FuNGI

N1PDV2

Protein Details

Accession

N1PDV2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
133-154	FEVWNNKFIRRKKPLQNRAVVM	Hydrophilic
572-599	DWKEPGPPKAWMKRQQAKKKGEDGKELV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
576-592	PGPPKAWMKRQQAKKKG

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 11.5, nucl 7, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018606 Arb1 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0033167 C:ARC complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF09692 Arb1 PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MLDTTSSDSPRATSEASTENSAPANGTSGEPQTHGTSDENNTSQAQPESPNARVWTNEPSAIQPHEQKDEIIRQVEYYFGDVNLPHDAHLLSKAGEFGDGWVSLSTIMGFKKMRAFKPPARVKAALSLSNDTFEVWNNKFIRRKKPLQNRAVVMPKVDPSREATAQMIEKPWMTKAMFKPTGFEKDFVEGPLTPAEHETERKLFDPEEAFTERIQHAVTRYTSRRKMHQNTVKLFGSFITFGGFTGGQAMFTGGLSKADLEEYDKDQIEAMKARYVVSDAVLDGIYEDQEGGATWFVDFEAVAKSYLSMEFMAAFDWKDQKLVEDVTNIMVNFYKYLDYHDVCPEYKDQVKKARDFCELAGEELVKLAEADSHFPGQFSVACSTLYGGYHASIRPFDKNAEWVLQTDFLGLSDRDADYVFSAGMMAHGMDEQVEAYSAAKQQGKQLELVSEESMGLKVVSVEMPNEEAKLIYDSRQFRNTVVTPQGKLHCVRWEVPGAAQKDLPAHVVKQQKAKIGSRHVLLVDENALRFYHPGLKIEGLVKKLSNGMEFIDHYEHVYPSFYTWSLNHRIRDWKEPGPPKAWMKRQQAKKKGEDGKELVRREDEEEQDTPD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.24
3	0.27
4	0.29
5	0.28
6	0.26
7	0.25
8	0.25
9	0.22
10	0.16
11	0.16
12	0.13
13	0.14
14	0.15
15	0.17
16	0.18
17	0.18
18	0.21
19	0.2
20	0.2
21	0.21
22	0.2
23	0.22
24	0.25
25	0.3
26	0.29
27	0.28
28	0.3
29	0.28
30	0.3
31	0.27
32	0.25
33	0.21
34	0.27
35	0.3
36	0.3
37	0.34
38	0.33
39	0.33
40	0.33
41	0.33
42	0.33
43	0.32
44	0.33
45	0.29
46	0.29
47	0.32
48	0.33
49	0.35
50	0.34
51	0.35
52	0.38
53	0.37
54	0.35
55	0.37
56	0.42
57	0.42
58	0.38
59	0.34
60	0.3
61	0.3
62	0.3
63	0.25
64	0.2
65	0.16
66	0.13
67	0.14
68	0.13
69	0.15
70	0.17
71	0.16
72	0.14
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.16
77	0.15
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.1
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.23
99	0.3
100	0.32
101	0.38
102	0.47
103	0.5
104	0.6
105	0.68
106	0.67
107	0.67
108	0.65
109	0.59
110	0.59
111	0.56
112	0.5
113	0.44
114	0.41
115	0.34
116	0.33
117	0.32
118	0.24
119	0.2
120	0.18
121	0.21
122	0.18
123	0.25
124	0.26
125	0.32
126	0.39
127	0.46
128	0.53
129	0.56
130	0.65
131	0.68
132	0.77
133	0.82
134	0.84
135	0.85
136	0.77
137	0.76
138	0.74
139	0.64
140	0.54
141	0.46
142	0.4
143	0.36
144	0.33
145	0.26
146	0.23
147	0.28
148	0.27
149	0.27
150	0.23
151	0.24
152	0.25
153	0.26
154	0.22
155	0.18
156	0.17
157	0.17
158	0.16
159	0.18
160	0.16
161	0.22
162	0.25
163	0.35
164	0.4
165	0.39
166	0.41
167	0.41
168	0.49
169	0.43
170	0.4
171	0.31
172	0.27
173	0.28
174	0.26
175	0.24
176	0.15
177	0.15
178	0.16
179	0.15
180	0.12
181	0.12
182	0.13
183	0.13
184	0.15
185	0.17
186	0.17
187	0.19
188	0.2
189	0.2
190	0.19
191	0.2
192	0.2
193	0.18
194	0.2
195	0.2
196	0.2
197	0.19
198	0.22
199	0.19
200	0.18
201	0.17
202	0.13
203	0.12
204	0.16
205	0.18
206	0.21
207	0.26
208	0.34
209	0.41
210	0.43
211	0.49
212	0.55
213	0.61
214	0.65
215	0.68
216	0.69
217	0.65
218	0.69
219	0.62
220	0.52
221	0.44
222	0.34
223	0.27
224	0.18
225	0.14
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.07
248	0.09
249	0.1
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.14
255	0.13
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.13
263	0.12
264	0.09
265	0.09
266	0.06
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.1
309	0.11
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.12
315	0.11
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.1
324	0.14
325	0.14
326	0.17
327	0.19
328	0.21
329	0.2
330	0.22
331	0.19
332	0.19
333	0.22
334	0.23
335	0.25
336	0.32
337	0.37
338	0.42
339	0.46
340	0.47
341	0.47
342	0.45
343	0.41
344	0.4
345	0.35
346	0.29
347	0.25
348	0.2
349	0.16
350	0.14
351	0.14
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.08
358	0.09
359	0.11
360	0.11
361	0.12
362	0.12
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.12
380	0.13
381	0.15
382	0.16
383	0.17
384	0.17
385	0.19
386	0.2
387	0.2
388	0.19
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.15
393	0.13
394	0.11
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.07
405	0.08
406	0.07
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.07
424	0.08
425	0.13
426	0.15
427	0.16
428	0.21
429	0.26
430	0.27
431	0.27
432	0.26
433	0.24
434	0.23
435	0.24
436	0.2
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.11
441	0.09
442	0.07
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.2
460	0.24
461	0.29
462	0.33
463	0.33
464	0.31
465	0.38
466	0.37
467	0.36
468	0.4
469	0.39
470	0.36
471	0.41
472	0.44
473	0.4
474	0.4
475	0.38
476	0.36
477	0.35
478	0.35
479	0.34
480	0.35
481	0.32
482	0.34
483	0.37
484	0.32
485	0.3
486	0.28
487	0.25
488	0.23
489	0.23
490	0.22
491	0.17
492	0.17
493	0.22
494	0.29
495	0.33
496	0.39
497	0.42
498	0.45
499	0.5
500	0.55
501	0.56
502	0.57
503	0.59
504	0.52
505	0.51
506	0.45
507	0.41
508	0.35
509	0.29
510	0.24
511	0.2
512	0.19
513	0.16
514	0.16
515	0.15
516	0.14
517	0.15
518	0.19
519	0.19
520	0.21
521	0.23
522	0.25
523	0.27
524	0.32
525	0.34
526	0.28
527	0.29
528	0.27
529	0.25
530	0.28
531	0.27
532	0.23
533	0.2
534	0.19
535	0.19
536	0.2
537	0.22
538	0.21
539	0.19
540	0.2
541	0.21
542	0.2
543	0.17
544	0.18
545	0.15
546	0.14
547	0.17
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.23
552	0.31
553	0.37
554	0.39
555	0.41
556	0.5
557	0.52
558	0.6
559	0.6
560	0.58
561	0.62
562	0.68
563	0.69
564	0.63
565	0.67
566	0.67
567	0.7
568	0.73
569	0.72
570	0.74
571	0.78
572	0.84
573	0.88
574	0.88
575	0.88
576	0.87
577	0.87
578	0.86
579	0.83
580	0.82
581	0.77
582	0.77
583	0.76
584	0.7
585	0.63
586	0.57
587	0.52
588	0.48
589	0.5
590	0.44
591	0.41

N1PDV2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer