Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PFH6

Protein Details
Accession N1PFH6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-39SGATRGPRRGKNGRLPNRKAAQKSHydrophilic
169-193TAPKNAAKENQKKNQKKDGPKPAVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-43RGPRRGKNGRLPNRKAAQKSKAAT
49-64PSGGIQKKSKAGKPAR
171-212PKNAAKENQKKNQKKDGPKPAVNGEKKAGAKKSGRAGRPKKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGKLDQSLDEIMKDSGATRGPRRGKNGRLPNRKAAQKSKAATTAVIAPSGGIQKKSKAGKPARTPAIPIAPLSGESKINVSNLPRDATEEMIKDYFGDTAGPVKRVIRNYGQDGKFNGSCLVIFSRPDAAAKAARADGTKVDGKPLRVEILVNAKQVVPVKSLAERATAPKNAAKENQKKNQKKDGPKPAVNGEKKAGAKKSGRAGRPKKKTADELDAEMQDYFGGSGEAPAATNGGAQPAVAATNGGDAMDEVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.17
5 0.21
6 0.24
7 0.34
8 0.42
9 0.48
10 0.56
11 0.62
12 0.66
13 0.72
14 0.79
15 0.8
16 0.83
17 0.83
18 0.84
19 0.84
20 0.82
21 0.8
22 0.78
23 0.75
24 0.73
25 0.69
26 0.65
27 0.62
28 0.55
29 0.47
30 0.39
31 0.38
32 0.3
33 0.27
34 0.21
35 0.15
36 0.16
37 0.21
38 0.21
39 0.17
40 0.18
41 0.2
42 0.28
43 0.34
44 0.36
45 0.41
46 0.48
47 0.55
48 0.63
49 0.69
50 0.69
51 0.64
52 0.62
53 0.57
54 0.54
55 0.45
56 0.36
57 0.28
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.18
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.07
85 0.07
86 0.05
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.19
93 0.21
94 0.24
95 0.24
96 0.26
97 0.32
98 0.4
99 0.39
100 0.38
101 0.37
102 0.37
103 0.32
104 0.29
105 0.23
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.09
126 0.11
127 0.15
128 0.13
129 0.18
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.2
139 0.22
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.2
144 0.23
145 0.22
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.18
155 0.22
156 0.22
157 0.22
158 0.22
159 0.24
160 0.25
161 0.31
162 0.37
163 0.42
164 0.5
165 0.58
166 0.66
167 0.72
168 0.77
169 0.81
170 0.81
171 0.82
172 0.82
173 0.84
174 0.83
175 0.79
176 0.75
177 0.72
178 0.73
179 0.66
180 0.59
181 0.5
182 0.47
183 0.45
184 0.47
185 0.42
186 0.39
187 0.4
188 0.42
189 0.5
190 0.51
191 0.55
192 0.6
193 0.68
194 0.71
195 0.77
196 0.8
197 0.78
198 0.77
199 0.79
200 0.75
201 0.73
202 0.66
203 0.61
204 0.57
205 0.5
206 0.44
207 0.35
208 0.28
209 0.19
210 0.16
211 0.1
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.05
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06