Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CSS3

Protein Details
Accession B0CSS3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
953-972LEPSQVIKVKRQKHRVIDMTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR004179  Sec63-dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_306118  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF02889  Sec63  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MAVVYPQLFVLANRLVFPIQHEPYHLRDITQDGYQDDVEQEAIPLRSQRSEIEMSYFQDDDEFLNPPSATLLDHRPYLGHELADHTPPEFLPGSGEYTYPFHSRRPHGRDIACEEKEGHAQAGELPNGQKLHRSRLRSVSELPDVYRGIFKFGIFNAIQSVCFDEIFKSDVNMVKGRRDDLFSPYSVFSTRSSVVIYLSHSSSCSDSFPAPTGSGKTVLFELAIIRMLVHNKSDRQSKCIYIAPTKALCSERYRDWSSKFDSIGFKCCEFTGDTVVFGGNVWGDAKDASIIIATAEKWDSLTRNWRDHSQILSRVHLFLVDEVHILNESRGSTLEVITSRMKMRGSCMRFVLVSATVPNIQDVASWIGNGSDVASPAKVFEFGEEFRPCKLTRHVIGVPRRKEHNDFQFAKMLDYKLFSVLQQYSVGKPILVFCSTRKGVFDTAEQLMKEFVETEQKKLTLPWSRPPGLTTFGTSLKLILSELVKYGIGVHHAGINLDDRRTIEDLYLRKSLRILVATSTLAVGVNLPAHMVVIKGVRTFQNNASVEYSDLDIVQMLGRAGRPQFDKDGIAIIMCEKDLEGKYEALVQGKNVLESSLHLTLSEHINSEIDLGTITDLESAKSWLRGSFLFQRIRKNPNFYALGKEDDQTWQERVDDVVMRSVMKLRDTHLVSYIDKGAEAGKLTCTEYGEIMSKFYIRQATMSLILNLPDHPSLREMAGRYCYQKNYQLIFCQLETISTAEEVSGRRRKPSVANCFAQLLLSFPQIYNKLRNHLDIRFEVKKIEKTSDKAFLLIQAVLGGIGLKTEFKGTDSQPYLEALSLFRHAPRIARAVVEVAVAKKVGTQVKHGLELVRCLTAKAWEDRPIVLKQVEHIGEKSIKVLAEHGIASLCALRSQTPLRIETLLNRRPPFGLEVLACANELPQYRLNITELGMRSSAGKGPIEVDISIDCSLLEPSQVIKVKRQKHRVIDMTAVLTLTSTSDFIDFRRIPTKVLKGRKTFEITANLTKPSQSIIVIISSESVAGSSVQRIHKPTIPVTEFPVLDTRPLSSIESDLVGLEDDPDFWNMRIDDSENEFVFSKDGSKRKSFLFFPTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.18
4 0.23
5 0.27
6 0.27
7 0.28
8 0.31
9 0.33
10 0.38
11 0.45
12 0.4
13 0.32
14 0.31
15 0.34
16 0.32
17 0.32
18 0.29
19 0.22
20 0.24
21 0.24
22 0.22
23 0.18
24 0.16
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.17
32 0.19
33 0.2
34 0.22
35 0.23
36 0.25
37 0.28
38 0.28
39 0.3
40 0.31
41 0.31
42 0.33
43 0.32
44 0.25
45 0.22
46 0.22
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.23
59 0.22
60 0.24
61 0.24
62 0.24
63 0.26
64 0.3
65 0.28
66 0.21
67 0.19
68 0.23
69 0.25
70 0.27
71 0.25
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.21
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.24
87 0.24
88 0.25
89 0.33
90 0.42
91 0.51
92 0.56
93 0.62
94 0.66
95 0.68
96 0.7
97 0.7
98 0.71
99 0.62
100 0.56
101 0.48
102 0.42
103 0.42
104 0.36
105 0.28
106 0.18
107 0.17
108 0.2
109 0.23
110 0.21
111 0.2
112 0.19
113 0.23
114 0.24
115 0.24
116 0.27
117 0.25
118 0.35
119 0.4
120 0.45
121 0.48
122 0.56
123 0.62
124 0.59
125 0.61
126 0.57
127 0.56
128 0.52
129 0.46
130 0.41
131 0.35
132 0.32
133 0.32
134 0.25
135 0.23
136 0.22
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.25
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.17
147 0.2
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.14
155 0.12
156 0.14
157 0.18
158 0.21
159 0.25
160 0.26
161 0.29
162 0.32
163 0.33
164 0.32
165 0.32
166 0.3
167 0.31
168 0.33
169 0.28
170 0.29
171 0.27
172 0.27
173 0.24
174 0.23
175 0.18
176 0.2
177 0.2
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.21
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.18
218 0.21
219 0.27
220 0.35
221 0.35
222 0.38
223 0.41
224 0.4
225 0.4
226 0.42
227 0.41
228 0.38
229 0.4
230 0.41
231 0.39
232 0.36
233 0.37
234 0.33
235 0.32
236 0.31
237 0.32
238 0.32
239 0.38
240 0.43
241 0.43
242 0.45
243 0.48
244 0.49
245 0.49
246 0.44
247 0.41
248 0.43
249 0.4
250 0.44
251 0.4
252 0.35
253 0.31
254 0.3
255 0.28
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.14
264 0.12
265 0.11
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.06
280 0.05
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.24
289 0.28
290 0.34
291 0.36
292 0.39
293 0.42
294 0.43
295 0.45
296 0.42
297 0.44
298 0.4
299 0.42
300 0.39
301 0.35
302 0.32
303 0.27
304 0.2
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.11
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.16
330 0.21
331 0.27
332 0.3
333 0.31
334 0.31
335 0.3
336 0.29
337 0.29
338 0.26
339 0.17
340 0.14
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.1
369 0.1
370 0.17
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.22
375 0.22
376 0.22
377 0.27
378 0.27
379 0.27
380 0.34
381 0.37
382 0.42
383 0.51
384 0.56
385 0.56
386 0.53
387 0.56
388 0.52
389 0.53
390 0.54
391 0.54
392 0.55
393 0.53
394 0.52
395 0.53
396 0.49
397 0.45
398 0.4
399 0.31
400 0.22
401 0.2
402 0.18
403 0.14
404 0.14
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.14
412 0.17
413 0.17
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.11
421 0.19
422 0.2
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.21
429 0.17
430 0.18
431 0.2
432 0.19
433 0.16
434 0.15
435 0.13
436 0.11
437 0.08
438 0.07
439 0.15
440 0.16
441 0.18
442 0.2
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.27
447 0.24
448 0.27
449 0.32
450 0.37
451 0.38
452 0.38
453 0.39
454 0.35
455 0.31
456 0.28
457 0.23
458 0.18
459 0.17
460 0.18
461 0.17
462 0.15
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.11
486 0.09
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.1
491 0.14
492 0.16
493 0.19
494 0.24
495 0.22
496 0.21
497 0.21
498 0.22
499 0.19
500 0.18
501 0.15
502 0.11
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.11
507 0.09
508 0.07
509 0.06
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.03
519 0.04
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.09
525 0.11
526 0.13
527 0.14
528 0.22
529 0.22
530 0.23
531 0.23
532 0.22
533 0.21
534 0.19
535 0.18
536 0.09
537 0.08
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.06
547 0.06
548 0.09
549 0.1
550 0.12
551 0.14
552 0.15
553 0.15
554 0.14
555 0.15
556 0.12
557 0.1
558 0.09
559 0.07
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.03
564 0.06
565 0.07
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.12
571 0.13
572 0.12
573 0.12
574 0.1
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.11
579 0.1
580 0.08
581 0.09
582 0.13
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.14
589 0.13
590 0.1
591 0.08
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.07
596 0.05
597 0.05
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.09
609 0.1
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.14
614 0.21
615 0.27
616 0.33
617 0.36
618 0.44
619 0.48
620 0.56
621 0.55
622 0.54
623 0.48
624 0.47
625 0.49
626 0.41
627 0.42
628 0.36
629 0.35
630 0.29
631 0.28
632 0.22
633 0.2
634 0.2
635 0.16
636 0.15
637 0.13
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.13
643 0.11
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.15
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.14
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.23
657 0.24
658 0.23
659 0.24
660 0.24
661 0.17
662 0.15
663 0.14
664 0.11
665 0.09
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.11
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.1
682 0.12
683 0.14
684 0.11
685 0.12
686 0.12
687 0.14
688 0.16
689 0.17
690 0.16
691 0.13
692 0.13
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.1
698 0.1
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.14
703 0.13
704 0.15
705 0.18
706 0.19
707 0.23
708 0.25
709 0.27
710 0.28
711 0.33
712 0.36
713 0.36
714 0.37
715 0.35
716 0.35
717 0.35
718 0.31
719 0.27
720 0.21
721 0.17
722 0.16
723 0.13
724 0.1
725 0.08
726 0.08
727 0.06
728 0.08
729 0.09
730 0.16
731 0.22
732 0.22
733 0.26
734 0.27
735 0.3
736 0.38
737 0.47
738 0.5
739 0.5
740 0.51
741 0.49
742 0.49
743 0.46
744 0.37
745 0.27
746 0.18
747 0.13
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.14
752 0.17
753 0.2
754 0.25
755 0.26
756 0.31
757 0.32
758 0.37
759 0.38
760 0.38
761 0.4
762 0.36
763 0.41
764 0.38
765 0.37
766 0.36
767 0.35
768 0.38
769 0.36
770 0.39
771 0.36
772 0.37
773 0.41
774 0.46
775 0.42
776 0.36
777 0.34
778 0.3
779 0.27
780 0.23
781 0.18
782 0.1
783 0.09
784 0.08
785 0.08
786 0.05
787 0.03
788 0.03
789 0.03
790 0.04
791 0.04
792 0.05
793 0.06
794 0.07
795 0.12
796 0.13
797 0.22
798 0.24
799 0.25
800 0.24
801 0.25
802 0.25
803 0.21
804 0.2
805 0.12
806 0.11
807 0.12
808 0.12
809 0.12
810 0.14
811 0.14
812 0.16
813 0.19
814 0.22
815 0.21
816 0.21
817 0.21
818 0.19
819 0.19
820 0.18
821 0.15
822 0.12
823 0.12
824 0.11
825 0.1
826 0.1
827 0.14
828 0.17
829 0.17
830 0.21
831 0.28
832 0.3
833 0.33
834 0.32
835 0.32
836 0.28
837 0.31
838 0.27
839 0.23
840 0.21
841 0.19
842 0.19
843 0.2
844 0.23
845 0.24
846 0.27
847 0.3
848 0.32
849 0.33
850 0.37
851 0.34
852 0.34
853 0.3
854 0.27
855 0.21
856 0.27
857 0.27
858 0.25
859 0.24
860 0.24
861 0.25
862 0.25
863 0.24
864 0.19
865 0.17
866 0.16
867 0.17
868 0.14
869 0.14
870 0.14
871 0.13
872 0.11
873 0.1
874 0.11
875 0.11
876 0.09
877 0.08
878 0.09
879 0.09
880 0.13
881 0.17
882 0.22
883 0.24
884 0.25
885 0.27
886 0.29
887 0.28
888 0.33
889 0.4
890 0.41
891 0.45
892 0.44
893 0.43
894 0.42
895 0.43
896 0.38
897 0.3
898 0.27
899 0.2
900 0.22
901 0.22
902 0.22
903 0.2
904 0.15
905 0.14
906 0.13
907 0.14
908 0.14
909 0.16
910 0.18
911 0.19
912 0.21
913 0.23
914 0.2
915 0.2
916 0.23
917 0.21
918 0.21
919 0.2
920 0.18
921 0.18
922 0.19
923 0.21
924 0.17
925 0.17
926 0.15
927 0.16
928 0.18
929 0.18
930 0.16
931 0.15
932 0.12
933 0.15
934 0.15
935 0.13
936 0.11
937 0.09
938 0.11
939 0.09
940 0.09
941 0.07
942 0.08
943 0.16
944 0.21
945 0.22
946 0.3
947 0.39
948 0.48
949 0.58
950 0.67
951 0.68
952 0.73
953 0.81
954 0.8
955 0.76
956 0.72
957 0.65
958 0.57
959 0.48
960 0.39
961 0.28
962 0.2
963 0.15
964 0.11
965 0.08
966 0.07
967 0.07
968 0.08
969 0.09
970 0.1
971 0.2
972 0.19
973 0.23
974 0.3
975 0.3
976 0.32
977 0.4
978 0.49
979 0.49
980 0.59
981 0.64
982 0.64
983 0.68
984 0.73
985 0.72
986 0.66
987 0.63
988 0.61
989 0.58
990 0.58
991 0.56
992 0.51
993 0.44
994 0.41
995 0.35
996 0.28
997 0.25
998 0.16
999 0.15
1000 0.14
1001 0.15
1002 0.15
1003 0.15
1004 0.13
1005 0.11
1006 0.11
1007 0.09
1008 0.07
1009 0.06
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.1
1013 0.17
1014 0.21
1015 0.26
1016 0.3
1017 0.34
1018 0.38
1019 0.42
1020 0.44
1021 0.48
1022 0.48
1023 0.46
1024 0.48
1025 0.49
1026 0.43
1027 0.4
1028 0.41
1029 0.31
1030 0.29
1031 0.28
1032 0.24
1033 0.19
1034 0.21
1035 0.22
1036 0.17
1037 0.18
1038 0.17
1039 0.17
1040 0.16
1041 0.14
1042 0.13
1043 0.11
1044 0.1
1045 0.09
1046 0.08
1047 0.08
1048 0.1
1049 0.11
1050 0.13
1051 0.12
1052 0.18
1053 0.17
1054 0.18
1055 0.2
1056 0.21
1057 0.24
1058 0.28
1059 0.34
1060 0.29
1061 0.31
1062 0.3
1063 0.27
1064 0.26
1065 0.22
1066 0.22
1067 0.24
1068 0.31
1069 0.36
1070 0.41
1071 0.44
1072 0.49
1073 0.55
1074 0.52