Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5APM7

Protein Details
Accession Q5APM7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
616-641NNRNNDWSYQNKNRYNNNNNRQTERSHydrophilic
644-668SDRKSHNDWKYEKKFEHRRIRDHDEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 12.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cal:CAALFM_C108810CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MLKQLSRSLGIRSSPIVANLIRSKQVCTRGFHISLVKQNTSSKVNEITDITSDSLKVKEDAAGSDLPSTKTDKKSKSESFQPVKFEDFKGKGYIHDSIINSLHKNDFKELTPIQQKSLVPIFNTEKGLVCRAKTGTGKTLAFAVPTLQYAYKNRGKGVSTVVLVPTRDLAFQIEEEYRKLISHLKYNERPNLELIIGGQRTSFNPRRPAEIVIATPGRLEKELQTDRKLAKCFSNVTYRIYDEADRLLDVGFESVLNEIDGLLYKVRTTPKPIKSLLFSATVDEAISEFSKKHIHPEYEFLNTVTKDDLEIPENIHQQLIECTDGIDKVNVSLSELHGIMKQHNDYKVIVFLPTKTAVDWFYEYITNALDDELFELFSKPPRVFMLHGGRSVRQRSAALKGFKVAKKGILISTDVAARGIDVKDVTNVMQMFPSVEIADYIHKVGRTGRAGKKGKASLFATPAELPYVSLLKRKRKVKFQEVIQSEKLNSSNIIDQIESPLDSTKEFLATMVGYLQQLQSAHRLDYDSLVIENMELYRKLVRDDKAMLESRILSRIGKGISAHVKRRYFTRTRYQSHDDAEFDSYSDFSRSGMSQRPRSNDRSSKMTFNGRGKYGNNRNNDWSYQNKNRYNNNNNRQTERSYDSDRKSHNDWKYEKKFEHRRIRDHDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.28
4 0.23
5 0.28
6 0.31
7 0.33
8 0.34
9 0.34
10 0.37
11 0.4
12 0.49
13 0.47
14 0.47
15 0.48
16 0.5
17 0.51
18 0.51
19 0.51
20 0.47
21 0.5
22 0.52
23 0.49
24 0.44
25 0.46
26 0.47
27 0.45
28 0.41
29 0.37
30 0.37
31 0.36
32 0.36
33 0.34
34 0.31
35 0.28
36 0.28
37 0.26
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.22
52 0.23
53 0.21
54 0.21
55 0.26
56 0.3
57 0.37
58 0.46
59 0.49
60 0.53
61 0.62
62 0.69
63 0.71
64 0.74
65 0.75
66 0.75
67 0.73
68 0.71
69 0.64
70 0.61
71 0.56
72 0.49
73 0.47
74 0.42
75 0.39
76 0.39
77 0.36
78 0.33
79 0.34
80 0.35
81 0.28
82 0.31
83 0.29
84 0.28
85 0.32
86 0.32
87 0.29
88 0.28
89 0.31
90 0.29
91 0.31
92 0.31
93 0.3
94 0.29
95 0.35
96 0.33
97 0.37
98 0.42
99 0.41
100 0.39
101 0.42
102 0.41
103 0.39
104 0.44
105 0.37
106 0.28
107 0.33
108 0.36
109 0.34
110 0.36
111 0.31
112 0.29
113 0.28
114 0.34
115 0.3
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.31
120 0.32
121 0.34
122 0.34
123 0.38
124 0.38
125 0.33
126 0.35
127 0.3
128 0.26
129 0.22
130 0.17
131 0.12
132 0.12
133 0.14
134 0.11
135 0.15
136 0.17
137 0.25
138 0.29
139 0.3
140 0.31
141 0.33
142 0.34
143 0.33
144 0.36
145 0.33
146 0.28
147 0.27
148 0.27
149 0.25
150 0.24
151 0.21
152 0.18
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.19
168 0.19
169 0.26
170 0.32
171 0.4
172 0.47
173 0.54
174 0.59
175 0.55
176 0.54
177 0.47
178 0.43
179 0.33
180 0.26
181 0.21
182 0.21
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.15
188 0.23
189 0.29
190 0.28
191 0.37
192 0.38
193 0.44
194 0.45
195 0.46
196 0.41
197 0.38
198 0.32
199 0.28
200 0.27
201 0.21
202 0.2
203 0.17
204 0.15
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.19
209 0.27
210 0.3
211 0.33
212 0.37
213 0.4
214 0.44
215 0.44
216 0.37
217 0.34
218 0.34
219 0.34
220 0.33
221 0.38
222 0.34
223 0.36
224 0.36
225 0.32
226 0.3
227 0.28
228 0.26
229 0.17
230 0.17
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.13
254 0.14
255 0.22
256 0.3
257 0.36
258 0.42
259 0.44
260 0.43
261 0.42
262 0.44
263 0.38
264 0.32
265 0.26
266 0.21
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.11
271 0.09
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.07
277 0.12
278 0.12
279 0.18
280 0.23
281 0.26
282 0.26
283 0.31
284 0.32
285 0.31
286 0.31
287 0.25
288 0.23
289 0.2
290 0.19
291 0.15
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.14
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.1
365 0.13
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.24
372 0.3
373 0.3
374 0.33
375 0.33
376 0.34
377 0.37
378 0.38
379 0.31
380 0.23
381 0.22
382 0.22
383 0.27
384 0.32
385 0.3
386 0.28
387 0.31
388 0.36
389 0.36
390 0.37
391 0.31
392 0.26
393 0.25
394 0.27
395 0.25
396 0.19
397 0.19
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.18
433 0.21
434 0.29
435 0.34
436 0.43
437 0.47
438 0.5
439 0.55
440 0.55
441 0.52
442 0.5
443 0.46
444 0.4
445 0.39
446 0.36
447 0.31
448 0.25
449 0.24
450 0.19
451 0.17
452 0.13
453 0.1
454 0.12
455 0.11
456 0.16
457 0.23
458 0.31
459 0.39
460 0.48
461 0.53
462 0.61
463 0.7
464 0.75
465 0.76
466 0.74
467 0.77
468 0.72
469 0.72
470 0.64
471 0.56
472 0.46
473 0.41
474 0.33
475 0.24
476 0.21
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.17
481 0.15
482 0.14
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.16
510 0.18
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.13
525 0.13
526 0.17
527 0.22
528 0.24
529 0.27
530 0.3
531 0.33
532 0.36
533 0.39
534 0.37
535 0.32
536 0.32
537 0.29
538 0.28
539 0.25
540 0.19
541 0.17
542 0.21
543 0.19
544 0.19
545 0.18
546 0.21
547 0.3
548 0.37
549 0.43
550 0.47
551 0.51
552 0.5
553 0.55
554 0.57
555 0.56
556 0.57
557 0.6
558 0.62
559 0.64
560 0.71
561 0.72
562 0.69
563 0.65
564 0.62
565 0.52
566 0.45
567 0.42
568 0.34
569 0.27
570 0.22
571 0.18
572 0.15
573 0.14
574 0.12
575 0.09
576 0.11
577 0.12
578 0.16
579 0.25
580 0.32
581 0.4
582 0.46
583 0.54
584 0.58
585 0.63
586 0.69
587 0.69
588 0.66
589 0.65
590 0.63
591 0.62
592 0.61
593 0.64
594 0.62
595 0.61
596 0.62
597 0.56
598 0.58
599 0.54
600 0.59
601 0.6
602 0.59
603 0.58
604 0.57
605 0.61
606 0.61
607 0.61
608 0.56
609 0.53
610 0.56
611 0.6
612 0.65
613 0.66
614 0.68
615 0.75
616 0.8
617 0.83
618 0.84
619 0.85
620 0.85
621 0.82
622 0.81
623 0.76
624 0.7
625 0.66
626 0.6
627 0.56
628 0.55
629 0.58
630 0.57
631 0.61
632 0.61
633 0.6
634 0.62
635 0.65
636 0.64
637 0.65
638 0.66
639 0.69
640 0.74
641 0.78
642 0.77
643 0.79
644 0.82
645 0.83
646 0.87
647 0.85
648 0.85