Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PXD3

Protein Details
Accession N1PXD3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-406DPSAKKEKTENGRKSKKQKKAERLGQKQNGTKKTKPEKSNDPNFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-397KKEKTENGRKSKKQKKAERLGQKQNGTKKTKP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.666, nucl 9, cyto 9, cyto_mito 8.166, mito_nucl 8.166, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
Gene Ontology GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MAPKLHGRAFYESIGSPNHVIAPMVEQSEFAWRMLTRSFLPPDLRTSILAYSPMLHAKLFADGPKYRTNSFQPLKPPLTMPSPGDSEHAKSFSEDDMYLDGNPKIDRPLFVQFCANEPDVFLRAAKLVQPYCDAVDLNLGCPQGIAKRGHYGAFLQEDWDLIYKLINKLHQELDIPVTAKLRVQETKEKTLEYANMILGAGASIITVHGRQRHQKGHNTGLADWTVLRYLRERLPPDTVIFANGNILQYGDLQKCLDATGADAVMSAEGNLYDPSIFVPPPPAGEEGREYWRGKNGKGGYRADAVLRRYLDIIHKYVLGQEPPMRKPLFLPSDPVIWIEQQEPLNLVGQKREREEDEEEDGDPSAKKEKTENGRKSKKQKKAERLGQKQNGTKKTKPEKSNDPNFTAMQPHCFHILRSLVSDHHDVRDALARSRSGDIEAYENVLTLTEQAVKAGLLDYEENPLKYEHPNSGAEAAADPQLSSTEAVRRCKRPFWVCQAYVRPLPQEAMEKGSLSLSKKEKAKLEAQQAEEEKAGVPPEGKIEVVNGAATNDTAEKQTEIPRDGVVCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.23
4 0.2
5 0.2
6 0.17
7 0.17
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.15
15 0.23
16 0.23
17 0.19
18 0.2
19 0.18
20 0.2
21 0.22
22 0.24
23 0.19
24 0.25
25 0.29
26 0.31
27 0.36
28 0.35
29 0.4
30 0.4
31 0.39
32 0.33
33 0.32
34 0.29
35 0.25
36 0.24
37 0.19
38 0.17
39 0.18
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.22
49 0.24
50 0.29
51 0.35
52 0.38
53 0.36
54 0.4
55 0.44
56 0.48
57 0.5
58 0.51
59 0.51
60 0.57
61 0.59
62 0.55
63 0.5
64 0.44
65 0.44
66 0.42
67 0.37
68 0.32
69 0.31
70 0.3
71 0.3
72 0.29
73 0.27
74 0.27
75 0.26
76 0.22
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.29
96 0.29
97 0.3
98 0.34
99 0.3
100 0.31
101 0.34
102 0.32
103 0.22
104 0.2
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.16
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.22
119 0.22
120 0.2
121 0.13
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.11
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.23
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.24
139 0.22
140 0.23
141 0.21
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.11
148 0.08
149 0.1
150 0.12
151 0.14
152 0.17
153 0.2
154 0.2
155 0.23
156 0.25
157 0.24
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.18
170 0.22
171 0.3
172 0.35
173 0.43
174 0.43
175 0.42
176 0.38
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.24
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.08
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.04
194 0.07
195 0.12
196 0.15
197 0.23
198 0.3
199 0.39
200 0.44
201 0.52
202 0.56
203 0.58
204 0.58
205 0.54
206 0.47
207 0.41
208 0.34
209 0.26
210 0.2
211 0.13
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.12
217 0.16
218 0.22
219 0.25
220 0.26
221 0.3
222 0.31
223 0.3
224 0.29
225 0.24
226 0.21
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.08
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.17
275 0.21
276 0.2
277 0.19
278 0.26
279 0.27
280 0.25
281 0.3
282 0.31
283 0.33
284 0.38
285 0.39
286 0.34
287 0.34
288 0.35
289 0.29
290 0.28
291 0.23
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.18
299 0.18
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.17
304 0.18
305 0.14
306 0.13
307 0.16
308 0.21
309 0.22
310 0.27
311 0.25
312 0.23
313 0.24
314 0.31
315 0.32
316 0.27
317 0.31
318 0.26
319 0.28
320 0.28
321 0.28
322 0.2
323 0.14
324 0.15
325 0.11
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.17
335 0.2
336 0.23
337 0.24
338 0.26
339 0.24
340 0.27
341 0.31
342 0.29
343 0.3
344 0.28
345 0.26
346 0.24
347 0.23
348 0.19
349 0.15
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.17
355 0.25
356 0.35
357 0.45
358 0.54
359 0.59
360 0.68
361 0.76
362 0.84
363 0.86
364 0.85
365 0.85
366 0.86
367 0.85
368 0.86
369 0.88
370 0.88
371 0.88
372 0.89
373 0.86
374 0.83
375 0.78
376 0.75
377 0.75
378 0.71
379 0.65
380 0.65
381 0.68
382 0.71
383 0.71
384 0.7
385 0.72
386 0.75
387 0.81
388 0.76
389 0.7
390 0.64
391 0.58
392 0.52
393 0.47
394 0.37
395 0.33
396 0.28
397 0.26
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.24
402 0.26
403 0.21
404 0.22
405 0.22
406 0.19
407 0.22
408 0.26
409 0.22
410 0.21
411 0.22
412 0.2
413 0.2
414 0.26
415 0.24
416 0.23
417 0.25
418 0.24
419 0.24
420 0.26
421 0.25
422 0.19
423 0.19
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.14
447 0.17
448 0.16
449 0.17
450 0.18
451 0.18
452 0.21
453 0.23
454 0.22
455 0.24
456 0.25
457 0.26
458 0.27
459 0.25
460 0.22
461 0.19
462 0.16
463 0.14
464 0.12
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.16
472 0.22
473 0.31
474 0.38
475 0.45
476 0.49
477 0.55
478 0.62
479 0.63
480 0.67
481 0.68
482 0.71
483 0.67
484 0.71
485 0.72
486 0.69
487 0.65
488 0.59
489 0.51
490 0.42
491 0.4
492 0.34
493 0.33
494 0.28
495 0.29
496 0.27
497 0.26
498 0.24
499 0.26
500 0.27
501 0.23
502 0.29
503 0.29
504 0.35
505 0.4
506 0.45
507 0.49
508 0.51
509 0.57
510 0.58
511 0.63
512 0.64
513 0.61
514 0.63
515 0.59
516 0.56
517 0.48
518 0.4
519 0.29
520 0.24
521 0.22
522 0.15
523 0.14
524 0.12
525 0.15
526 0.16
527 0.16
528 0.14
529 0.15
530 0.15
531 0.15
532 0.15
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.14
543 0.17
544 0.24
545 0.29
546 0.3
547 0.31
548 0.32