Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1PKW7

Protein Details
Accession N1PKW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-37QSPASPRPPAKKRKTLGDEKDAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-27PPAKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MGLVDYSDSDEDAHQSPASPRPPAKKRKTLGDEKDAAALPPLPASFRDLYSSTVRTSTQDDPSLHAGRKRVVPHIAGNWPTHVYLEWFPEAEAYNVLCLALRDVQHSLEHGVDNVHSLLQNHLGVQLPLHVSLSRSLALKTEQKDSFLTDLEQAVASTAVRTFSVSPTQLIWHPNEDRTRWFLVLKLQRPAGDELQKMLGGCNELAARFDQPLLYQTTDPGSAEGKFKATSIPVKAFHISVAWSLQPPIAQQPPDHGGLQQAISSSILEQMGKLKITFEGVKIRIGQDVTSVQLQKARITAPTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.19
4 0.25
5 0.29
6 0.32
7 0.36
8 0.45
9 0.55
10 0.64
11 0.71
12 0.73
13 0.75
14 0.8
15 0.83
16 0.84
17 0.83
18 0.81
19 0.76
20 0.66
21 0.65
22 0.55
23 0.45
24 0.36
25 0.28
26 0.19
27 0.16
28 0.15
29 0.12
30 0.12
31 0.17
32 0.17
33 0.16
34 0.2
35 0.19
36 0.23
37 0.26
38 0.28
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.26
44 0.27
45 0.28
46 0.32
47 0.31
48 0.33
49 0.39
50 0.41
51 0.38
52 0.36
53 0.34
54 0.31
55 0.36
56 0.36
57 0.35
58 0.35
59 0.35
60 0.36
61 0.39
62 0.42
63 0.39
64 0.37
65 0.33
66 0.3
67 0.28
68 0.24
69 0.18
70 0.16
71 0.14
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.13
126 0.17
127 0.18
128 0.23
129 0.22
130 0.23
131 0.23
132 0.24
133 0.22
134 0.18
135 0.17
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.22
162 0.25
163 0.25
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.24
168 0.23
169 0.2
170 0.26
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.32
175 0.32
176 0.34
177 0.36
178 0.33
179 0.3
180 0.26
181 0.24
182 0.24
183 0.24
184 0.21
185 0.18
186 0.14
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.2
218 0.22
219 0.27
220 0.27
221 0.3
222 0.31
223 0.29
224 0.26
225 0.22
226 0.18
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.17
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.25
240 0.28
241 0.3
242 0.3
243 0.24
244 0.21
245 0.22
246 0.22
247 0.17
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.15
262 0.15
263 0.2
264 0.21
265 0.2
266 0.27
267 0.27
268 0.3
269 0.31
270 0.31
271 0.3
272 0.29
273 0.26
274 0.21
275 0.22
276 0.21
277 0.25
278 0.25
279 0.22
280 0.26
281 0.26
282 0.25
283 0.26
284 0.25