Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1Q5L9

Protein Details
Accession N1Q5L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-223FPPMLPRKLRVSRAKAPKKNAKPGTGRPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-225PMLPRKLRVSRAKAPKKNAKPGTGRPTAR
Subcellular Location(s) nucl 10cyto 10cyto_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_22137  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences DEELSKANRTVFLGNVSTAAISSKSSRKSLLNHLASFFEKLPPSKDGTKYKVESIRFRSTPYATAIPKKAAFAKKELMDATTKSTNAYVVYSTEKLAREAVRHLNGTIVLERHLRVDSVAHPAKIDNRRCVFVGNLGFPADIEEGLWRTFSKSGKVESVRVIRDSTTRVGKGIAYVQFEDENAVEQALLLNEKKFPPMLPRKLRVSRAKAPKKNAKPGTGRPTARPSTGTGYQRKLTGAEASQMGRTGKLLGRAAAAKVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.19
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.09
8 0.09
9 0.13
10 0.19
11 0.23
12 0.26
13 0.29
14 0.33
15 0.38
16 0.46
17 0.53
18 0.53
19 0.51
20 0.5
21 0.5
22 0.46
23 0.44
24 0.34
25 0.28
26 0.24
27 0.24
28 0.26
29 0.25
30 0.29
31 0.33
32 0.4
33 0.44
34 0.46
35 0.53
36 0.52
37 0.56
38 0.58
39 0.56
40 0.57
41 0.56
42 0.6
43 0.53
44 0.53
45 0.51
46 0.46
47 0.44
48 0.4
49 0.39
50 0.32
51 0.38
52 0.38
53 0.37
54 0.36
55 0.35
56 0.38
57 0.37
58 0.37
59 0.35
60 0.38
61 0.36
62 0.38
63 0.36
64 0.3
65 0.26
66 0.25
67 0.26
68 0.22
69 0.2
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.15
75 0.1
76 0.09
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.16
86 0.19
87 0.25
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.17
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.24
111 0.31
112 0.33
113 0.32
114 0.32
115 0.34
116 0.34
117 0.34
118 0.28
119 0.24
120 0.23
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.09
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.05
135 0.07
136 0.1
137 0.11
138 0.15
139 0.16
140 0.18
141 0.24
142 0.27
143 0.27
144 0.3
145 0.34
146 0.31
147 0.3
148 0.29
149 0.23
150 0.23
151 0.24
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.12
168 0.11
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.22
184 0.32
185 0.41
186 0.48
187 0.53
188 0.61
189 0.68
190 0.76
191 0.75
192 0.74
193 0.73
194 0.75
195 0.8
196 0.79
197 0.82
198 0.83
199 0.83
200 0.86
201 0.83
202 0.8
203 0.78
204 0.8
205 0.79
206 0.78
207 0.71
208 0.66
209 0.68
210 0.63
211 0.56
212 0.48
213 0.43
214 0.41
215 0.46
216 0.48
217 0.46
218 0.48
219 0.48
220 0.48
221 0.45
222 0.39
223 0.34
224 0.31
225 0.26
226 0.24
227 0.25
228 0.24
229 0.24
230 0.26
231 0.24
232 0.19
233 0.18
234 0.19
235 0.18
236 0.24
237 0.25
238 0.23
239 0.26
240 0.28
241 0.3