Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DPB7

Protein Details
Accession B0DPB7    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-101GHSCYRPRRSGERKRKSVRGCIBasic
183-203VTPIRLQRRRHLNALKRRRIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-95RRSGERKRK
159-205RREVKSAKKEDAKPYTKAPKIQRLVTPIRLQRRRHLNALKRRRIEHQ
219-228RVSEKKAKAA
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 12, nucl 8, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_295206  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MKFNIANPATGAQKLLDLDDEKRYRVFYDKKIAQEVQGDSFGDEWKGYIFRITGGNDKQGFPMKQGVLLPSRVRLLLADGHSCYRPRRSGERKRKSVRGCIVGPDIAVLSLVIVKQGESEIPGLTDTVLPKRLGPKRATKIRSFFNLGKEDDVRKYVVRREVKSAKKEDAKPYTKAPKIQRLVTPIRLQRRRHLNALKRRRIEHQKEQKTEYDALIAKRVSEKKAKAAAIKASHHKATAAATTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.18
6 0.27
7 0.29
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.27
12 0.34
13 0.39
14 0.37
15 0.46
16 0.5
17 0.54
18 0.59
19 0.58
20 0.52
21 0.5
22 0.45
23 0.37
24 0.33
25 0.29
26 0.23
27 0.23
28 0.2
29 0.15
30 0.12
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.14
39 0.16
40 0.21
41 0.23
42 0.3
43 0.3
44 0.3
45 0.32
46 0.35
47 0.33
48 0.28
49 0.33
50 0.26
51 0.27
52 0.27
53 0.28
54 0.23
55 0.27
56 0.25
57 0.2
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.25
73 0.27
74 0.37
75 0.46
76 0.56
77 0.66
78 0.74
79 0.79
80 0.81
81 0.85
82 0.8
83 0.79
84 0.74
85 0.69
86 0.59
87 0.52
88 0.47
89 0.38
90 0.33
91 0.24
92 0.17
93 0.1
94 0.09
95 0.05
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.06
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.19
119 0.24
120 0.29
121 0.32
122 0.4
123 0.47
124 0.56
125 0.59
126 0.57
127 0.56
128 0.55
129 0.56
130 0.52
131 0.46
132 0.43
133 0.43
134 0.38
135 0.36
136 0.34
137 0.32
138 0.27
139 0.26
140 0.21
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.3
145 0.34
146 0.35
147 0.42
148 0.5
149 0.56
150 0.61
151 0.6
152 0.59
153 0.6
154 0.64
155 0.65
156 0.65
157 0.62
158 0.58
159 0.61
160 0.63
161 0.59
162 0.61
163 0.59
164 0.59
165 0.59
166 0.61
167 0.57
168 0.55
169 0.58
170 0.56
171 0.57
172 0.53
173 0.59
174 0.62
175 0.61
176 0.62
177 0.67
178 0.66
179 0.68
180 0.71
181 0.71
182 0.74
183 0.82
184 0.83
185 0.78
186 0.76
187 0.76
188 0.77
189 0.76
190 0.77
191 0.77
192 0.77
193 0.78
194 0.79
195 0.74
196 0.68
197 0.61
198 0.5
199 0.45
200 0.39
201 0.34
202 0.35
203 0.3
204 0.26
205 0.32
206 0.35
207 0.34
208 0.4
209 0.42
210 0.45
211 0.53
212 0.56
213 0.54
214 0.55
215 0.58
216 0.57
217 0.6
218 0.6
219 0.58
220 0.56
221 0.51
222 0.46
223 0.39
224 0.35
225 0.34