FuNGI

A0A1D8PMH3

Protein Details

Accession

A0A1D8PMH3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
777-800	SSQGSQSRSGSQPKKKRKKKGGFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
788-799	QPKKKRKKKGGF

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0001179 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor binding GO:0001163 F:RNA polymerase I transcription regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
KEGG	cal:CAALFM_C406090CA -
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MWPHKKGLGNRLSYGVYGNAIVSIDSVIEAQNQDQSANTNITIPHNDFEMSKKSIPMMFPRLNDETVELTPKQNSNQELVENQISKFNINSSMANTINSPINPPKGKLPKELSNNTYIPQDIIRAYMFESKSLTSNMAYDPIHGDLLQTFDIFVKSEDAYVDSMTFVTGESSSILNITTYESKDDCIVLSPAYQIDFCDPILQIEVSDKIDGVGLVAVRTGAKVYILNICLDKLTYIEVIPNVVLFVLGEISADCLAGNVLADVRFSSNDSRKVAVVDIKGNLTVWYVNKTVPSIRKFIKEQFVKELSDSQSLSNWRRICWLPSCDHLLIISRVEILKVMPNSESSGKIIVTSNTWSRIRDVNVVDEYMFLLTSKELIWFSANDSMTRLLSWKHFLDDSDPSLKFKVVETSPKVFTCFLYSQVNPLVIVYSFGFKGNKPYSLRDPYYFRKSSDNYDLRQINITKTEDALLIFELTTGLAIHSRRLISKNENDISNSSFHSKLVDSSVNKHRTNYLKQFSKKEIKKMIPQFLNIGEHDCTTASQQIDLIQRYAYELGNGFAQMGNSQAAQQSNYFSLYEVCNSVPLGVTDLLELDDMIVQLENSLPPERLKVKSLINNSFIRRNKFINKKETNTHIYDIYQMLEQIYPTHNKPSSKLAASILIGLSLIKCQYESDDLQEKLQKSIANAPEKVQTLLNEWDEEDNDDNSQTEGLTPTQHDSQFMIPTIKSSIPALRVNSQPSLRQQVLTQNSQTQTLLPSSLNSTVPSISSFPSQRSISSQGSQSRSGSQPKKKRKKKGGFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.31
3	0.22
4	0.17
5	0.15
6	0.12
7	0.11
8	0.1
9	0.09
10	0.08
11	0.07
12	0.06
13	0.07
14	0.06
15	0.09
16	0.1
17	0.1
18	0.14
19	0.14
20	0.14
21	0.14
22	0.16
23	0.18
24	0.19
25	0.18
26	0.17
27	0.19
28	0.23
29	0.27
30	0.27
31	0.24
32	0.24
33	0.24
34	0.23
35	0.26
36	0.28
37	0.28
38	0.27
39	0.28
40	0.29
41	0.32
42	0.35
43	0.38
44	0.41
45	0.41
46	0.41
47	0.46
48	0.47
49	0.45
50	0.42
51	0.36
52	0.3
53	0.27
54	0.3
55	0.24
56	0.23
57	0.27
58	0.28
59	0.3
60	0.32
61	0.33
62	0.32
63	0.33
64	0.34
65	0.3
66	0.33
67	0.35
68	0.31
69	0.29
70	0.3
71	0.28
72	0.26
73	0.25
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.22
78	0.2
79	0.25
80	0.25
81	0.25
82	0.24
83	0.21
84	0.23
85	0.22
86	0.24
87	0.24
88	0.32
89	0.33
90	0.35
91	0.42
92	0.48
93	0.52
94	0.56
95	0.58
96	0.59
97	0.66
98	0.72
99	0.65
100	0.62
101	0.6
102	0.52
103	0.47
104	0.38
105	0.3
106	0.23
107	0.21
108	0.15
109	0.16
110	0.15
111	0.13
112	0.15
113	0.21
114	0.2
115	0.19
116	0.2
117	0.19
118	0.21
119	0.22
120	0.21
121	0.14
122	0.16
123	0.16
124	0.18
125	0.17
126	0.16
127	0.17
128	0.17
129	0.17
130	0.15
131	0.14
132	0.11
133	0.13
134	0.12
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.06
164	0.09
165	0.12
166	0.12
167	0.15
168	0.16
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.14
173	0.13
174	0.13
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.09
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.11
187	0.11
188	0.13
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.06
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.04
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.12
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.14
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.07
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.08
254	0.14
255	0.19
256	0.24
257	0.26
258	0.27
259	0.26
260	0.27
261	0.27
262	0.25
263	0.22
264	0.2
265	0.19
266	0.19
267	0.18
268	0.17
269	0.15
270	0.12
271	0.11
272	0.09
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.19
279	0.24
280	0.25
281	0.27
282	0.3
283	0.34
284	0.37
285	0.41
286	0.46
287	0.43
288	0.43
289	0.45
290	0.45
291	0.41
292	0.38
293	0.38
294	0.3
295	0.29
296	0.27
297	0.2
298	0.2
299	0.24
300	0.26
301	0.27
302	0.26
303	0.23
304	0.27
305	0.28
306	0.28
307	0.3
308	0.32
309	0.28
310	0.3
311	0.35
312	0.3
313	0.29
314	0.25
315	0.21
316	0.18
317	0.16
318	0.13
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.06
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.11
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.11
333	0.12
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.1
338	0.1
339	0.12
340	0.13
341	0.16
342	0.17
343	0.17
344	0.18
345	0.21
346	0.22
347	0.25
348	0.24
349	0.23
350	0.23
351	0.22
352	0.2
353	0.17
354	0.15
355	0.1
356	0.09
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.08
377	0.09
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.15
384	0.16
385	0.17
386	0.19
387	0.19
388	0.18
389	0.18
390	0.19
391	0.16
392	0.14
393	0.16
394	0.13
395	0.2
396	0.23
397	0.26
398	0.28
399	0.28
400	0.29
401	0.24
402	0.23
403	0.22
404	0.18
405	0.18
406	0.19
407	0.19
408	0.19
409	0.2
410	0.2
411	0.14
412	0.14
413	0.11
414	0.07
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.09
421	0.08
422	0.16
423	0.17
424	0.22
425	0.24
426	0.27
427	0.33
428	0.4
429	0.42
430	0.37
431	0.42
432	0.42
433	0.48
434	0.46
435	0.4
436	0.4
437	0.4
438	0.42
439	0.46
440	0.44
441	0.37
442	0.42
443	0.42
444	0.36
445	0.38
446	0.34
447	0.25
448	0.25
449	0.25
450	0.19
451	0.18
452	0.18
453	0.14
454	0.13
455	0.12
456	0.08
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.09
469	0.1
470	0.12
471	0.15
472	0.19
473	0.23
474	0.3
475	0.37
476	0.38
477	0.38
478	0.37
479	0.36
480	0.34
481	0.28
482	0.23
483	0.18
484	0.16
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.13
489	0.15
490	0.19
491	0.18
492	0.24
493	0.33
494	0.39
495	0.39
496	0.39
497	0.42
498	0.43
499	0.51
500	0.53
501	0.53
502	0.54
503	0.59
504	0.64
505	0.66
506	0.7
507	0.66
508	0.65
509	0.65
510	0.61
511	0.65
512	0.68
513	0.69
514	0.61
515	0.58
516	0.51
517	0.45
518	0.43
519	0.33
520	0.28
521	0.2
522	0.17
523	0.16
524	0.14
525	0.12
526	0.1
527	0.14
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.15
532	0.19
533	0.2
534	0.19
535	0.15
536	0.15
537	0.16
538	0.17
539	0.13
540	0.1
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.11
557	0.12
558	0.12
559	0.14
560	0.13
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.1
571	0.09
572	0.1
573	0.09
574	0.09
575	0.08
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.07
590	0.09
591	0.09
592	0.1
593	0.16
594	0.2
595	0.22
596	0.24
597	0.27
598	0.32
599	0.38
600	0.46
601	0.47
602	0.48
603	0.51
604	0.51
605	0.56
606	0.54
607	0.53
608	0.49
609	0.49
610	0.54
611	0.59
612	0.64
613	0.66
614	0.69
615	0.69
616	0.72
617	0.73
618	0.69
619	0.63
620	0.57
621	0.47
622	0.4
623	0.37
624	0.3
625	0.24
626	0.18
627	0.14
628	0.13
629	0.12
630	0.11
631	0.11
632	0.13
633	0.16
634	0.17
635	0.25
636	0.28
637	0.29
638	0.32
639	0.38
640	0.42
641	0.4
642	0.41
643	0.35
644	0.34
645	0.33
646	0.33
647	0.24
648	0.17
649	0.15
650	0.12
651	0.11
652	0.08
653	0.08
654	0.06
655	0.07
656	0.07
657	0.1
658	0.15
659	0.16
660	0.21
661	0.28
662	0.29
663	0.32
664	0.38
665	0.36
666	0.33
667	0.34
668	0.3
669	0.25
670	0.33
671	0.37
672	0.39
673	0.39
674	0.39
675	0.42
676	0.42
677	0.41
678	0.34
679	0.27
680	0.24
681	0.29
682	0.29
683	0.24
684	0.23
685	0.23
686	0.22
687	0.24
688	0.21
689	0.17
690	0.16
691	0.16
692	0.15
693	0.14
694	0.13
695	0.1
696	0.09
697	0.1
698	0.1
699	0.12
700	0.13
701	0.17
702	0.22
703	0.23
704	0.23
705	0.23
706	0.26
707	0.26
708	0.27
709	0.26
710	0.2
711	0.22
712	0.24
713	0.23
714	0.2
715	0.2
716	0.22
717	0.24
718	0.29
719	0.32
720	0.34
721	0.38
722	0.41
723	0.44
724	0.43
725	0.42
726	0.44
727	0.48
728	0.44
729	0.41
730	0.39
731	0.42
732	0.46
733	0.47
734	0.44
735	0.43
736	0.42
737	0.43
738	0.41
739	0.33
740	0.29
741	0.25
742	0.23
743	0.17
744	0.17
745	0.19
746	0.22
747	0.22
748	0.2
749	0.2
750	0.19
751	0.19
752	0.2
753	0.18
754	0.17
755	0.22
756	0.23
757	0.24
758	0.3
759	0.31
760	0.3
761	0.34
762	0.38
763	0.37
764	0.39
765	0.43
766	0.45
767	0.48
768	0.5
769	0.46
770	0.45
771	0.46
772	0.53
773	0.55
774	0.58
775	0.65
776	0.73
777	0.82
778	0.86
779	0.92
780	0.93

A0A1D8PMH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer