Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CQ66

Protein Details
Accession B0CQ66    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-170KAEEEEREKKKKKNEKKLESKAAKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-176KRKLSKAEEEEREKKKKKNEKKLESKAAKAKEQTQKQ
181-188KFAKKSEK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 10.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_187015  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
Amino Acid Sequences MDKTDLETYQVQLSQVELALSTDPSNAELASLRSQLKELIELSQEALALVEAASSSKSDNRKAAISTPSHTWSAGDECLAKYSGDGAWYPARITSIGGAAENRVYSIMFKGYNTTELVKASEIKPLPPNYANVTPSSSNKRKLSKAEEEEREKKKKKNEKKLESKAAKAKEQTQKQATWQKFAKKSEKKGVHIAGVSGTSIFKTPDNPLGKVGVTGSGKGMTEVASKSKHKFDVQDDEAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.14
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.19
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.04
38 0.03
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.06
43 0.11
44 0.15
45 0.19
46 0.22
47 0.24
48 0.26
49 0.28
50 0.32
51 0.33
52 0.32
53 0.3
54 0.31
55 0.32
56 0.3
57 0.28
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.09
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.15
109 0.13
110 0.14
111 0.19
112 0.19
113 0.22
114 0.21
115 0.23
116 0.22
117 0.26
118 0.25
119 0.21
120 0.23
121 0.21
122 0.23
123 0.3
124 0.3
125 0.34
126 0.38
127 0.42
128 0.44
129 0.49
130 0.53
131 0.54
132 0.57
133 0.59
134 0.61
135 0.64
136 0.68
137 0.69
138 0.71
139 0.67
140 0.65
141 0.67
142 0.71
143 0.73
144 0.76
145 0.8
146 0.81
147 0.87
148 0.92
149 0.92
150 0.86
151 0.82
152 0.79
153 0.72
154 0.66
155 0.58
156 0.57
157 0.55
158 0.57
159 0.59
160 0.56
161 0.53
162 0.56
163 0.63
164 0.55
165 0.53
166 0.52
167 0.53
168 0.55
169 0.61
170 0.64
171 0.64
172 0.71
173 0.74
174 0.76
175 0.71
176 0.73
177 0.69
178 0.62
179 0.54
180 0.46
181 0.36
182 0.29
183 0.24
184 0.16
185 0.13
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.15
192 0.23
193 0.27
194 0.28
195 0.29
196 0.3
197 0.3
198 0.27
199 0.25
200 0.22
201 0.19
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.11
209 0.14
210 0.15
211 0.19
212 0.23
213 0.27
214 0.31
215 0.38
216 0.42
217 0.44
218 0.49
219 0.52
220 0.56