Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2Z6C9

Protein Details
Accession M2Z6C9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-371SKDERRVSKGGEKSKRRKSKGGSLVTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-365KTKIKEPGKEAKSSKDERRVSKGGEKSKRRKSKG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_150414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MASKAPPIDEVIHARPEIVDWWVNEMNGQPMDENMIHRYMSESPFFDWSSKNGMYLSQAQNDWNMYELSNNRKGFEDLVRSRNGLEFMIVAEPQPVADKELAAQGVKTGIYVVRKQDRQRIQDNAPRPAGVIIEGQWEITILATYYIVGINVYQAPNVFDIIGNRLLAAASSLNKVIERIHDLPVYDPALGHSYLPQSQTAKATTSGSVAGSPIRSREGSLAPGTDSQSLRSGSVQPASQITTSANSSNYEETRLLADSLRMAIFYGDDFTDENPLIGEPGSFKFSSSHATVKKRRADEEAALAKARAEKDSASTSRATSPKVESSGADAFKTKIKEPGKEAKSSKDERRVSKGGEKSKRRKSKGGSLVTPTTPSSATAVQTPAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.27
3 0.26
4 0.22
5 0.2
6 0.19
7 0.16
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.23
12 0.23
13 0.24
14 0.21
15 0.21
16 0.14
17 0.13
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.2
26 0.2
27 0.22
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.27
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.23
36 0.27
37 0.25
38 0.24
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.3
43 0.31
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.31
48 0.31
49 0.27
50 0.2
51 0.16
52 0.12
53 0.16
54 0.2
55 0.25
56 0.33
57 0.33
58 0.33
59 0.34
60 0.35
61 0.33
62 0.35
63 0.37
64 0.35
65 0.39
66 0.4
67 0.39
68 0.39
69 0.38
70 0.33
71 0.23
72 0.17
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.12
98 0.15
99 0.21
100 0.28
101 0.34
102 0.37
103 0.46
104 0.52
105 0.55
106 0.59
107 0.59
108 0.58
109 0.6
110 0.62
111 0.59
112 0.52
113 0.46
114 0.4
115 0.33
116 0.26
117 0.2
118 0.15
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.06
147 0.07
148 0.1
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.18
171 0.2
172 0.19
173 0.13
174 0.11
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.17
220 0.15
221 0.17
222 0.16
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.18
274 0.19
275 0.25
276 0.29
277 0.39
278 0.46
279 0.53
280 0.6
281 0.59
282 0.6
283 0.59
284 0.57
285 0.51
286 0.53
287 0.5
288 0.44
289 0.4
290 0.37
291 0.32
292 0.3
293 0.28
294 0.19
295 0.16
296 0.15
297 0.18
298 0.26
299 0.26
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.31
304 0.33
305 0.32
306 0.28
307 0.31
308 0.33
309 0.35
310 0.34
311 0.27
312 0.3
313 0.35
314 0.32
315 0.29
316 0.25
317 0.23
318 0.27
319 0.3
320 0.26
321 0.28
322 0.32
323 0.37
324 0.43
325 0.53
326 0.52
327 0.58
328 0.6
329 0.6
330 0.64
331 0.66
332 0.68
333 0.67
334 0.7
335 0.68
336 0.74
337 0.7
338 0.67
339 0.69
340 0.68
341 0.68
342 0.71
343 0.75
344 0.77
345 0.83
346 0.87
347 0.85
348 0.86
349 0.84
350 0.85
351 0.84
352 0.84
353 0.8
354 0.76
355 0.75
356 0.67
357 0.61
358 0.51
359 0.43
360 0.33
361 0.27
362 0.24
363 0.21
364 0.2
365 0.21
366 0.22