392 0.22
393 0.18
394 0.15
395 0.13
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.18
414 0.18
415 0.23
416 0.32
417 0.32
418 0.31
419 0.32