Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PIT0

Protein Details
Accession N1PIT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-209PVIVVRPGSSREKKKRKRLQDPSRSGYRDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-197SREKKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences LSSPPPPAQFRPSVSFDTFSNPSASDFSLTLNRKHRDYVYTKRSRTFLCGTDTNEYSDTALEWLIDELVDDGDEVVCLRVVEKDSKEAAKWAGGQGEKGYRREAQRFLEEIEKKNTEDRAISLVLEFSIGKVHDTIQQMIRIYEPAILVVGTRGRSLTGYQGLLSSGSVSKYCLQYSPVPVIVVRPGSSREKKKRKRLQDPSRSGYRDILDKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.38
4 0.38
5 0.35
6 0.3
7 0.27
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.17
13 0.15
14 0.16
15 0.23
16 0.25
17 0.3
18 0.37
19 0.39
20 0.39
21 0.43
22 0.43
23 0.43
24 0.48
25 0.52
26 0.54
27 0.61
28 0.63
29 0.63
30 0.64
31 0.57
32 0.56
33 0.5
34 0.43
35 0.4
36 0.4
37 0.4
38 0.41
39 0.4
40 0.36
41 0.32
42 0.28
43 0.22
44 0.18
45 0.14
46 0.1
47 0.09
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.03
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.06
67 0.08
68 0.12
69 0.12
70 0.16
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.18
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.25
89 0.29
90 0.31
91 0.28
92 0.29
93 0.29
94 0.28
95 0.33
96 0.31
97 0.3
98 0.31
99 0.29
100 0.26
101 0.28
102 0.27
103 0.2
104 0.18
105 0.17
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.04
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.12
121 0.14
122 0.17
123 0.17
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.11
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.14
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.19
162 0.23
163 0.27
164 0.3
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.26
169 0.26
170 0.24
171 0.2
172 0.17
173 0.2
174 0.29
175 0.38
176 0.47
177 0.55
178 0.64
179 0.73
180 0.83
181 0.89
182 0.91
183 0.94
184 0.94
185 0.94
186 0.94
187 0.94
188 0.9
189 0.89
190 0.81
191 0.73
192 0.66
193 0.58