Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3B3J9

Protein Details
Accession M3B3J9    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SANAKGKKRKSGDSVAQPAKHydrophilic
50-72TTVTEKPKDKKAKPELKVKKVVEHydrophilic
270-290GWEKRITREEQRRQSKQEKLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13KGKKRKSG
35-69RPAPAKSALKKSKVETTVTEKPKDKKAKPELKVKK
241-276KGPKGVKNGKVRPRNRIEGSKLRKGTDREGWEKRIT
353-384PKGKAVVEGKISKHKTKAGGEKATGKKQKTKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.5, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_195149  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSANAKGKKRKSGDSVAQPAKKVKTTTTTVKSADRPAPAKSALKKSKVETTVTEKPKDKKAKPELKVKKVVEKMEEVGPVVSDIDEEEDGGAELTADQTADLLAGFSSDESDDGDGDEGVDIANLPAAPTTGGVQKVISKASKQKSDDPENIPGVVYISRLPHGFFEKQLRAYFSQFGTITHLRLARNRKTGKSKHYAFIEFEAASVADIVAKTMDKYLLFGHILQCKRIPAEQVKDEMWKGPKGVKNGKVRPRNRIEGSKLRKGTDREGWEKRITREEQRRQSKQEKLNEFGYDFEMPAVKGVDAVSKQKAVEPANAEASAEQEEGGAKLVEEREKEPVLEETVVATIKSGPKGKAVVEGKISKHKTKAGGEKATGKKQKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.8
4 0.77
5 0.72
6 0.7
7 0.65
8 0.6
9 0.52
10 0.46
11 0.44
12 0.47
13 0.53
14 0.53
15 0.55
16 0.53
17 0.57
18 0.57
19 0.57
20 0.55
21 0.53
22 0.49
23 0.45
24 0.47
25 0.46
26 0.49
27 0.49
28 0.54
29 0.55
30 0.6
31 0.62
32 0.6
33 0.65
34 0.62
35 0.58
36 0.52
37 0.52
38 0.55
39 0.57
40 0.6
41 0.57
42 0.58
43 0.65
44 0.7
45 0.67
46 0.68
47 0.72
48 0.76
49 0.76
50 0.83
51 0.83
52 0.82
53 0.86
54 0.79
55 0.77
56 0.73
57 0.71
58 0.64
59 0.57
60 0.5
61 0.44
62 0.42
63 0.33
64 0.26
65 0.21
66 0.18
67 0.14
68 0.11
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.06
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.24
128 0.3
129 0.37
130 0.38
131 0.45
132 0.5
133 0.57
134 0.6
135 0.56
136 0.55
137 0.49
138 0.46
139 0.38
140 0.29
141 0.23
142 0.16
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.22
154 0.24
155 0.27
156 0.28
157 0.29
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.22
162 0.22
163 0.19
164 0.18
165 0.21
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.18
171 0.23
172 0.3
173 0.3
174 0.38
175 0.41
176 0.45
177 0.52
178 0.57
179 0.6
180 0.61
181 0.58
182 0.55
183 0.55
184 0.52
185 0.44
186 0.39
187 0.34
188 0.25
189 0.21
190 0.16
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.28
220 0.29
221 0.31
222 0.31
223 0.32
224 0.31
225 0.31
226 0.27
227 0.22
228 0.21
229 0.25
230 0.27
231 0.32
232 0.4
233 0.43
234 0.51
235 0.59
236 0.67
237 0.7
238 0.71
239 0.74
240 0.73
241 0.73
242 0.69
243 0.67
244 0.66
245 0.66
246 0.69
247 0.69
248 0.64
249 0.57
250 0.58
251 0.53
252 0.52
253 0.49
254 0.49
255 0.49
256 0.52
257 0.55
258 0.56
259 0.57
260 0.54
261 0.54
262 0.51
263 0.53
264 0.58
265 0.63
266 0.67
267 0.72
268 0.77
269 0.76
270 0.81
271 0.8
272 0.77
273 0.77
274 0.73
275 0.67
276 0.64
277 0.58
278 0.5
279 0.42
280 0.37
281 0.28
282 0.22
283 0.18
284 0.15
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.12
292 0.13
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.23
298 0.29
299 0.27
300 0.3
301 0.3
302 0.31
303 0.32
304 0.32
305 0.29
306 0.23
307 0.22
308 0.19
309 0.15
310 0.12
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.06
317 0.09
318 0.13
319 0.16
320 0.18
321 0.2
322 0.24
323 0.25
324 0.26
325 0.25
326 0.24
327 0.24
328 0.22
329 0.2
330 0.16
331 0.17
332 0.17
333 0.14
334 0.12
335 0.13
336 0.16
337 0.22
338 0.25
339 0.25
340 0.28
341 0.31
342 0.32
343 0.38
344 0.37
345 0.36
346 0.39
347 0.44
348 0.44
349 0.52
350 0.57
351 0.53
352 0.55
353 0.56
354 0.56
355 0.6
356 0.66
357 0.66
358 0.68
359 0.67
360 0.72
361 0.75
362 0.77
363 0.76
364 0.71