FuNGI

N1PMD1

Protein Details

Accession

N1PMD1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MAKSKIKKEVKRKQVQQSPTQASV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
196-200	ARKKR
247-251	GKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro

View protein in InterPro
IPR045161  Utp18
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
IPR001680  WD40_repeat
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf

Gene Ontology

GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome
GO:0032040  C:small-subunit processome
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
GO:0000292  P:RNA fragment catabolic process

Amino Acid Sequences

MAKSKIKKEVKRKQVQQSPTQASVQDEELSEEEVESDVDIIVDGELDKDETEEELERLVFGDSVGFRDGLKDVHMEDAENQDEDEDVTGGMQGLDDAQLFFTDTGDNQALYLAPEKASDDESDDGTLRSKQPPAWEDSDDERTLVSLASVPRLRKLRRTETEDVVNGKEYARRLRKQFELLNPMPQWAQTALQKPARKKRRMSGDGSSGEEDSDAEMDTDDMPSAAPLSKLLQDAESLVRQAGPGAGKKRKIRPEVLDIQRQKDIPGVQPSAITSLSFHPNLPLLLSSGPSSTLYLHHLASSPPAPTPNPLLTSFHIRGSELTTTSFHPTDSRIFLSARRRYFHVWNLQTGRVEKITRVYGQQHEQKSMERFKLSPDGSYMALLGSTKKGGGVVNILSATTLQWISKVRIESRGGIAEFAWWRIGKGLCIIGKNGEVTEWSLSDQRVVARWQDEGAVGTTTLALGGQHELVKSPIGNDRWIAIGSSSGIVNIYDRRVWLDNDTAGIVQAVPEQPKPTKVLDHLTTPISHLAFSHDGQILAMASKWKRDSMRLVHLPSCTVFKNWPTSSTPLGRITGVAFADGGVVEGSDAYAVLAVANEQGKIRIWEIR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.88
3	0.86
4	0.86
5	0.82
6	0.75
7	0.68
8	0.59
9	0.52
10	0.46
11	0.39
12	0.3
13	0.23
14	0.22
15	0.2
16	0.2
17	0.18
18	0.15
19	0.13
20	0.11
21	0.11
22	0.08
23	0.08
24	0.06
25	0.05
26	0.05
27	0.05
28	0.05
29	0.05
30	0.05
31	0.05
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.07
37	0.07
38	0.1
39	0.11
40	0.11
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.11
46	0.09
47	0.07
48	0.11
49	0.1
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.12
54	0.14
55	0.15
56	0.12
57	0.13
58	0.12
59	0.12
60	0.16
61	0.17
62	0.16
63	0.17
64	0.21
65	0.21
66	0.2
67	0.19
68	0.14
69	0.14
70	0.13
71	0.12
72	0.08
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.05
79	0.04
80	0.04
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.11
98	0.14
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.12
103	0.13
104	0.14
105	0.13
106	0.14
107	0.14
108	0.15
109	0.16
110	0.15
111	0.14
112	0.15
113	0.17
114	0.17
115	0.19
116	0.21
117	0.22
118	0.28
119	0.32
120	0.36
121	0.38
122	0.37
123	0.37
124	0.39
125	0.43
126	0.35
127	0.32
128	0.25
129	0.21
130	0.19
131	0.16
132	0.11
133	0.08
134	0.09
135	0.15
136	0.18
137	0.19
138	0.25
139	0.33
140	0.35
141	0.4
142	0.48
143	0.53
144	0.58
145	0.66
146	0.66
147	0.63
148	0.67
149	0.62
150	0.55
151	0.46
152	0.39
153	0.31
154	0.26
155	0.23
156	0.2
157	0.26
158	0.32
159	0.37
160	0.41
161	0.46
162	0.51
163	0.55
164	0.6
165	0.58
166	0.59
167	0.54
168	0.57
169	0.51
170	0.47
171	0.39
172	0.32
173	0.26
174	0.18
175	0.19
176	0.16
177	0.21
178	0.25
179	0.32
180	0.36
181	0.42
182	0.52
183	0.6
184	0.62
185	0.64
186	0.66
187	0.71
188	0.73
189	0.71
190	0.67
191	0.66
192	0.61
193	0.57
194	0.5
195	0.39
196	0.32
197	0.26
198	0.19
199	0.11
200	0.08
201	0.06
202	0.05
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.07
216	0.09
217	0.1
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.13
223	0.12
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.09
231	0.12
232	0.19
233	0.24
234	0.3
235	0.37
236	0.45
237	0.52
238	0.55
239	0.58
240	0.56
241	0.59
242	0.63
243	0.62
244	0.63
245	0.57
246	0.54
247	0.5
248	0.45
249	0.37
250	0.3
251	0.26
252	0.22
253	0.25
254	0.23
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.2
259	0.18
260	0.13
261	0.09
262	0.1
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.09
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.07
280	0.08
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.12
288	0.12
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.16
298	0.18
299	0.18
300	0.24
301	0.24
302	0.23
303	0.21
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.15
313	0.15
314	0.12
315	0.12
316	0.13
317	0.15
318	0.16
319	0.15
320	0.14
321	0.15
322	0.19
323	0.28
324	0.33
325	0.33
326	0.33
327	0.35
328	0.37
329	0.41
330	0.43
331	0.44
332	0.39
333	0.42
334	0.44
335	0.43
336	0.41
337	0.37
338	0.32
339	0.25
340	0.24
341	0.18
342	0.18
343	0.19
344	0.18
345	0.2
346	0.22
347	0.24
348	0.3
349	0.36
350	0.35
351	0.35
352	0.35
353	0.36
354	0.38
355	0.4
356	0.36
357	0.31
358	0.29
359	0.29
360	0.36
361	0.32
362	0.27
363	0.24
364	0.23
365	0.21
366	0.21
367	0.18
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.05
390	0.08
391	0.1
392	0.12
393	0.16
394	0.19
395	0.19
396	0.25
397	0.27
398	0.27
399	0.28
400	0.3
401	0.26
402	0.24
403	0.22
404	0.19
405	0.18
406	0.16
407	0.16
408	0.12
409	0.12
410	0.15
411	0.15
412	0.12
413	0.13
414	0.17
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.17
419	0.18
420	0.18
421	0.16
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.17
436	0.16
437	0.17
438	0.16
439	0.16
440	0.15
441	0.14
442	0.13
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.08
447	0.07
448	0.06
449	0.05
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.1
460	0.11
461	0.16
462	0.17
463	0.18
464	0.18
465	0.19
466	0.19
467	0.19
468	0.17
469	0.11
470	0.1
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.09
478	0.1
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.16
483	0.18
484	0.2
485	0.21
486	0.23
487	0.22
488	0.22
489	0.23
490	0.18
491	0.16
492	0.15
493	0.11
494	0.07
495	0.1
496	0.11
497	0.13
498	0.14
499	0.19
500	0.2
501	0.24
502	0.27
503	0.26
504	0.29
505	0.31
506	0.37
507	0.36
508	0.39
509	0.39
510	0.37
511	0.35
512	0.32
513	0.31
514	0.24
515	0.21
516	0.16
517	0.19
518	0.2
519	0.2
520	0.23
521	0.2
522	0.2
523	0.2
524	0.2
525	0.15
526	0.12
527	0.13
528	0.15
529	0.14
530	0.2
531	0.22
532	0.27
533	0.29
534	0.34
535	0.42
536	0.44
537	0.54
538	0.57
539	0.6
540	0.59
541	0.57
542	0.54
543	0.46
544	0.41
545	0.32
546	0.27
547	0.26
548	0.27
549	0.36
550	0.35
551	0.38
552	0.38
553	0.41
554	0.46
555	0.47
556	0.47
557	0.42
558	0.42
559	0.38
560	0.34
561	0.31
562	0.28
563	0.23
564	0.18
565	0.14
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.1
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.08
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.12
588	0.14
589	0.17

N1PMD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer