Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DAM2

Protein Details
Accession B0DAM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGRTKPKKKAHSKATDPPTQHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-9PKKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_297372  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MGRTKPKKKAHSKATDPPTQHATPSNAPSITSLIEKAQSLIVQCDYDLALRFIHRILEQAPSNAEAKEMLGVALLETGEVEAAKEAFQSLLSPDPKSVPPPSAHLYLAQLSDDDPRSALQHYGAAVTILMGQLKGKDRALDDAGRNDEVEIKSNIVRALVGQVEIWMDPSYDLCFEPEAEKTCEDLLTFALQTDPNNPEALQALASVRMSQQRPDDAKQCLEQAWTAWKDLEADDPKLPPIPNRLALVRLFLELALYTPALLVLHGIMSSDDQDVEAWYLEGWCFFLMSEQAQESGGTLDELTWQELAKDSRDCLETCQVLHRNQEHPDQPLLEHVKELITKLDALGIASSPLEDGNDEEGGEWESIDGSEDEDGDVEME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.85
3 0.77
4 0.71
5 0.68
6 0.58
7 0.51
8 0.46
9 0.44
10 0.43
11 0.44
12 0.45
13 0.37
14 0.36
15 0.35
16 0.32
17 0.27
18 0.22
19 0.19
20 0.16
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.16
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.23
50 0.2
51 0.19
52 0.13
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.14
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.21
83 0.25
84 0.26
85 0.23
86 0.22
87 0.27
88 0.3
89 0.3
90 0.29
91 0.26
92 0.26
93 0.24
94 0.23
95 0.18
96 0.14
97 0.12
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.05
119 0.08
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.19
126 0.22
127 0.24
128 0.22
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.24
133 0.2
134 0.22
135 0.17
136 0.19
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.11
143 0.11
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.16
199 0.22
200 0.26
201 0.28
202 0.32
203 0.29
204 0.31
205 0.3
206 0.29
207 0.23
208 0.2
209 0.17
210 0.13
211 0.18
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.21
219 0.17
220 0.19
221 0.19
222 0.2
223 0.2
224 0.22
225 0.22
226 0.17
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.25
231 0.26
232 0.25
233 0.25
234 0.26
235 0.2
236 0.17
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.17
297 0.16
298 0.2
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.29
303 0.27
304 0.26
305 0.34
306 0.36
307 0.37
308 0.44
309 0.44
310 0.42
311 0.45
312 0.52
313 0.46
314 0.45
315 0.45
316 0.39
317 0.35
318 0.38
319 0.4
320 0.32
321 0.29
322 0.25
323 0.25
324 0.24
325 0.25
326 0.19
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09