FuNGI

N1Q414

Protein Details

Accession

N1Q414

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-65	PDSYRRSPKNKDGYDQQQHKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSRLVTPQRRGREEDVESEDLYAGGSGTQGSKRRRLNDETRPLLPDSYRRSPKNKDGYDQQQHKPGSIVRVTLRDFVTYTNAEFHPGPNLNMVIGPNGTGKSTLVCAICIGLGWGTVHLGRAKDITEFVKHGRKEAVIEIELKADPERHTSNLVITHKINRDGGGKSGSGKSLWQIDGKKSSAKEVQKLAKSFHIQVDNLCQFLPQDRVVEFAALSPVDLLVQTQRAAAPEQMSEWHDQLKVMGKEQRQKAVEQQNIIDQLKSMENRQRSQEADVERLRERTELQDQLNLLRRMQPFAEFAILKERHRQARKQYKDAEKELVALRNRMTPNLEAVRSKKVYRDRLVEVVASRKRFLERTESLADQSVQKINSKTRAIKDLEQNIDSEKAGKKQSSEIITRNQRLVTRLQHERGNPPPDFDPVKMNADIKAIKDKVRAIDNEINNSLSISRDLGLQAKQRTEIIEQENANRTHLQSQVGRQESKLDRTSRDAARAWKWIQDNKDKFAGEVYPPPMISCSVTDAKYADAVEAIVGQGELMAFTVTSQDDFRVLDEQVYRRLNLTHVNIRTAVQPLASFPTPYSAEELRGFGLQHWILDLIEGPDAVIAMLCDNQGIHQTAYGDRDLNNNQHQAVQQTSISSWVTGRQSFRTTRRREYGDRGVSTRVSTIRQASLLTDAPVDTQEEQEIKQRIAEAESEKEEIVKEITGVNTRCSHLSAEMQRLKDDQKQMEDDKNWRQRAYSEYMGLETKQMAAQTKVDNAKESTKGLLQRIDGLKDDIERRTLERAQSTVDAARAIDTLKGLHAQLYEAEIMQIEAVSDLEQLESRHSDEQQRLQLKEQEVHQLKQISDDSKGKGLQAQRKCLQIQETMTDKELEYYDEAEGHWEEKDIDAQIQTVEASLEARLGGNENVLQEFEDRARKIEQKRAQLEGLTESLEQVGTSIQNIRQQWEPELDRLVKQISDAFSENFERIQCAGEVDVHKDDDFEQWEIQIKVKFRENEQLSVLNSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLAKAPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSRMVEIACAEHTSQYFLITPKLLNNLTYHPNMKVHCIASGEYMPEDHRELDFGMLAAKALAIRAAGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.61
3	0.54
4	0.49
5	0.43
6	0.37
7	0.28
8	0.23
9	0.16
10	0.09
11	0.06
12	0.06
13	0.06
14	0.09
15	0.14
16	0.22
17	0.28
18	0.37
19	0.44
20	0.52
21	0.59
22	0.65
23	0.7
24	0.73
25	0.78
26	0.75
27	0.72
28	0.67
29	0.62
30	0.56
31	0.49
32	0.46
33	0.44
34	0.48
35	0.54
36	0.57
37	0.63
38	0.68
39	0.76
40	0.78
41	0.76
42	0.72
43	0.73
44	0.78
45	0.81
46	0.8
47	0.75
48	0.73
49	0.67
50	0.61
51	0.55
52	0.48
53	0.45
54	0.39
55	0.39
56	0.34
57	0.4
58	0.42
59	0.43
60	0.4
61	0.34
62	0.32
63	0.29
64	0.3
65	0.25
66	0.24
67	0.23
68	0.22
69	0.24
70	0.24
71	0.23
72	0.26
73	0.27
74	0.26
75	0.24
76	0.25
77	0.21
78	0.22
79	0.22
80	0.16
81	0.14
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.13
90	0.16
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.14
95	0.13
96	0.11
97	0.11
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.08
103	0.08
104	0.11
105	0.13
106	0.13
107	0.13
108	0.15
109	0.15
110	0.15
111	0.18
112	0.19
113	0.2
114	0.23
115	0.27
116	0.34
117	0.34
118	0.35
119	0.36
120	0.34
121	0.33
122	0.35
123	0.36
124	0.29
125	0.31
126	0.28
127	0.28
128	0.26
129	0.24
130	0.2
131	0.17
132	0.17
133	0.21
134	0.23
135	0.22
136	0.25
137	0.25
138	0.28
139	0.33
140	0.34
141	0.32
142	0.31
143	0.37
144	0.38
145	0.42
146	0.39
147	0.34
148	0.35
149	0.33
150	0.34
151	0.29
152	0.25
153	0.25
154	0.26
155	0.25
156	0.21
157	0.21
158	0.2
159	0.23
160	0.24
161	0.26
162	0.28
163	0.32
164	0.38
165	0.39
166	0.41
167	0.36
168	0.41
169	0.43
170	0.45
171	0.46
172	0.48
173	0.54
174	0.56
175	0.58
176	0.55
177	0.54
178	0.52
179	0.49
180	0.47
181	0.44
182	0.37
183	0.37
184	0.44
185	0.38
186	0.34
187	0.3
188	0.24
189	0.19
190	0.22
191	0.24
192	0.16
193	0.17
194	0.16
195	0.19
196	0.19
197	0.19
198	0.16
199	0.13
200	0.13
201	0.11
202	0.1
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.11
214	0.13
215	0.15
216	0.14
217	0.13
218	0.14
219	0.16
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.18
224	0.17
225	0.17
226	0.18
227	0.24
228	0.23
229	0.25
230	0.3
231	0.33
232	0.41
233	0.45
234	0.52
235	0.45
236	0.45
237	0.5
238	0.54
239	0.53
240	0.46
241	0.43
242	0.4
243	0.44
244	0.43
245	0.33
246	0.23
247	0.22
248	0.23
249	0.23
250	0.24
251	0.25
252	0.3
253	0.33
254	0.37
255	0.39
256	0.37
257	0.39
258	0.4
259	0.36
260	0.38
261	0.38
262	0.37
263	0.35
264	0.34
265	0.31
266	0.27
267	0.25
268	0.24
269	0.28
270	0.29
271	0.29
272	0.31
273	0.3
274	0.34
275	0.41
276	0.37
277	0.31
278	0.32
279	0.32
280	0.31
281	0.31
282	0.28
283	0.21
284	0.21
285	0.25
286	0.18
287	0.18
288	0.25
289	0.26
290	0.25
291	0.32
292	0.37
293	0.42
294	0.48
295	0.54
296	0.55
297	0.64
298	0.71
299	0.72
300	0.75
301	0.76
302	0.78
303	0.75
304	0.69
305	0.58
306	0.54
307	0.48
308	0.45
309	0.36
310	0.31
311	0.28
312	0.29
313	0.29
314	0.27
315	0.27
316	0.21
317	0.26
318	0.28
319	0.29
320	0.26
321	0.28
322	0.34
323	0.34
324	0.34
325	0.35
326	0.39
327	0.46
328	0.49
329	0.52
330	0.48
331	0.49
332	0.5
333	0.45
334	0.38
335	0.38
336	0.36
337	0.32
338	0.28
339	0.26
340	0.27
341	0.27
342	0.28
343	0.28
344	0.27
345	0.31
346	0.34
347	0.33
348	0.32
349	0.32
350	0.3
351	0.22
352	0.22
353	0.19
354	0.17
355	0.19
356	0.21
357	0.23
358	0.29
359	0.33
360	0.36
361	0.36
362	0.43
363	0.43
364	0.46
365	0.5
366	0.51
367	0.49
368	0.44
369	0.42
370	0.36
371	0.33
372	0.27
373	0.23
374	0.17
375	0.18
376	0.2
377	0.21
378	0.21
379	0.23
380	0.29
381	0.3
382	0.32
383	0.32
384	0.38
385	0.45
386	0.46
387	0.44
388	0.4
389	0.37
390	0.35
391	0.37
392	0.34
393	0.33
394	0.37
395	0.38
396	0.4
397	0.41
398	0.45
399	0.47
400	0.46
401	0.4
402	0.36
403	0.35
404	0.34
405	0.34
406	0.3
407	0.26
408	0.23
409	0.26
410	0.25
411	0.24
412	0.21
413	0.22
414	0.22
415	0.19
416	0.24
417	0.22
418	0.23
419	0.25
420	0.26
421	0.26
422	0.3
423	0.29
424	0.29
425	0.35
426	0.35
427	0.35
428	0.34
429	0.31
430	0.26
431	0.25
432	0.18
433	0.11
434	0.1
435	0.07
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.1
440	0.13
441	0.17
442	0.19
443	0.19
444	0.2
445	0.2
446	0.21
447	0.2
448	0.22
449	0.2
450	0.22
451	0.22
452	0.25
453	0.31
454	0.29
455	0.29
456	0.25
457	0.23
458	0.21
459	0.23
460	0.22
461	0.18
462	0.22
463	0.28
464	0.31
465	0.31
466	0.27
467	0.33
468	0.32
469	0.35
470	0.36
471	0.31
472	0.3
473	0.34
474	0.4
475	0.34
476	0.36
477	0.34
478	0.33
479	0.34
480	0.38
481	0.33
482	0.33
483	0.34
484	0.34
485	0.37
486	0.43
487	0.43
488	0.4
489	0.44
490	0.39
491	0.35
492	0.32
493	0.28
494	0.2
495	0.21
496	0.2
497	0.16
498	0.16
499	0.16
500	0.15
501	0.13
502	0.12
503	0.08
504	0.11
505	0.13
506	0.13
507	0.14
508	0.13
509	0.13
510	0.14
511	0.13
512	0.09
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.04
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.02
522	0.02
523	0.02
524	0.02
525	0.02
526	0.02
527	0.02
528	0.04
529	0.03
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.11
540	0.12
541	0.17
542	0.18
543	0.17
544	0.16
545	0.17
546	0.16
547	0.18
548	0.21
549	0.22
550	0.22
551	0.23
552	0.23
553	0.23
554	0.23
555	0.2
556	0.17
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.12
561	0.11
562	0.1
563	0.08
564	0.11
565	0.12
566	0.12
567	0.15
568	0.12
569	0.14
570	0.15
571	0.16
572	0.13
573	0.13
574	0.13
575	0.09
576	0.13
577	0.11
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.02
593	0.02
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.04
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.1
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.1
609	0.14
610	0.16
611	0.19
612	0.21
613	0.21
614	0.2
615	0.21
616	0.21
617	0.19
618	0.18
619	0.15
620	0.12
621	0.12
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.09
626	0.08
627	0.11
628	0.13
629	0.15
630	0.17
631	0.17
632	0.21
633	0.27
634	0.35
635	0.42
636	0.45
637	0.5
638	0.54
639	0.58
640	0.58
641	0.6
642	0.62
643	0.59
644	0.56
645	0.5
646	0.46
647	0.4
648	0.36
649	0.31
650	0.22
651	0.16
652	0.16
653	0.17
654	0.16
655	0.16
656	0.16
657	0.14
658	0.15
659	0.14
660	0.13
661	0.11
662	0.09
663	0.09
664	0.09
665	0.1
666	0.08
667	0.07
668	0.08
669	0.09
670	0.1
671	0.15
672	0.17
673	0.15
674	0.16
675	0.16
676	0.15
677	0.16
678	0.18
679	0.14
680	0.16
681	0.17
682	0.17
683	0.16
684	0.16
685	0.15
686	0.13
687	0.11
688	0.08
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.13
693	0.14
694	0.16
695	0.17
696	0.18
697	0.18
698	0.18
699	0.18
700	0.15
701	0.21
702	0.22
703	0.29
704	0.32
705	0.32
706	0.32
707	0.33
708	0.34
709	0.33
710	0.36
711	0.29
712	0.29
713	0.33
714	0.36
715	0.4
716	0.41
717	0.41
718	0.45
719	0.5
720	0.49
721	0.45
722	0.42
723	0.38
724	0.4
725	0.41
726	0.34
727	0.27
728	0.25
729	0.27
730	0.27
731	0.25
732	0.2
733	0.13
734	0.11
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.11
739	0.14
740	0.15
741	0.2
742	0.24
743	0.23
744	0.24
745	0.25
746	0.28
747	0.27
748	0.26
749	0.22
750	0.22
751	0.25
752	0.25
753	0.26
754	0.22
755	0.27
756	0.28
757	0.28
758	0.25
759	0.23
760	0.21
761	0.21
762	0.24
763	0.18
764	0.19
765	0.18
766	0.19
767	0.23
768	0.26
769	0.26
770	0.25
771	0.25
772	0.25
773	0.25
774	0.25
775	0.21
776	0.18
777	0.15
778	0.13
779	0.13
780	0.1
781	0.1
782	0.09
783	0.07
784	0.07
785	0.08
786	0.09
787	0.08
788	0.1
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.11
793	0.1
794	0.09
795	0.09
796	0.07
797	0.07
798	0.06
799	0.06
800	0.04
801	0.03
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.04
806	0.05
807	0.06
808	0.06
809	0.09
810	0.1
811	0.12
812	0.14
813	0.16
814	0.22
815	0.25
816	0.31
817	0.38
818	0.42
819	0.41
820	0.43
821	0.47
822	0.44
823	0.43
824	0.39
825	0.41
826	0.39
827	0.39
828	0.39
829	0.37
830	0.34
831	0.36
832	0.37
833	0.28
834	0.29
835	0.33
836	0.3
837	0.3
838	0.31
839	0.26
840	0.27
841	0.33
842	0.37
843	0.4
844	0.46
845	0.46
846	0.5
847	0.51
848	0.49
849	0.45
850	0.42
851	0.37
852	0.34
853	0.35
854	0.32
855	0.32
856	0.3
857	0.26
858	0.23
859	0.21
860	0.17
861	0.14
862	0.14
863	0.13
864	0.12
865	0.12
866	0.12
867	0.13
868	0.12
869	0.1
870	0.1
871	0.1
872	0.1
873	0.12
874	0.11
875	0.11
876	0.11
877	0.11
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.08
882	0.07
883	0.05
884	0.06
885	0.05
886	0.06
887	0.05
888	0.06
889	0.06
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.1
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.11
898	0.1
899	0.12
900	0.14
901	0.19
902	0.19
903	0.21
904	0.26
905	0.33
906	0.38
907	0.47
908	0.51
909	0.54
910	0.58
911	0.6
912	0.57
913	0.51
914	0.47
915	0.4
916	0.34
917	0.25
918	0.2
919	0.16
920	0.14
921	0.13
922	0.1
923	0.07
924	0.07
925	0.06
926	0.07
927	0.11
928	0.13
929	0.19
930	0.2
931	0.22
932	0.26
933	0.28
934	0.3
935	0.35
936	0.35
937	0.32
938	0.37
939	0.37
940	0.32
941	0.33
942	0.31
943	0.23
944	0.22
945	0.23
946	0.19
947	0.21
948	0.22
949	0.2
950	0.22
951	0.24
952	0.23
953	0.21
954	0.19
955	0.17
956	0.16
957	0.17
958	0.14
959	0.13
960	0.13
961	0.17
962	0.18
963	0.2
964	0.22
965	0.22
966	0.21
967	0.21
968	0.21
969	0.2
970	0.21
971	0.2
972	0.18
973	0.18
974	0.23
975	0.23
976	0.26
977	0.26
978	0.26
979	0.28
980	0.36
981	0.38
982	0.36
983	0.46
984	0.46
985	0.46
986	0.46
987	0.46
988	0.39
989	0.42
990	0.4
991	0.36
992	0.33
993	0.3
994	0.28
995	0.25
996	0.26
997	0.27
998	0.32
999	0.29
1000	0.29
1001	0.29
1002	0.29
1003	0.28
1004	0.26
1005	0.2
1006	0.13
1007	0.09
1008	0.1
1009	0.08
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.07
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.14
1019	0.18
1020	0.21
1021	0.23
1022	0.21
1023	0.25
1024	0.29
1025	0.3
1026	0.31
1027	0.28
1028	0.25
1029	0.24
1030	0.27
1031	0.25
1032	0.23
1033	0.28
1034	0.27
1035	0.3
1036	0.36
1037	0.38
1038	0.39
1039	0.38
1040	0.36
1041	0.34
1042	0.33
1043	0.31
1044	0.24
1045	0.21
1046	0.18
1047	0.17
1048	0.16
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.17
1052	0.17
1053	0.17
1054	0.19
1055	0.18
1056	0.21
1057	0.2
1058	0.21
1059	0.21
1060	0.27
1061	0.26
1062	0.25
1063	0.27
1064	0.29
1065	0.33
1066	0.37
1067	0.37
1068	0.34
1069	0.38
1070	0.38
1071	0.4
1072	0.41
1073	0.36
1074	0.34
1075	0.33
1076	0.3
1077	0.3
1078	0.31
1079	0.27
1080	0.22
1081	0.22
1082	0.21
1083	0.21
1084	0.23
1085	0.19
1086	0.17
1087	0.17
1088	0.17
1089	0.17
1090	0.17
1091	0.14
1092	0.13
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.07

N1Q414

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer