FuNGI

B0DB35

Protein Details

Accession

B0DB35

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
629-649	ITSSIKLCRRYKNRQHVEDEW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14, nucl 9.5, mito_nucl 6.5, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_250191 -
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MAAHPVVEEGKLLSEALNTVKIQVQQMKRHLELDQLMDALKSASTMLAELRTSSLSPKQYYELYMAVFDALRHLSNYLYEAHTQSRHHLADLYELVQYAGNIIPRLYLMITVGSVYMSIPEAPVKEIMKDMMEMSRGVLHPIRGLFLRHYLSGQTRDHLPVGLDSGPSGNLQDSISFVLTNFIEMNKLWVRLQHQGHSRDREKREMERRELRILVGTNLVRLSQLDGVDLDMYQKTILPSILEQVVNCKDVIAQEYLMEVVIQVFTDEFHLHTLGPFLSATAQLHPKVNIKQIVIALIDRLASYAAREAESEDPEETKRQEEAAARRLAEKVKLQKERARENAYRAASPTSAGPDANAWGVPTSPTTTTTFSESEKSPVLPTSPSSTIDEKLGKGKDKEGSPVRKFRGVPEDVQLFEVFWKQVVELIKARPDLSIQDITALLVSLTNLSLSCYPDRLEYVDQVLGFAADKIKEFSESPDLHAQQTTTNLSALLVAPINSYQSVLTLLAIPNYGPLLTKQLFLTRRSIAHSVVSSVLKNETIVESPEDVDGVLELCHVLIKDQSDSGAALAPNGSQTNREEMAEEQGWVARMVHLFRAESLDVQFELLQVARRHFDMGGERMRFTFPALITSSIKLCRRYKNRQHVEDEWETKVAAILKFVRQVTAILATQVEAPTIALRLFLLSAQIADECGFEDLSYDFYVQAFSVYEESISESRAQLQAITLIIGTLSGAKVFGMDNYDTLITKAALHGARLLKKSHQATAVGLASHLWWQEAPPPAEGEVEYPHQDSKRVLECLQKSLRIANSAIEEIVTVQLYCDALDHYLYYLDRGAPDLAPKYVNSLVELITSSIDNISSPDVHPTQRAPPGLIEGVQTPEMITRHFRNTLGYINRRKNAAADGTGAVDSRWDDVDVVGALLKMGIGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.11
3	0.13
4	0.16
5	0.14
6	0.16
7	0.2
8	0.22
9	0.27
10	0.34
11	0.4
12	0.45
13	0.53
14	0.59
15	0.57
16	0.57
17	0.51
18	0.5
19	0.45
20	0.41
21	0.35
22	0.28
23	0.26
24	0.23
25	0.22
26	0.16
27	0.12
28	0.08
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.07
33	0.09
34	0.11
35	0.11
36	0.12
37	0.13
38	0.14
39	0.14
40	0.18
41	0.23
42	0.26
43	0.29
44	0.3
45	0.32
46	0.33
47	0.35
48	0.34
49	0.3
50	0.24
51	0.23
52	0.2
53	0.18
54	0.16
55	0.13
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.13
63	0.14
64	0.14
65	0.15
66	0.17
67	0.19
68	0.23
69	0.27
70	0.27
71	0.31
72	0.36
73	0.34
74	0.33
75	0.33
76	0.29
77	0.31
78	0.32
79	0.29
80	0.21
81	0.2
82	0.2
83	0.17
84	0.16
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.12
93	0.11
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.07
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.07
107	0.09
108	0.1
109	0.11
110	0.15
111	0.15
112	0.15
113	0.16
114	0.17
115	0.16
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.15
120	0.14
121	0.14
122	0.17
123	0.17
124	0.19
125	0.2
126	0.18
127	0.2
128	0.2
129	0.21
130	0.18
131	0.2
132	0.19
133	0.22
134	0.24
135	0.22
136	0.22
137	0.24
138	0.28
139	0.32
140	0.31
141	0.28
142	0.29
143	0.3
144	0.3
145	0.27
146	0.23
147	0.18
148	0.19
149	0.18
150	0.14
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.11
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.1
164	0.09
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.11
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.16
173	0.15
174	0.17
175	0.16
176	0.2
177	0.23
178	0.3
179	0.34
180	0.36
181	0.41
182	0.47
183	0.54
184	0.6
185	0.64
186	0.65
187	0.66
188	0.67
189	0.65
190	0.67
191	0.7
192	0.7
193	0.72
194	0.72
195	0.72
196	0.68
197	0.64
198	0.54
199	0.49
200	0.41
201	0.33
202	0.29
203	0.25
204	0.2
205	0.2
206	0.19
207	0.14
208	0.13
209	0.14
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.12
228	0.15
229	0.14
230	0.14
231	0.18
232	0.2
233	0.19
234	0.19
235	0.16
236	0.13
237	0.14
238	0.17
239	0.13
240	0.11
241	0.1
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.08
246	0.06
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.04
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.11
269	0.14
270	0.15
271	0.17
272	0.19
273	0.23
274	0.25
275	0.3
276	0.31
277	0.28
278	0.3
279	0.28
280	0.28
281	0.24
282	0.2
283	0.15
284	0.11
285	0.11
286	0.08
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.11
296	0.14
297	0.15
298	0.16
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.17
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.16
308	0.21
309	0.25
310	0.3
311	0.32
312	0.31
313	0.32
314	0.34
315	0.32
316	0.29
317	0.3
318	0.31
319	0.37
320	0.44
321	0.47
322	0.49
323	0.55
324	0.6
325	0.61
326	0.6
327	0.54
328	0.53
329	0.56
330	0.54
331	0.47
332	0.4
333	0.34
334	0.26
335	0.24
336	0.19
337	0.14
338	0.13
339	0.12
340	0.11
341	0.09
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.08
351	0.08
352	0.1
353	0.12
354	0.14
355	0.15
356	0.18
357	0.19
358	0.18
359	0.2
360	0.19
361	0.19
362	0.18
363	0.17
364	0.15
365	0.14
366	0.14
367	0.12
368	0.13
369	0.15
370	0.16
371	0.17
372	0.19
373	0.21
374	0.2
375	0.22
376	0.23
377	0.19
378	0.23
379	0.23
380	0.24
381	0.23
382	0.26
383	0.27
384	0.27
385	0.33
386	0.36
387	0.43
388	0.44
389	0.51
390	0.5
391	0.51
392	0.5
393	0.47
394	0.47
395	0.4
396	0.37
397	0.33
398	0.33
399	0.28
400	0.28
401	0.24
402	0.16
403	0.14
404	0.13
405	0.09
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.09
410	0.1
411	0.12
412	0.14
413	0.15
414	0.18
415	0.18
416	0.19
417	0.16
418	0.15
419	0.13
420	0.14
421	0.14
422	0.11
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.1
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.1
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.08
460	0.08
461	0.1
462	0.16
463	0.16
464	0.19
465	0.24
466	0.24
467	0.24
468	0.24
469	0.22
470	0.16
471	0.17
472	0.16
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.05
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.05
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.05
500	0.04
501	0.05
502	0.1
503	0.11
504	0.12
505	0.12
506	0.18
507	0.21
508	0.23
509	0.26
510	0.23
511	0.23
512	0.26
513	0.27
514	0.22
515	0.21
516	0.2
517	0.17
518	0.17
519	0.17
520	0.13
521	0.12
522	0.12
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.07
535	0.06
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.08
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.09
563	0.13
564	0.14
565	0.14
566	0.14
567	0.14
568	0.19
569	0.18
570	0.17
571	0.13
572	0.13
573	0.13
574	0.12
575	0.12
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.11
580	0.12
581	0.11
582	0.11
583	0.14
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.11
589	0.11
590	0.11
591	0.07
592	0.08
593	0.07
594	0.12
595	0.12
596	0.13
597	0.14
598	0.14
599	0.16
600	0.15
601	0.17
602	0.16
603	0.2
604	0.26
605	0.26
606	0.26
607	0.26
608	0.26
609	0.24
610	0.21
611	0.2
612	0.13
613	0.15
614	0.16
615	0.18
616	0.19
617	0.2
618	0.21
619	0.23
620	0.26
621	0.29
622	0.33
623	0.41
624	0.49
625	0.59
626	0.67
627	0.73
628	0.8
629	0.8
630	0.82
631	0.77
632	0.76
633	0.72
634	0.65
635	0.55
636	0.45
637	0.38
638	0.3
639	0.27
640	0.23
641	0.15
642	0.14
643	0.15
644	0.17
645	0.22
646	0.22
647	0.21
648	0.18
649	0.18
650	0.17
651	0.18
652	0.16
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.12
657	0.11
658	0.1
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.07
682	0.06
683	0.08
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.09
689	0.07
690	0.08
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.11
698	0.1
699	0.11
700	0.11
701	0.11
702	0.13
703	0.15
704	0.15
705	0.12
706	0.12
707	0.12
708	0.11
709	0.11
710	0.08
711	0.07
712	0.06
713	0.06
714	0.05
715	0.05
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.09
724	0.09
725	0.09
726	0.11
727	0.12
728	0.12
729	0.12
730	0.13
731	0.09
732	0.09
733	0.1
734	0.14
735	0.13
736	0.14
737	0.19
738	0.23
739	0.29
740	0.31
741	0.33
742	0.32
743	0.39
744	0.42
745	0.41
746	0.39
747	0.34
748	0.33
749	0.37
750	0.35
751	0.26
752	0.23
753	0.19
754	0.16
755	0.17
756	0.15
757	0.1
758	0.08
759	0.08
760	0.14
761	0.21
762	0.22
763	0.21
764	0.23
765	0.23
766	0.24
767	0.23
768	0.2
769	0.16
770	0.17
771	0.18
772	0.18
773	0.21
774	0.21
775	0.23
776	0.22
777	0.25
778	0.29
779	0.31
780	0.32
781	0.38
782	0.4
783	0.46
784	0.5
785	0.46
786	0.41
787	0.43
788	0.43
789	0.37
790	0.35
791	0.29
792	0.27
793	0.25
794	0.24
795	0.18
796	0.15
797	0.13
798	0.13
799	0.11
800	0.07
801	0.07
802	0.08
803	0.08
804	0.08
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.08
811	0.11
812	0.11
813	0.12
814	0.13
815	0.13
816	0.13
817	0.14
818	0.16
819	0.14
820	0.18
821	0.19
822	0.19
823	0.2
824	0.19
825	0.23
826	0.24
827	0.24
828	0.21
829	0.2
830	0.19
831	0.18
832	0.19
833	0.14
834	0.12
835	0.11
836	0.1
837	0.09
838	0.09
839	0.08
840	0.08
841	0.1
842	0.11
843	0.12
844	0.18
845	0.2
846	0.22
847	0.25
848	0.27
849	0.32
850	0.37
851	0.38
852	0.33
853	0.32
854	0.36
855	0.34
856	0.32
857	0.26
858	0.21
859	0.23
860	0.21
861	0.2
862	0.15
863	0.17
864	0.17
865	0.17
866	0.21
867	0.23
868	0.29
869	0.32
870	0.33
871	0.33
872	0.36
873	0.43
874	0.47
875	0.52
876	0.56
877	0.62
878	0.65
879	0.63
880	0.6
881	0.54
882	0.51
883	0.48
884	0.4
885	0.34
886	0.31
887	0.31
888	0.31
889	0.28
890	0.2
891	0.16
892	0.14
893	0.12
894	0.12
895	0.11
896	0.11
897	0.11
898	0.13
899	0.12
900	0.12
901	0.11
902	0.09
903	0.08
904	0.08

B0DB35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer