FuNGI

N1PDD8

Protein Details

Accession

N1PDD8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
195-218	EEMNGDEKPKRVRKRRWDTSTGDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
203-209	PKRVRKR

Subcellular Location(s)

plas 15, nucl 5.5, cyto_nucl 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFEKVRAAQAERNAGKKGFNDSSSQRTNTNKGHSLSENFDKDLYGNDAGDKFAGYNTSIAVDEDEDMDDGDNDGRLVGQYTATAAQIGEWATGDTAEDDILQSREKQAQIASRETDYQKQRFKRGLEGDGEKTYREVMHQRELEREEGRVQKLIEEKQKEQMANGGDDDDMDGVEHQASLKEPTPEAPKQEEMNGDEKPKRVRKRRWDTSTGDAAETNGHSETNGVNGHAANGEAATKKSRWDSTPALDGGAAPAKKKSKWDLVSAGEQTTQVQPNAAPAQPMAGFGTDISGRNAALSDEELDEMLPSEGYKILDPPPGYEPLRAPARRLAPSATPVNTGGFMMQEPVDARSMGKQLPSDIPGVGDLQFFKAEDMAYFGKLVDGADENDLSVDELKQRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARNFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYTHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGENLNDEQAKVRTVTALALAALAEASNPFGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYGNYYTAQIMEILLREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCAGGQGVTAAYLKETVLTDFFKSFWVRRMALDKRNYKQVVETTVDLGNKVGVGEIVERIVGNLKDESEAYRKMTVETIEKVISALGAADINERLEERLVDGILHSFQEQSVEDIVLLNGFGTVVTALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLITRIAIVMKQCDEDALLGKLGSVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMKSIVTVVGISSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAAAVVKHVALGVVGLGCEDAMLHLLNLLYPNLFETSPHVIDRVIEAIDAIRLAVGTGAVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPVVEDEKLRRHELMVVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.42
3	0.45
4	0.48
5	0.45
6	0.45
7	0.43
8	0.45
9	0.4
10	0.38
11	0.41
12	0.42
13	0.49
14	0.52
15	0.52
16	0.49
17	0.49
18	0.55
19	0.55
20	0.59
21	0.57
22	0.52
23	0.56
24	0.56
25	0.54
26	0.53
27	0.55
28	0.49
29	0.43
30	0.41
31	0.36
32	0.31
33	0.3
34	0.28
35	0.21
36	0.18
37	0.2
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.17
42	0.13
43	0.12
44	0.13
45	0.11
46	0.1
47	0.1
48	0.12
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.11
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.1
72	0.11
73	0.11
74	0.11
75	0.09
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.09
80	0.08
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.06
89	0.07
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.12
94	0.15
95	0.21
96	0.21
97	0.23
98	0.25
99	0.31
100	0.34
101	0.39
102	0.38
103	0.35
104	0.41
105	0.42
106	0.46
107	0.47
108	0.51
109	0.55
110	0.58
111	0.64
112	0.65
113	0.65
114	0.67
115	0.65
116	0.63
117	0.61
118	0.61
119	0.57
120	0.56
121	0.54
122	0.44
123	0.38
124	0.33
125	0.26
126	0.24
127	0.27
128	0.26
129	0.35
130	0.39
131	0.4
132	0.45
133	0.47
134	0.48
135	0.42
136	0.39
137	0.36
138	0.38
139	0.39
140	0.35
141	0.33
142	0.32
143	0.37
144	0.43
145	0.45
146	0.45
147	0.45
148	0.5
149	0.55
150	0.51
151	0.45
152	0.43
153	0.37
154	0.32
155	0.3
156	0.23
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.11
161	0.08
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.11
171	0.14
172	0.16
173	0.16
174	0.21
175	0.28
176	0.3
177	0.34
178	0.35
179	0.36
180	0.35
181	0.38
182	0.38
183	0.34
184	0.35
185	0.33
186	0.35
187	0.34
188	0.37
189	0.43
190	0.48
191	0.55
192	0.62
193	0.69
194	0.75
195	0.83
196	0.89
197	0.89
198	0.88
199	0.83
200	0.8
201	0.78
202	0.68
203	0.58
204	0.47
205	0.38
206	0.32
207	0.27
208	0.21
209	0.12
210	0.1
211	0.09
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.1
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.09
226	0.1
227	0.13
228	0.13
229	0.16
230	0.21
231	0.25
232	0.26
233	0.32
234	0.36
235	0.37
236	0.43
237	0.4
238	0.36
239	0.31
240	0.29
241	0.24
242	0.24
243	0.2
244	0.15
245	0.2
246	0.23
247	0.25
248	0.31
249	0.35
250	0.39
251	0.42
252	0.48
253	0.49
254	0.5
255	0.54
256	0.51
257	0.45
258	0.35
259	0.32
260	0.27
261	0.25
262	0.23
263	0.17
264	0.16
265	0.15
266	0.19
267	0.22
268	0.21
269	0.17
270	0.14
271	0.17
272	0.16
273	0.17
274	0.13
275	0.1
276	0.09
277	0.08
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.1
304	0.12
305	0.17
306	0.17
307	0.19
308	0.2
309	0.25
310	0.26
311	0.26
312	0.24
313	0.26
314	0.35
315	0.33
316	0.32
317	0.33
318	0.38
319	0.39
320	0.39
321	0.36
322	0.29
323	0.34
324	0.36
325	0.31
326	0.27
327	0.25
328	0.24
329	0.22
330	0.19
331	0.14
332	0.1
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.11
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.14
347	0.16
348	0.19
349	0.2
350	0.19
351	0.16
352	0.15
353	0.14
354	0.14
355	0.12
356	0.11
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.1
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.06
384	0.11
385	0.14
386	0.14
387	0.19
388	0.2
389	0.23
390	0.27
391	0.33
392	0.35
393	0.41
394	0.5
395	0.52
396	0.56
397	0.55
398	0.53
399	0.53
400	0.5
401	0.47
402	0.45
403	0.42
404	0.42
405	0.45
406	0.44
407	0.42
408	0.48
409	0.5
410	0.45
411	0.43
412	0.41
413	0.46
414	0.53
415	0.5
416	0.42
417	0.33
418	0.31
419	0.3
420	0.27
421	0.18
422	0.11
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.09
437	0.11
438	0.12
439	0.12
440	0.13
441	0.16
442	0.18
443	0.18
444	0.16
445	0.15
446	0.14
447	0.18
448	0.2
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.13
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.16
460	0.18
461	0.17
462	0.19
463	0.21
464	0.21
465	0.19
466	0.18
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.16
471	0.14
472	0.11
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.07
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.09
487	0.1
488	0.12
489	0.12
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.12
495	0.1
496	0.07
497	0.07
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.08
511	0.1
512	0.11
513	0.1
514	0.13
515	0.14
516	0.15
517	0.16
518	0.14
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.03
536	0.03
537	0.04
538	0.03
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.09
543	0.12
544	0.18
545	0.23
546	0.26
547	0.29
548	0.37
549	0.47
550	0.51
551	0.58
552	0.59
553	0.62
554	0.65
555	0.7
556	0.64
557	0.58
558	0.51
559	0.47
560	0.45
561	0.38
562	0.33
563	0.26
564	0.24
565	0.19
566	0.17
567	0.13
568	0.08
569	0.06
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.08
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.09
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.06
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.04
606	0.03
607	0.03
608	0.02
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.04
616	0.05
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.05
626	0.06
627	0.08
628	0.13
629	0.22
630	0.24
631	0.25
632	0.31
633	0.34
634	0.36
635	0.36
636	0.37
637	0.32
638	0.3
639	0.29
640	0.24
641	0.2
642	0.18
643	0.15
644	0.08
645	0.05
646	0.04
647	0.03
648	0.04
649	0.03
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.08
674	0.11
675	0.13
676	0.13
677	0.13
678	0.14
679	0.16
680	0.14
681	0.16
682	0.14
683	0.13
684	0.16
685	0.19
686	0.19
687	0.17
688	0.17
689	0.15
690	0.14
691	0.12
692	0.09
693	0.06
694	0.04
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.05
700	0.04
701	0.05
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.09
706	0.1
707	0.1
708	0.1
709	0.12
710	0.13
711	0.14
712	0.18
713	0.22
714	0.21
715	0.23
716	0.31
717	0.35
718	0.41
719	0.49
720	0.51
721	0.49
722	0.57
723	0.55
724	0.48
725	0.45
726	0.4
727	0.36
728	0.31
729	0.29
730	0.22
731	0.24
732	0.23
733	0.2
734	0.17
735	0.12
736	0.09
737	0.08
738	0.06
739	0.04
740	0.04
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.08
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.1
753	0.1
754	0.13
755	0.14
756	0.15
757	0.16
758	0.18
759	0.18
760	0.18
761	0.2
762	0.19
763	0.19
764	0.19
765	0.19
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.14
770	0.11
771	0.08
772	0.06
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.06
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.07
793	0.06
794	0.06
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.09
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.06
804	0.06
805	0.04
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.03
813	0.04
814	0.04
815	0.08
816	0.09
817	0.11
818	0.11
819	0.12
820	0.13
821	0.19
822	0.28
823	0.27
824	0.29
825	0.3
826	0.33
827	0.33
828	0.32
829	0.29
830	0.21
831	0.22
832	0.21
833	0.21
834	0.25
835	0.26
836	0.27
837	0.29
838	0.32
839	0.37
840	0.4
841	0.39
842	0.33
843	0.33
844	0.32
845	0.29
846	0.26
847	0.19
848	0.14
849	0.12
850	0.12
851	0.1
852	0.1
853	0.09
854	0.08
855	0.1
856	0.1
857	0.11
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.11
862	0.12
863	0.1
864	0.09
865	0.08
866	0.09
867	0.09
868	0.08
869	0.07
870	0.06
871	0.05
872	0.05
873	0.06
874	0.06
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.07
879	0.07
880	0.07
881	0.06
882	0.06
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.05
888	0.05
889	0.05
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.03
896	0.03
897	0.03
898	0.05
899	0.05
900	0.06
901	0.08
902	0.1
903	0.11
904	0.11
905	0.12
906	0.13
907	0.16
908	0.18
909	0.18
910	0.22
911	0.24
912	0.25
913	0.28
914	0.3
915	0.32
916	0.37
917	0.46
918	0.45
919	0.5
920	0.53
921	0.59
922	0.62
923	0.64
924	0.61
925	0.61
926	0.57
927	0.53
928	0.5
929	0.42
930	0.35
931	0.28
932	0.23
933	0.14
934	0.11
935	0.08
936	0.08
937	0.08
938	0.09
939	0.1
940	0.11
941	0.14
942	0.17
943	0.19
944	0.22
945	0.23
946	0.23
947	0.25
948	0.25
949	0.24
950	0.24
951	0.22
952	0.21
953	0.19
954	0.18
955	0.19
956	0.19
957	0.19
958	0.15
959	0.18
960	0.22
961	0.22
962	0.24
963	0.22
964	0.27
965	0.33
966	0.43
967	0.49
968	0.5
969	0.59
970	0.65
971	0.72
972	0.67
973	0.6
974	0.51
975	0.41
976	0.36
977	0.28
978	0.2
979	0.11
980	0.13
981	0.13
982	0.12
983	0.11
984	0.11
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.07
989	0.07
990	0.08
991	0.1
992	0.12
993	0.12
994	0.13
995	0.14
996	0.16
997	0.19
998	0.26
999	0.31
1000	0.35
1001	0.38
1002	0.41
1003	0.42
1004	0.41
1005	0.38
1006	0.29
1007	0.25
1008	0.19
1009	0.15
1010	0.11
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.07
1014	0.06
1015	0.04
1016	0.04
1017	0.04
1018	0.05
1019	0.05
1020	0.06
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.11
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.17
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.23
1035	0.25
1036	0.26
1037	0.25
1038	0.28
1039	0.27
1040	0.26
1041	0.2
1042	0.17
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.15
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.13
1051	0.12
1052	0.12
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.1
1057	0.1
1058	0.09
1059	0.08
1060	0.07
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.14
1075	0.19
1076	0.21
1077	0.23
1078	0.19
1079	0.19
1080	0.21
1081	0.26
1082	0.28
1083	0.24
1084	0.24
1085	0.22
1086	0.22
1087	0.21
1088	0.2
1089	0.14
1090	0.08
1091	0.07
1092	0.06
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.04
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.03
1101	0.04
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.06
1105	0.06
1106	0.07
1107	0.09
1108	0.09
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.14
1116	0.21
1117	0.23
1118	0.24
1119	0.23
1120	0.21
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.21
1124	0.14
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.11
1129	0.1
1130	0.08
1131	0.06
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.04
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.04
1146	0.06
1147	0.11
1148	0.15
1149	0.17
1150	0.25
1151	0.31
1152	0.36
1153	0.43
1154	0.49
1155	0.52
1156	0.59
1157	0.65
1158	0.66
1159	0.7
1160	0.7
1161	0.68
1162	0.66
1163	0.65
1164	0.6
1165	0.56
1166	0.48
1167	0.39
1168	0.35
1169	0.3
1170	0.25
1171	0.17
1172	0.12
1173	0.1
1174	0.08
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.08
1178	0.08
1179	0.09
1180	0.13
1181	0.14
1182	0.2
1183	0.26
1184	0.35
1185	0.39
1186	0.43
1187	0.42
1188	0.4

N1PDD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer