Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D223

Protein Details
Accession B0D223    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-218GSDKSRSQSRSRSRSRSKSRSASPASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-211RSQSRSRSRSRSKS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_316131  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTITGAQAIHGQNPQFLVETVIRNRIYESTYWKEHCFALTAESLIDKALQVRFIGGVYGNQRPTEFLCLLLKLLQIQPEKEILVEYLRADEFKYLRALAALYIRMTFRAVEVYDLLEPQLKDYRKLRQRNMGGYALTFMDEFVYALLVEERVCDIILPRLIKRQVLEENGDIGPRKSRLLDAMEGKSDRGSDKSRSQSRSRSRSRSKSRSASPASSGYLSAGHSRTPSAGSRYVSRSPSGSRSPSRSPIHSGRRSVSLDRMDTDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.18
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.23
10 0.25
11 0.31
12 0.3
13 0.29
14 0.31
15 0.29
16 0.28
17 0.25
18 0.3
19 0.3
20 0.36
21 0.39
22 0.39
23 0.39
24 0.37
25 0.35
26 0.29
27 0.23
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.07
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.11
47 0.13
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.24
55 0.2
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.14
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.15
110 0.14
111 0.18
112 0.21
113 0.3
114 0.36
115 0.44
116 0.47
117 0.5
118 0.54
119 0.55
120 0.57
121 0.5
122 0.41
123 0.33
124 0.3
125 0.2
126 0.16
127 0.11
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.03
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.08
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.18
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.25
155 0.26
156 0.29
157 0.23
158 0.25
159 0.24
160 0.24
161 0.2
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.19
170 0.23
171 0.25
172 0.27
173 0.29
174 0.29
175 0.28
176 0.25
177 0.22
178 0.18
179 0.17
180 0.19
181 0.21
182 0.28
183 0.38
184 0.45
185 0.5
186 0.55
187 0.61
188 0.67
189 0.72
190 0.74
191 0.75
192 0.77
193 0.83
194 0.88
195 0.87
196 0.87
197 0.85
198 0.83
199 0.82
200 0.78
201 0.71
202 0.64
203 0.58
204 0.51
205 0.43
206 0.36
207 0.27
208 0.22
209 0.19
210 0.19
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.2
218 0.21
219 0.26
220 0.27
221 0.32
222 0.37
223 0.41
224 0.41
225 0.39
226 0.37
227 0.37
228 0.41
229 0.43
230 0.45
231 0.46
232 0.5
233 0.55
234 0.61
235 0.62
236 0.59
237 0.61
238 0.63
239 0.67
240 0.68
241 0.67
242 0.61
243 0.62
244 0.63
245 0.59
246 0.56
247 0.53
248 0.48