Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D4E5

Protein Details
Accession B0D4E5    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-64IAEPTPKRTRRVIKKSVESDPPEPRVQRPRRAAAKKNTGEHydrophilic
69-91PDEPPTKKTRVRKSKASQPQPDAHydrophilic
338-357VRQPKPTSSSPSKRKGPYLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-63KRTRRVIKKSVESDPPEPRVQRPRRAAAKKNTG
72-83PPTKKTRVRKSK
109-114SKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_317100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MARGKRKVDVEVEGDAVEGSSTAEIAEPTPKRTRRVIKKSVESDPPEPRVQRPRRAAAKKNTGEATTPPDEPPTKKTRVRKSKASQPQPDAEAGPSSAAGPSSSQAPPSKKKKAPASSAPEGRGATFLASCPQNIQDRVGRVMTQRFFMIERRRNGDELQEEFSVLGSTGNVYTVTIGRKPKCNCPDTIRGNHCKHIMFVFLKVLQVPQTSNLWYQKGLLTSELETIFARAPLAPNDVTNPRLREAYDRALGRPSTSTAPAAAPESPTGKKRIPGPEDDCPICYDGMEGAAEASLVFCDECGNALHQECFEQWRQTSQNKGKELTCVWCRSPWATPAVRQPKPTSSSPSKRKGPYLNLGIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.23
3 0.18
4 0.12
5 0.08
6 0.06
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.15
14 0.16
15 0.22
16 0.32
17 0.36
18 0.4
19 0.49
20 0.59
21 0.62
22 0.71
23 0.76
24 0.77
25 0.83
26 0.85
27 0.83
28 0.81
29 0.76
30 0.72
31 0.7
32 0.65
33 0.61
34 0.57
35 0.57
36 0.59
37 0.61
38 0.64
39 0.64
40 0.68
41 0.73
42 0.8
43 0.83
44 0.82
45 0.85
46 0.79
47 0.77
48 0.7
49 0.6
50 0.53
51 0.46
52 0.43
53 0.35
54 0.33
55 0.27
56 0.29
57 0.31
58 0.32
59 0.36
60 0.37
61 0.41
62 0.47
63 0.56
64 0.62
65 0.7
66 0.74
67 0.78
68 0.79
69 0.82
70 0.86
71 0.86
72 0.84
73 0.79
74 0.76
75 0.67
76 0.61
77 0.51
78 0.41
79 0.32
80 0.23
81 0.17
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.1
90 0.11
91 0.14
92 0.19
93 0.25
94 0.34
95 0.42
96 0.52
97 0.52
98 0.6
99 0.67
100 0.7
101 0.72
102 0.73
103 0.72
104 0.71
105 0.71
106 0.65
107 0.57
108 0.49
109 0.41
110 0.32
111 0.23
112 0.16
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.22
125 0.24
126 0.24
127 0.22
128 0.2
129 0.25
130 0.23
131 0.21
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.23
136 0.31
137 0.31
138 0.34
139 0.38
140 0.4
141 0.4
142 0.4
143 0.39
144 0.33
145 0.28
146 0.28
147 0.23
148 0.21
149 0.2
150 0.19
151 0.14
152 0.1
153 0.07
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.08
163 0.11
164 0.17
165 0.18
166 0.26
167 0.28
168 0.37
169 0.43
170 0.44
171 0.44
172 0.44
173 0.52
174 0.52
175 0.58
176 0.56
177 0.57
178 0.57
179 0.57
180 0.53
181 0.44
182 0.38
183 0.3
184 0.28
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.15
224 0.17
225 0.18
226 0.21
227 0.22
228 0.2
229 0.21
230 0.21
231 0.23
232 0.26
233 0.29
234 0.31
235 0.3
236 0.3
237 0.33
238 0.32
239 0.28
240 0.24
241 0.21
242 0.18
243 0.19
244 0.18
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.18
254 0.19
255 0.23
256 0.24
257 0.27
258 0.33
259 0.41
260 0.41
261 0.48
262 0.52
263 0.55
264 0.59
265 0.57
266 0.51
267 0.42
268 0.39
269 0.3
270 0.23
271 0.16
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.24
299 0.23
300 0.3
301 0.36
302 0.39
303 0.49
304 0.53
305 0.58
306 0.58
307 0.61
308 0.54
309 0.54
310 0.53
311 0.5
312 0.49
313 0.46
314 0.43
315 0.43
316 0.45
317 0.43
318 0.44
319 0.39
320 0.4
321 0.38
322 0.41
323 0.49
324 0.56
325 0.57
326 0.57
327 0.59
328 0.59
329 0.6
330 0.6
331 0.59
332 0.6
333 0.66
334 0.7
335 0.75
336 0.75
337 0.76
338 0.8
339 0.8
340 0.78
341 0.77