Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q59VP9

Protein Details
Accession Q59VP9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-246MEEKEKKEKKEKRVDNDGRLBasic
308-353KDPMEQFIKDKKKKSGKHRSSHRSSHRSSHRSSHHKSKDREKSPTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-239KEKKEKKEKR
316-353KDKKKKSGKHRSSHRSSHRSSHRSSHHKSKDREKSPTR
Subcellular Location(s) nucl 8, E.R. 7, mito 3, cyto 3, golg 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cal:CAALFM_C104120CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVKRVREIFYIFYIYIYIFFQTFSVVCANLISSSSSSSSSSSSSSFLFLFLFLSLFLFLFLSHHQPTNKKYNPHSQTCQLTYSLTKLTPYIIFMNTIKQINQINQKELNSQTSYKSSWHYDYRDTNYLYIGNIPYNLTTKDLIIIFSQYGIPTHINLIKDKESSKHHRGFGFLKYANFKSCILAIDNFNGIKLGDRYLKVDHNYYKLRGDENEDDYLIDYEEIKREMEEKEKKEKKEKRVDNDGRLIEGNKEIKEIEGGEKKEEEEEEDNEEDNDNNDDDEFKDPMAQYLTKTNDKERDDDDDDDEFKDPMEQFIKDKKKKSGKHRSSHRSSHRSSHRSSHHKSKDREKSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.16
4 0.13
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.09
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.23
52 0.28
53 0.34
54 0.43
55 0.48
56 0.49
57 0.54
58 0.6
59 0.65
60 0.68
61 0.68
62 0.65
63 0.66
64 0.61
65 0.58
66 0.48
67 0.41
68 0.34
69 0.31
70 0.26
71 0.2
72 0.18
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.17
80 0.17
81 0.2
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.2
86 0.22
87 0.25
88 0.35
89 0.34
90 0.35
91 0.37
92 0.38
93 0.39
94 0.38
95 0.37
96 0.3
97 0.29
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.25
103 0.24
104 0.26
105 0.3
106 0.31
107 0.34
108 0.39
109 0.43
110 0.46
111 0.43
112 0.39
113 0.34
114 0.31
115 0.26
116 0.21
117 0.16
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.25
150 0.32
151 0.39
152 0.42
153 0.44
154 0.43
155 0.46
156 0.45
157 0.41
158 0.4
159 0.33
160 0.29
161 0.29
162 0.29
163 0.27
164 0.26
165 0.23
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.14
184 0.16
185 0.2
186 0.2
187 0.24
188 0.24
189 0.27
190 0.3
191 0.29
192 0.3
193 0.28
194 0.28
195 0.24
196 0.28
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.24
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.14
205 0.1
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.2
215 0.28
216 0.31
217 0.42
218 0.49
219 0.53
220 0.62
221 0.69
222 0.7
223 0.73
224 0.77
225 0.74
226 0.79
227 0.82
228 0.78
229 0.78
230 0.68
231 0.59
232 0.51
233 0.43
234 0.33
235 0.3
236 0.27
237 0.19
238 0.19
239 0.17
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.22
245 0.23
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.25
250 0.24
251 0.22
252 0.18
253 0.19
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.2
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.23
277 0.29
278 0.32
279 0.35
280 0.39
281 0.44
282 0.46
283 0.48
284 0.44
285 0.47
286 0.45
287 0.45
288 0.42
289 0.37
290 0.36
291 0.33
292 0.31
293 0.23
294 0.18
295 0.2
296 0.16
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.23
301 0.33
302 0.44
303 0.47
304 0.54
305 0.6
306 0.67
307 0.75
308 0.82
309 0.83
310 0.83
311 0.86
312 0.9
313 0.91
314 0.9
315 0.92
316 0.91
317 0.9
318 0.84
319 0.84
320 0.84
321 0.8
322 0.76
323 0.75
324 0.74
325 0.74
326 0.77
327 0.78
328 0.78
329 0.81
330 0.84
331 0.85
332 0.86
333 0.85